课题基金 / 基金详情

クラスリン小胞輸送に関与する蛋白質群の蛋白質-蛋白質相互作用の構造学的解析

クラスリン小胞輸送に関与する蛋白質群の蛋白質-蛋白質相互作用の構造学的解析
参与网格蛋白囊泡运输的蛋白质的蛋白质-蛋白质相互作用的结构分析
批准号:
18770136
负责人:
上久保 裕生
金额:
$2.3万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究では,ゴルジ体において積み荷蛋白質を認識し選別しているマルチドメイン蛋白質(GGA)に注目しその機能解明を目的として、X線溶液散乱測定法を用い、ドメイン配置構造や相互作用蛋白質結合時のドメイン配置構造変化を解析したきた。ドメイン間や、マルチドメイン-相互作用蛋白質間の相互作用は一般に弱く、解離定数は数M〜数100MM程度の値を示す。このような弱い相互作用で関連づけられた複合体の溶液構造を解析するために、新たに滴定X線溶液散乱測定法を考案してきた。その結果、GGA1蛋白質に低分子量G蛋白質が結合することによって、ドメイン配置構造に変化が生じ、各ドメインの露出表面が変化することを明らかにしてきた。この形態変化から、ドメイン配置構造変化によって、標的蛋白質との親和性が、調節されていることが示唆された。実際、このドメイン再配置によって、他のドメインの相互作用蛋白質(積み荷蛋白質受容体)に対する結合親和性に変化が見られることが、滴定X線溶液散乱によって明らかにされた。これは、ドメイン再配置を介した、標的蛋白質結合調節機構を直接推測した最初の研究結果である。更に、GGAの他のホモログについても同様に、ドメイン配置構造を解析した結果、GGA1が溶液中で単量体として存在しているのに対し、GGA3は、GGA1単量体構造を基本構造単位とした2量体として存在していることが明らかとなった。更に、低分子量G蛋白質存在下での溶液構造を解析したところ、GGA3の2量体は解離し、GGA1・低分子量G蛋白質複合体と同様の形態を示すことが明らかとなった。これまでの報告によると、GGA1とGGA3は、非常に類似したドメインからなるにもかかわらず、輸送に対する役割が異なっていることが示唆されている。特に、GGA1は、単独でクラスリン被覆小胞輸送するのではなく、他のアダプター蛋白質と共役して初めて被覆小胞を輸送できるようになる可能性が示唆されている。現在は、会合体型性能の違いが、単独でのクラスリン被覆小胞形成能に関与しているのではないかと考え、引き続き研究を進めている。
英文摘要
本研究では,ゴルジ体において積み荷蛋白質を認識し選別しているマルチドメイン蛋白質(GGA)に注目しその機能解明を目的として、X線溶液散乱測定法を用い、ドメイン配置構造や相互作用蛋白質結合時のドメイン配置構造変化を解析したきた。ドメイン間や、マルチドメイン-相互作用蛋白質間の相互作用は一般に弱く、解離定数は数M〜数100MM程度の値を示す。このような弱い相互作用で関連づけられた複合体の溶液構造を解析するために、新たに滴定X線溶液散乱測定法を考案してきた。その結果、GGA1蛋白質に低分子量G蛋白質が結合することによって、ドメイン配置構造に変化が生じ、各ドメインの露出表面が変化することを明らかにしてきた。この形態変化から、ドメイン配置構造変化によって、標的蛋白質との親和性が、調節されていることが示唆された。実際、このドメイン再配置によって、他のドメインの相互作用蛋白質(積み荷蛋白質受容体)に対する結合親和性に変化が見られることが、滴定X線溶液散乱によって明らかにされた。これは、ドメイン再配置を介した、標的蛋白質結合調節機構を直接推測した最初の研究結果である。更に、GGAの他のホモログについても同様に、ドメイン配置構造を解析した結果、GGA1が溶液中で単量体として存在しているのに対し、GGA3は、GGA1単量体構造を基本構造単位とした2量体として存在していることが明らかとなった。更に、低分子量G蛋白質存在下での溶液構造を解析したところ、GGA3の2量体は解離し、GGA1・低分子量G蛋白質複合体と同様の形態を示すことが明らかとなった。これまでの報告によると、GGA1とGGA3は、非常に類似したドメインからなるにもかかわらず、輸送に対する役割が異なっていることが示唆されている。特に、GGA1は、単独でクラスリン被覆小胞輸送するのではなく、他のアダプター蛋白質と共役して初めて被覆小胞を輸送できるようになる可能性が示唆されている。現在は、会合体型性能の違いが、単独でのクラスリン被覆小胞形成能に関与しているのではないかと考え、引き続き研究を進めている。
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会议论文
Rhodobacter capsulatus PYPの分光学的特性の解析
荚膜红杆菌PYP的光谱特性分析
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [山崎洋一, 上久保裕生, 今元泰, 片岡幹雄]
通讯作者: 片岡幹雄
Structure of Rab27b small GTPase shows an unexpected swapped dimmer
Rab27b 小 GTPase 的结构显示出意外的交换二聚体
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: Acta Cryst. D 63
影响因子: --
作者: [L. Chavas, S. Torii, H. Kamikubo, M. Kawasaki, K. Ihara, R. Kato, M. Kataoka, T. Izumi, S. Wakatsuki]
通讯作者: S. Wakatsuki
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [鬼塚正義, 上久保裕生, 山崎洋一, 片岡幹雄]
通讯作者: 片岡幹雄
網羅的アラニン挿入変異法によるジヒドロ葉酸還元酵素の構造形成および機能発現領域の抽出
二氢叶酸还原酶的结构形成及穷举丙氨酸插入诱变法提取功能表达区
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [芝るみ, 上久保裕生, 梅山美香, 山崎洋一, 巌倉正寛, 片岡幹雄]
通讯作者: 片岡幹雄
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    Kaiシステムの自律振動過程で生じるKaiC-KaiA/KaiB結合モードの時間依存的変調
    • 批准号:
      23K27141
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $7.57万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      上久保 裕生
    • 依托单位:
    Time-Dependent Modulation of KaiC-KaiA/KaiB Binding Modes in the Autonomous Oscillation Process of the Kai System
    • 批准号:
      23H02448
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $12.06万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      上久保 裕生
    • 依托单位:
    蛋白質表面に分布する水和水クラスターのダイナミクス
    • 批准号:
      14740248
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $2.18万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      上久保 裕生
    • 依托单位:
    マイクロ秒領域での蛋白質の動的構造変化の解明
    海外基金