メダカ主要組織適合性抗原複合体領域の種内多型解析及び進化機構の解明

青鳉主要组织相容性抗原复合物区种内多态性分析及进化机制阐明

• 批准号: 07J01392
• 负责人: 塚本 健太郎
• 金额: $ 1.15万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-07J01392/
• 关键词: 主要組織適合性抗原複合体; 免疫プロテアソームサブユニット; メダカ; 佳化生物学; 比較免疫学; 主要組織適合性抗原複合体(MHC); メダカOryzias latipes

ニホンメダカOryzias latipesの主要組織適合性抗原複合体領域(MHC)の進化過程を明らかにするため、脊椎動物MHCの基本構造はクラスI抗原提示に関わる機能関連遺伝子の二型性に基づくものであると仮説を立て、クラスI抗原提示に関与するMHCクラスIA遺伝子(UAAとUBA)と免疫プロテアソームサブユニット遺伝子(PSMB8とPSMB10)のメダカ野生集団を用いた多型解析を行った。方法としてニホンメダカ野生集団(10地点、合計1245個体)について、PSMB10、PSMB8及びMHCクラスIA遺伝子(UAAとUBA)にそれぞれ特異的なプライマーを設計しPCRを行い塩基配列を決定した。この結果、PSMB10とPSMB8はハプロタイプを形成して二型性(N型ハプロタイプとd型ハプロタイプ)を示すことが明らかとなった。一方、UAAとUBAの抗原ペプチドと結合するα1とα2ドメインをコードするエクソンは多型を示し、明確な二型性は認められなかった。以上より、哺乳類MHCとは異なりメダカMHCにおいては、PSMB8とPSMB10を含む領域の二型性と、MHCクラスIA遺伝子の多型性の組み合わせにより、抗原提示の多様性を保証していると考えられる。また、ニホンメダカで明らかとなったPSMB10とPSMB8の二型性の起源を明らかにするため、メダカ近縁種である3種、O.celebensis、O.matanensis及びO.marmoratusの野生個体(合計400個体)について両遺伝子の多型解析を行った。解析の結果、解析した全ての種においてもPSMB10とPSMB8の二型性が認められた。以上の結果は、PSMB8/PSMB10の二型性の起源はメダカ属内での種分化に先行し、平衡選択により各集団で少なくとも3千万年もの間維持されてきたことが示された。

Youdaoplaceholder0 メダカOryzias Latipes の main organization fit antigen complex fields (MHC) の evolution を Ming ら か に す る た め, vertebrate MHC の basic construction は ク ラ ス I antigen prompt に masato わ る function masato even heritage 伝 son の type 2 に subgrade づ く も の で あ る と 仮 said を て, ク ラ ス antigen I tip に masato and す る MHC ク ラ ス IA heritage 伝 child (U AA と UBA) と immune プ ロ テ ア ソ ー ム サ ブ ユ ニ ッ ト heritage 伝 child (PSMB8 と PSMB10) の メ ダ カ wild set 団 を with い た polymorphism analytical line を っ た. Methods と し て ニ ホ ン メ ダ カ wild set 団 (10 sites, total 1245 individuals) に つ い て, PSMB10, PSMB8 and び MHC ク ラ ス IA heritage 伝 child (UAA と UBA) に そ れ ぞ れ specific な プ ラ イ マ ー を line design し PCR を い salt base with column を decided し た. こ の results, PSMB10 と PSMB8 は ハ プ ロ タ イ プ を form し て type 2 sex (n-type ハ プ ロ タ イ プ と type d ハ プ ロ タ イ プ) を shown す こ と が Ming ら か と な っ た. Side, UAA と UBA の antigen ペ プ チ ド と combining す る alpha 1 と alpha 2 ド メ イ ン を コ ー ド す る エ ク ソ ン は polymorphism を し, clear な type 2 sex は recognize め ら れ な か っ た. Above よ り, mammalian MHC と は different な り メ ダ カ MHC に お い て は, PSMB8 と PSMB10 を の containing む field type 2 と, MHC ク ラ ス IA posthumous son 伝 の polytypism の group み close わ せ に よ り, antigen tip の others more を guarantee し て い る と exam え ら れ る. ま た, ニ ホ ン メ ダ カ で Ming ら か と な っ た PSMB10 と PSMB8 の type 2 の origin を Ming ら か に す る た め, メ ダ カ about try species で あ る three, o. chua elebensis, O.m atanensis and び O.m armoratus の wild individual (total 400 individuals) に つ い て struck 伝 son の Polymorphism analysis を line った. Analyze the <s:1> results, analyze the <s:1> た all て <s:1> species にお て て <s:1> PSMB10とPSMB8 dimorphism が recognition められた. Above の results は, PSMB8 / PSMB10 の type 2 の origin は メ ダ カ within the genus で の differentiation of に first し, balance sentaku に よ り each set 団 で less な く と も 30 million も の between maintaining さ れ て き た こ と が shown さ れ た.

项目成果

メダカ免疫プロテアソームサブユニット遺伝子及びMHCクラス1遺伝子の種内多型解析

青鳉免疫蛋白酶体亚基基因和MHC 1类基因的种内多态性分析

• 发表时间: 2007
• 作者: Kentaro Tsukamoto;塚本健太郎;塚本 健太郎,野中 勝
• 通讯作者: 塚本 健太郎,野中 勝

Dichotomous haplotypic lineages of the immunoproteasome subunit genes, PSMB8 and PSMB10, in the MHC class I region of a teleost medaka, Oryzias latipes

硬骨鱼青鳉 MHC I 类区域中免疫蛋白酶体亚基基因 PSMB8 和 PSMB10 的二分单倍型谱系

• 发表时间: 2009
• 期刊: Mol Biol Evol 26
• 作者: Tsukamoto K;et.al.
• 通讯作者: et.al.

メダカ属における免疫プロテアソームサブユニット遺伝子の二型性

青鳉属免疫蛋白酶体亚基基因的二态性

• 发表时间: 2008
• 作者: 漆原秀子;桑山秀一;鹿児島浩;新井理;大石加寿子;伊藤武彦;谷口丈晃;内今日子;黒木陽子;小原雄治;藤山秋佐夫;塚本健太郎
• 通讯作者: 塚本健太郎