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ダイズの着生根粒菌種を制御するQTLの同定と農業形質への影響

控制大豆附生根瘤菌种类的QTL鉴定及其对农艺性状的影响

基本信息

批准号：
22K05571
负责人：
寺石政義
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K05571/
关键词：
ダイズ根粒菌

项目摘要

ダイズ染色体18番に検出された、着生根粒菌種比率に関わるＱＴＬのファインマッピングを行い、240kbの染色体領域に絞り込むことができた。ダイズゲノムに関するデータベースと照合すると、この染色体領域には30個の遺伝子が座乗していることが推定され、遺伝子のannotation情報から、Rj遺伝子群を含む既報の根粒関連遺伝子ならびにホモログは存在しないことから新規の根粒関連遺伝子であることが示唆された。更なるファインマッピングによる絞り込みは実施困難であり、次年度は、RNA-seq等の遺伝子発現を調査することによって、原因遺伝子の絞り込みを行う予定である。ロングアンプリコンを解析できるシーケンサーが利用可能となったので、5.2kbpのロングアンプリコンと従来の400bpアンプリコンとの解析を比較した。5.2Kbpのロングアンプリコン解析では、ITS領域を挟むrRNA配列内の保存された領域にプライマーを設計した。400bpのショートアンプリコン解析では、ITS領域内の保存された領域にプライマーを設計した。400bpアンプリコンにおいては根粒菌の系統が把握できたのに対し、5.2kbpロングアンプリコンにおいては更に詳細な情報を得ることができて高度な系統の把握が可能であることが示唆された。農研機構が提供するコアコレクションを栽培し、播種4週間後に掘り起こして根粒菌を採取した。染色体18番のQTL領域を含む準同質遺伝子系統の作出を目指して、ＲＩＬ（組換え近交系）に親品種を戻し交雑した。次年度は農業形質について調査する予定である。

荧光染料18个碱基序列中，以生粒菌比例最高的QTL为标记，240kb荧光染料区域的标记要求进行筛选。Rj是一个由一个新的色素色素体区域组成的色素体区域，30个色素体区域的色素体区域更准确地说，这是一个非常复杂的问题，因为它是一个非常复杂的问题，因为它是一个非常复杂的问题。人工神经网络的神经网络解译分析是利用人工神经网络的优势，利用可供选择的神经网络解译，5.2kbp的神经网络解译算法能够解出400bp的神经网络解译比。5.2Kbp的核糖核酸序列特异性解译，ITS区域间rRNA配位序列特异性保存在核糖核酸区域内。400bp的DNA片段被测序，ITS序列内保存有一个完整的DNA区域，该区域的DNA片段被测序。400bp的引物扩增的引物，5.2kbp的引物扩增的農研機構が提供するコアコレクションを栽培し、播種4週間後に掘り起こして根粒菌を採取した。RIL（水稻杂交近系）是一种利用水稻18个QTL区域内含有水稻同系杂交产生的杂交种。次年度は農業形質について調査する予定である。