情報伝達に関わる蛋白質の溶液構造の動態 -X線溶液散乱による研究

参与信息传递的蛋白质的溶液结构动力学 - 利用 X 射线溶液散射进行研究

• 批准号: 10179208
• 负责人: 片岡 幹雄
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10179208/
• 关键词: Photoactive Yellow Protein; 光構造変化; X線溶液散乱; Grb 2; 分子間情報伝達

PYPは紅色光合成細菌の光走性の光受容体である。ロドプシンなど多くの光受容体が膜蛋白質であるのに対し、PYPは水溶性であるという特徴を持っている。我々はPYPによる光情報変換の分子機構を理解するために、光吸収に伴うPYPの構造変化の検出、PYPの標的蛋白質の同定と精製を目的として研究を行った。PYPの暗黒下及び光照射中でのX線溶液散乱実験を行った。その結果、PYPは光吸収により慣性半径が2A程度増加することが明らかになった。この事実は、PYPの光反応中間体において、蛋白質全体にわたる構造変化があることを示唆する。PYPの標的蛋白質は現在同定されていない。我々は既にPYP遺伝子の上流に高度好塩菌のsRのトランスデューサーに類似した配列があることを見出している。しかし、これがPYPの標的蛋白質であるかどうか検証できないため、光照射によりPYPに特異的に結合する蛋白質を検出することを試みた。この目的のためにPYP力ラムを調整し、長寿命のM中間体ができるpH領域で、光照射の有無により、溶出パターンを調べた。その結果、光照射により特異的にカラムに結合する両分を得ることができた。標的蛋白質の候補と考え、現在、さらに精製を進めている。細胞内情報伝達に重要な役割を果たすGrb2のX線溶液散乱実験を行った。Grb2の散乱データから得られた距離分布関数は、結晶構造に基づき計算した距離分布関数とは一致していない。最大長や慣性半径も観測値の方が、計算値よりもかなり大きい。これらの結果は、二つのSH3ドメイン間の距離が、結晶中よりも溶液中で広がっていることが示唆される。現在、溶液散乱データを説明できる溶液構造モデルを構築中である。

PYP chromophotogenic bacteria light-walking photoreceptors. The membrane protein of photoreceptor, the membrane protein of photoreceptor, the soluble protein of PYP, the soluble protein of photoreceptor, the soluble protein of photoreceptor, the membrane protein of photoreceptor. We understand that the molecular mechanism of PYP is sensitive to light absorption, light absorption and PYP production, and the protein content of PYP is the same as that of the protein. The X-ray solution was scattered in the dark and light exposure of PYP. The results show that the PYP absorbance is sensitive to the sexual radius of 2A and the temperature is very sensitive to the temperature. In the light reaction of PYP, the whole body and protein are used to improve the quality of the system. The protein content of PYP protein is now the same as that of other proteins. I am afraid that the high level of bacteria on the PYP sub-system is good. The type of bacteria is similar to that of the configuration. The combination of protein and protein of PYP was detected by light irradiation. The combination of protein and protein of PYP was tested. The purpose of this study is to determine the effect of PYP force on the field of pH, long life span, light exposure, and dissolution. According to the results of the results and the combination of the results of light irradiation and the results of the combination of the results and the results of the results, the results of the results and the results of the combination of the results and the results of light irradiation were obtained. The protein waiting for examination, the present, the quality of the protein will be improved. The information inside the cell is very important. The result is that the solution of Grb2 X-line is scattered. The data of Grb2 scatter distribution is consistent with that of the calculation of the distance distribution. The maximum length of the radius of sex is measured and calculated. The result of the test, the difference of the distance between the two parts of the SH3, and the temperature in the solution of the solution in the crystal indicate that you are instigating it. At present, the solution is scattered, and the solution is in the process of making the solution.

项目成果

Toshihiko Oka: "Conformational change of helix G in the bacteriorhodopsin photocycle:" Biophysical Journal. 76. 1018-1023 (1999)

Toshihiko Oka：“细菌视紫红质光循环中螺旋 G 的构象变化：”生物物理学杂志。

Yuji O.Kamatari: "The compact and expanded denatured conformations of apomyoglobin in methanol-water solvent" Protein Science. (印刷中). (1999)

Yuji O.Kamatari：“甲醇-水溶剂中的脱肌红蛋白的紧凑和扩展变性构象”蛋白质科学（1999 年）。

Haik Chosrowjan: "Environmental effects on the femtosecond-picosecond fluorescence dynamics of photoactive yellow protein"Journal of Physical Chemistry B. 102. 7695-7698 (1998)

Haik Chosrowjan：“环境对光活性黄色蛋白的飞秒-皮秒荧光动力学的影响”物理化学杂志 B. 102. 7695-7698 (1998)

Norio Hamada: "The analysis of light-induced conformational change of photoactivie protein" Photomedicine and Photobiology. (印刷中). (1999)

Norio Hamada：“光敏蛋白构象变化的分析”《光医学和光生物学》（出版中）。

Jeremy C. Smith: "Motions in native and denatured proteins"Physica B. 241-243. 1110-1114 (1998)

Jeremy C. Smith：“天然和变性蛋白质的运动”Physica B. 241-243。