ゲノム解析によるカンキツグリーニング病原細菌と宿主相互作用の解明
通过基因组分析阐明柑橘绿化病原菌和宿主的相互作用
基本信息
- 批准号:18780033
- 负责人:
- 金额:$ 2.18万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2006
- 资助国家:日本
- 起止时间:2006 至 2007
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
昨年までに,カンキツグリーニング病を罹病させたニチニチソウの主脈を用いて、Cα. L. asiaticusの濃縮画分からの抽出DNAを用い,ゲノムDNA増幅キットによってゲノムDNAの増幅の後,プラスミドベクターにショットガンクローニングして塩基配列決定を行った。今年度は本クローニング手法を繰り返し実行し,その結果,第1段階スクリーニングによってα-プロテオバクテリア由来の配列に分類されるクローンを選抜し,さらにPCRによる第2段階スクリーニングを行って陽性クローンについては全塩基配列を改めて決定した。これらの陽性クローンの塩基配列情報を元に疎水性領域をもつものを探索したが,膜タンパク質のようにトランスメンブレンドメイン(疎水性領域と親水性領域が咬互に存在する)を持つものは見つからなかった。またドメインデータベースに対して検索を行ったところ、細胞外にSecシステムやABCトランスポーターによって輸送されるようなシグナルドメインをもつものも存在しなかった。しかし細胞外からの熱・浸透圧・イオン濃度などの刺激を受容して遺伝子発現制御を行うシグナル伝達系である二成分制御系因子の受容体であるSensor Kinase候補が存在したため,今後は全長配列の決定に向けてTail-PCR法やGenomic Walker Kitなどによる隣接領域の取得を試み、さらにペアとなるReceiver Domainの候補遺伝子の探索に取り組む。
Last year, I didn't know if I was sick. I didn't know if I was sick. I didn't know if I was sick. L. asiaticus drawing, DNA, drawing, drawing, This year, the results of this year's practice show that the results show that the first paragraph of this year has been completed. The first paragraph is about the origin of the classification. This is the reason for the classification. This is not the case. In the second paragraph of the PCR, there is a decision to change the overall basis of the allocation. In the field of water, there is a lot of research in the field of water. I don't know what to do with each other in the field of water. I don't know, I don't know, I don't know. The extraneous Sec, the ABC, the cable, the line, the extracellular unit, the ABC, the cable, the cell, the cable, the extracellular device, the cable, the extracellular cable, the extracellular device, the cable, the extracellular cable, the extracellular cell, the cable, the extracellular cell, the cable, the The two-component imperial factor of the two-component system, the receptive body, the Sensor Kinase candidate, the receptor, the receptacle, the receptor, the receptacle, the tolerance, the tolerance, the body, the body. In the future, the full-length allocation column has decided to obtain information in the field of the Tail-PCR method, and to obtain information on the Receiver Domain waiting for the exploration of the system.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Apple aminopropyl transferase, MdACL5 interacts with putative elongation factor 1-a and S-adenosylmethionine synthase.
苹果氨丙基转移酶 MdACL5 与推定的延伸因子 1-a 和 S-腺苷甲硫氨酸合酶相互作用。
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:He;L.;Ban;Y.;Miyata;S.;Kitashiba;H. and Moriguchi;T.
- 通讯作者:T.
カンキツグリーニング病原細菌日本株のファージ様DNAポリメラーゼ遺伝子領域の解析
柑橘黄龙病病原菌日本株噬菌体样DNA聚合酶基因区分析
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:He;L.;Ban;Y.;Miyata;S.;Kitashiba;H. and Moriguchi;T.;岩波徹・冨村健太・古屋典子・宮田伸一・濱島朗子・烏越博明・村山裕子・河野伸二・奥田充
- 通讯作者:岩波徹・冨村健太・古屋典子・宮田伸一・濱島朗子・烏越博明・村山裕子・河野伸二・奥田充
Molecular and serological characterization of cucumber mottle virus, a new cucurbit-infecting Tobamo-like virus.
黄瓜斑驳病毒(一种新的感染葫芦的多巴莫样病毒)的分子和血清学特征。
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Orita;H.;Sakai;J.;Kubota;K.;Okuda;M.;Tanaka;Y.;Hanada;K.;Imamura;Y.;Nishiguchi;M.;Karasev;A.;Miyata;S. and Iwanami;T.
- 通讯作者:T.
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宮田 伸一其他文献
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- 资助金额:
$ 2.18万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)