情報伝達に関わる蛋白質の溶液構造の動態 -X線溶液散乱による研究
情報伝達に関わる蛋白質の溶液構造の動態 -X線溶液散乱による研究
批准号:
10179208
负责人:
片岡 幹雄
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 --
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英文摘要
PYPは紅色光合成細菌の光走性の光受容体である。ロドプシンなど多くの光受容体が膜蛋白質であるのに対し、PYPは水溶性であるという特徴を持っている。我々はPYPによる光情報変換の分子機構を理解するために、光吸収に伴うPYPの構造変化の検出、PYPの標的蛋白質の同定と精製を目的として研究を行った。PYPの暗黒下及び光照射中でのX線溶液散乱実験を行った。その結果、PYPは光吸収により慣性半径が2A程度増加することが明らかになった。この事実は、PYPの光反応中間体において、蛋白質全体にわたる構造変化があることを示唆する。PYPの標的蛋白質は現在同定されていない。我々は既にPYP遺伝子の上流に高度好塩菌のsRのトランスデューサーに類似した配列があることを見出している。しかし、これがPYPの標的蛋白質であるかどうか検証できないため、光照射によりPYPに特異的に結合する蛋白質を検出することを試みた。この目的のためにPYP力ラムを調整し、長寿命のM中間体ができるpH領域で、光照射の有無により、溶出パターンを調べた。その結果、光照射により特異的にカラムに結合する両分を得ることができた。標的蛋白質の候補と考え、現在、さらに精製を進めている。細胞内情報伝達に重要な役割を果たすGrb2のX線溶液散乱実験を行った。Grb2の散乱データから得られた距離分布関数は、結晶構造に基づき計算した距離分布関数とは一致していない。最大長や慣性半径も観測値の方が、計算値よりもかなり大きい。これらの結果は、二つのSH3ドメイン間の距離が、結晶中よりも溶液中で広がっていることが示唆される。現在、溶液散乱データを説明できる溶液構造モデルを構築中である。
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Toshihiko Oka: "Conformational change of helix G in the bacteriorhodopsin photocycle:" Biophysical Journal. 76. 1018-1023 (1999)
Toshihiko Oka:“细菌视紫红质光循环中螺旋 G 的构象变化:”生物物理学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Yuji O.Kamatari: "The compact and expanded denatured conformations of apomyoglobin in methanol-water solvent" Protein Science. (印刷中). (1999)
Yuji O.Kamatari:“甲醇-水溶剂中的脱肌红蛋白的紧凑和扩展变性构象”蛋白质科学(1999 年)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Haik Chosrowjan: "Environmental effects on the femtosecond-picosecond fluorescence dynamics of photoactive yellow protein"Journal of Physical Chemistry B. 102. 7695-7698 (1998)
Haik Chosrowjan:“环境对光活性黄色蛋白的飞秒-皮秒荧光动力学的影响”物理化学杂志 B. 102. 7695-7698 (1998)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Norio Hamada: "The analysis of light-induced conformational change of photoactivie protein" Photomedicine and Photobiology. (印刷中). (1999)
Norio Hamada:“光敏蛋白构象变化的分析”《光医学和光生物学》(出版中)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Jeremy C. Smith: "Motions in native and denatured proteins"Physica B. 241-243. 1110-1114 (1998)
Jeremy C. Smith:“天然和变性蛋白质的运动”Physica B. 241-243。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 9 条
蛋白質内水素結合ネットワークの直接観測
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批准号:20050020
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2008
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
機能性タンパク質の動力学と折り畳み
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批准号:15076208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$48.0万
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财政年份:2003
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
光情報伝達の分子的基礎
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批准号:99F00766
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.9万
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财政年份:2000
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
X線溶液散乱による情報伝達に関わる蛋白質の溶液構造の動態の研究
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批准号:11160212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1999
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
広い時間領域にわたる蛋白質ダイナミクスの測定
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批准号:09878144
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
蛋白質非天然状態の構造とダイナミクス
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批准号:08272216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1996
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
蛋白質非天然状態の構造とダイナミクス
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批准号:08272216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1996
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
蛋白質非天然状態の構造とダイナミクス
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批准号:07280215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1995
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
低温X線溶液散乱法による蛋白質の静的および動的構造研究
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批准号:61780072
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1986
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
分子修飾法を用いたバクテリオロドプシンのX線回折的研究
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批准号:59780274
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1984
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
バクテリオロドプシンのin vivoおよびin vitroでの結晶化機構の研究
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批准号:57780237
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1982
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负责人:片岡 幹雄
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依托单位:
海外基金