ゲノム情報を利用した放線菌の形態分化、二次代謝に関する遺伝子群の統括的解析

利用基因组信息综合分析放线菌形态分化和次生代谢相关基因组

• 批准号: 07J02253
• 负责人: 平野 節
• 金额: $ 1.73万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-07J02253/
• 关键词: Streptomyces; A-factor; AdpA; AdsA; BldM; WhiB; Stretomyces griseus; 形態分化; strR

気中菌糸形成を制御するAdsAの標的遺伝子に関する解析AdpAの標的遺伝子として同定されたadsAはECFシグマ因子をコードしており、遺伝子破壊株の表現型解析から気中菌糸形成に必須であることがわかっている。そこで気中菌糸形成に関与する遺伝子群を明らかにするため、AdsAによって転写される標的遺伝子を探索した。はじめに野生株とadsA破壊株との転写比較をDNAマイクロアレイとS1マッピング法により行い、AdsAに依存した転写パターンを示す遺伝子を探索した。次に大腸菌で発現、精製したAdsAを用いてin vitro転写を行ったところ、二成分制御系の応答制御因子をコードするbldMがAdsAの標的遺伝子として同定された。bldM遺伝子破壊株は気中菌糸を形成することができず一見adsA破壊株と同様の表現型を示したが、adsA破壊株にbldMを強制発現してもadsA破壊株の気中菌糸形成能は回復しないままであった。以上の結果はBldM以外にもAdsAによって転写活性化される気中菌糸形成に必須な遺伝子が存在することを示している。続いて野生株とbldM破壊株との比較トランスクリプトーム解析を行い、BldMに依存した転写パターンを示す遺伝子群を同定した。大腸菌を用いて発現、精製したBldMを用いてゲルシフトアッセイを行ったところ、複数の候補遺伝子のプロモーター付近にBldMが結合することが明らかとなった。BldMの標的遺伝子の中には疎水性の気中菌糸コート蛋白質であるChp蛋白質をコードする遺伝子群が含まれており、これら遺伝子群の転写が大幅に減少するためにadsA.bldM遺伝子破壊株は気中菌糸を形成することができないと考えられた。

気 を bacteria si in the system of imperial す る AdsA の mark heritage 伝 son に masato す る parsing AdpA の mark heritage 伝 son と し て with fixed さ れ た AdsA は ECF シ グ マ factor を コ ー ド し て お り phenotypes, but 伝 broken 壊 strains の parsing か ら 気 bacteria in the si form に must で あ る こ と が わ か っ て い る. そ こ で 気 bacteria in the si form に masato and す る heritage 伝 subgroup を Ming ら か に す る た め, AdsA に よ っ て planning write さ れ る mark heritage 伝 son を explore し た. は じ め に wild strains と adsA broken 壊 strains と の planning to write more を DNA マ イ ク ロ ア レ イ と S1 マ ッ ピ ン グ method に よ り い, adsA に dependent し た planning write パ タ ー ン を shown す heritage 伝 son を explore し た. Time に coliform で 発 now, refined し た AdsA を with い て in vitro line planning write を っ た と こ ろ, twenty percent on royal is の 応 system of a royal factor を コ ー ド す る bldM が AdsA の mark heritage 伝 son と し て with fixed さ れ た. BldM heritage 伝 son broken 壊 strains は 気 bacteria si を forming す る こ と が で き ず saw adsA broken 壊 と strains with others の phenotype を shown し た が, adsA 壊 strains に bldM を forced 発 now し て も adsA broken 壊 strains の 気 bacteria in the si form can reply し は な い ま ま で あ っ た. Outside の above results は BldM に も AdsA に よ っ て planning write activeness さ れ る 気 traces of bacteria in the si form に must な 伝 son が exist す る こ と を shown し て い る. 続 い て wild strains と bldM broken 壊 strains と の is ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム parsing を い, bldM に dependent し た planning write パ タ ー ン を shown す heritage 伝 subgroup を with fixed し た. Coliform を with い て 発 now, refined し た BldM を with い て ゲ ル シ フ ト ア ッ セ イ を line っ た と こ ろ, plural の alternate but 伝 の プ ロ モ ー タ ー paying nearly に BldM が combining す る こ と が Ming ら か と な っ た. BldM の mark heritage 伝 child の に は 疎 water-based の 気 bacteria in si コ ー ト protein で あ る Chp protein を コ ー ド す が contains ま る but 伝 subgroups れ て お り, こ れ ら heritage 伝 subgroup の planning write が に substantially reduce す る た め に adsA. BldM heritage 伝 son broken 壊 strains は 気 bacteria si を forming す る こ と が で き な い と exam え ら れ た.

项目成果

Characterization of WhiB-like protein-encoding genes in Streptomyces griseus

灰色链霉菌 WhiB 样蛋白编码基因的表征

• 发表时间: 2009
• 作者: S.Hirano;et al
• 通讯作者: et al

放線菌 Streptomyces griseus の気中菌糸形成に関わる新たな遺伝子SGR3340の解析

灰色链霉菌气生菌丝形成新基因SGR3340的分析

• 发表时间: 2008
• 作者: 平野節;他
• 通讯作者: 他

放線菌 Streptomyces griseus における7個のWhiBホモログの解析

灰色链霉菌中七个 WhiB 同源物的分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 平野節;他
• 通讯作者: 他