肝炎・肝硬変・肝癌における免疫担当細胞のmicroRNAomeによる病態生理解明

利用免疫活性细胞的 microRNAome 阐明肝炎、肝硬化和肝癌的病理生理学

• 批准号: 07J00879
• 负责人: 水口 義昭
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: Nippon Medical School
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-07J00879/
• 关键词: microRNA; 肝癌; 転写; 上皮間葉移行; 遺伝子; micro RNA

申請者は研究計画に従いmiRNAのcloningを施行した。特にHBV陽性Hepatocellular carcinoma(HCC)症例における肝癌とその周囲の肝組織よりのmiRNA sequencingとその発現頻度により臨床的患者の推移が予測できるかに着目し実験を始めた。clustering解析結果により、HCCと周囲肝組織におけるプロファイルにより多くのmiRNAの発現に統計的異差を認めており、特に肝組織に豊富に発現しているmiR-21のHCCにおける発現低下とapoptosisに関連しているmiR-21のHCCにおける発現増大は多くの症例にも認められており、疾患特異的変化の可能性が高く、研究の進行により病態生理の解明や新たな治療法の確立に至る可能性があると考えられる。これらの肝癌組織特異的miRNAを臨床統計学的手法を用いて解析したところmiR-21が有意に肝癌外科手術後の再発率と強く相関することを見出した。また、454sequencerを用いた大量cloningにおいて肝癌、非癌部よりそれぞれ30万以上のmiRNAを同定した。得られた結果のうち、新規miRNAの可能性があると考えられるものを選定しそのpre-miRNAの構造をコンピューター予測した。その結果約250種類の新規miRNAを同定した。また、既存のmiRNAに関してもpre-miRNAの反対側にも多くのmiRNAがcodeされていることが見出した。新規のmiRNAの候補の内特に可能性の高いものをバイオインフォマテックスを用いて10個選択し、それらの発現を別の手法(PCRを用いた)にて再確認することで、新規miRNAを同定するにいたった。また、これらの機能解析を実施中である。

The applicant shall perform miRNA cloning in the research project. In particular, HBV-positive Hepatocellular carcinoma(HCC) cases include liver cancer, peripheral liver tissue, miRNA sequencing, frequency of occurrence, progression of clinical patients, and prediction. clustering analysis results: statistical differences in the occurrence of miRNAs in HCC and peripheral liver tissue; high probability of disease-specific transformation; high probability of rich miRNA in HCC and lower miRNA in HCC and apoptosis; high probability of increased miRNA in HCC and peripheral liver tissue; high probability of disease-specific transformation; high probability of abnormal miRNA in HCC and peripheral liver tissue; high probability of abnormal miRNA in HCC and peripheral liver tissue; high probability of abnormal miRNA in HCC and peripheral liver tissue. The study was carried out to clarify the pathophysiology and establish new therapies. The analysis of miRNA in liver cancer tissue showed that miRNA-21 was associated with the recurrence rate after liver cancer surgery. 454 sequencers are used to clone more than 300,000 miRNAs in liver cancer and non-cancer regions. The result of the study is that the miRNA is likely to be selected. About 250 new miRNAs were identified as a result. The miRNA code was found to be related to pre-miRNA and anti-miRNA. The new miRNA candidate has a high probability of being identified by 10 different methods (PCR). The function analysis of