ダイズにおける逆遺伝学的突然変異集団作成のためのトランスポゾン因子の網羅的探索

全面寻找用于大豆反向基因突变群体创建的转座子因子

基本信息

  • 批准号:
    18780003
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.3万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份:
    2006
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2006 至 2007
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

遺伝子解析材料の提供や品種の分化・同定マーカーとしてトランスポゾン因子の利用は有効である.そこで本研究では,ダイズのmariner配列の1つであるSoymar1を分子マーカーとして用い,おもに日本の在来もしくは育成品種の遺伝的多様性,遺伝的関係を評価するとともに,新たなmariner因子を獲得し,転移能について推考することを目的としてmariner様配列のスクリーニングを行った.1)日本の在来・育成品種を中心に126のダイズ品種・系統を供試してサザン解析を行い,クラスター分析による品種分類を試みたところ、地域(日本・中国・アメリカ)ごとにある程度クラスターの偏りが見られたことから,ダイズの遺伝的背景はその品種が由来する地域によって異なるのではないかと思われた。特に日本の品種は幅広く分布しており,わが国の品種は遺伝的多様性に富んでおり、他国で問題になっているような育成品種における遺伝的多様性の消失といった状況は起こってないことが示唆された.2)ダイズ品種ペキンのゲノムλファージライブラリーを作成し、mariner様配列をプラークハイブリダイゼーション法によりスクリーニングしたところ、mariner様配列を含むファージクローンが40個得られた.これらクローンの塩基配列を決定しダイズゲノムにおけるmariner様配列の多様性を調べるとともに転移能について調べているが、今のところ、多様性が乏しく、また転移能をもつ配列も見つかっていない.今後は、より検出能の高いトランスポゾンディスプレイ法による転移能の調査を進めるとともに、copiaやgypsy等の他のトランスポゾン様配列について同様の手法にて検討していく.
提供遗传分析材料并使用转座子因子作为分化和品种鉴定的标志物是有效的。 Therefore, in this study, Soymar1, one of the mariner sequences of soybeans, was used as a molecular marker to evaluate the genetic diversity and genetic relationships of native or grown Japanese cultivars, and screening mariner-like sequences with the aim of acquiring new mariner factors and inferring their metastatic potential.1) We conducted Southern analysis of 126 soybean varieties and lines, mainly in Japan, and attempted to classify the variety using聚类分析。由于每个地区(日本,中国和美国)都有一定程度的群集偏见,因此人们认为大豆的遗传背景有所不同,具体取决于品种起源的区域。特别是,日本的品种被广泛分布,日本的品种富含遗传多样性,表明在繁殖品种中遗传多样性在其他国家中已成为问题的情况。确定了这些克隆的碱基序列,并研究了大豆基因组中水手样序列的多样性,并研究了转移电位。随着未来,将使用同样的方法研究Transposon显示方法的转移方法,以及其他类似pososon的转移序列。

项目成果

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    $ 2.3万
  • 项目类别:
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