プロテアソームの再構成法の確立と作動機構の構造的基盤の解明
プロテアソームの再構成法の確立と作動機構の構造的基盤の解明
批准号:
07J11032
负责人:
坂田 絵理
金额:
$2.11万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2009
中文摘要
ユビキチン化された基質は、プロテアソームにより認識され、脱ユビキチン化反応、変性反応を仕掛けられた後、触媒中心である20Sプロテアソームへとトランスロケーションし加水分解される。26Sプロテアソームは30を超える異なるサブユニットからなり、その構造の複雑さから結晶化が困難である。本研究では、質量分析法、結晶構造解析、Cryo-電子顕微鏡などの異なる構造解析法を組み合わせることによって、ユビキチン鎖形成メカニズムおよび26Sプロテアソームの会合メカニズムおよび複合体内相互作用の詳細に迫ることに成功した。ユビキチン鎖形成については、ユビキチンを結合したE2のX線結晶構造を明らかにし、UbcH5b-Ub複合体が自己会合することによりユビキチン鎖形成を促進することを示した(この研究はStructure誌に掲載された)。プロテアソームの会合については、質量分析法を巧みに用いて新たなアッセンブリー中間体を同定し、脱ユビキチン化酵素であるUbp6のアッセンブリーへの寄与を明らかにした(投稿中)。これらの成果は論文化され大きな評価を得た。さらにCryo電子顕微鏡を用いた構造解析については、26SプロテアソームのサブユニットのひとつであるRpn2の局在をGreen Fluorescent proteinによりラベルすることにより局在を明らかにし、その機能に知見を与えた。これらの成果はユビキチン-プロテアソーム系の構造生物学研究におおきく寄与した。
英文摘要
ユビキチン化された基質は、プロテアソームにより認識され、脱ユビキチン化反応、変性反応を仕掛けられた後、触媒中心である20Sプロテアソームへとトランスロケーションし加水分解される。26Sプロテアソームは30を超える異なるサブユニットからなり、その構造の複雑さから結晶化が困難である。本研究では、質量分析法、結晶構造解析、Cryo-電子顕微鏡などの異なる構造解析法を組み合わせることによって、ユビキチン鎖形成メカニズムおよび26Sプロテアソームの会合メカニズムおよび複合体内相互作用の詳細に迫ることに成功した。ユビキチン鎖形成については、ユビキチンを結合したE2のX線結晶構造を明らかにし、UbcH5b-Ub複合体が自己会合することによりユビキチン鎖形成を促進することを示した(この研究はStructure誌に掲載された)。プロテアソームの会合については、質量分析法を巧みに用いて新たなアッセンブリー中間体を同定し、脱ユビキチン化酵素であるUbp6のアッセンブリーへの寄与を明らかにした(投稿中)。これらの成果は論文化され大きな評価を得た。さらにCryo電子顕微鏡を用いた構造解析については、26SプロテアソームのサブユニットのひとつであるRpn2の局在をGreen Fluorescent proteinによりラベルすることにより局在を明らかにし、その機能に知見を与えた。これらの成果はユビキチン-プロテアソーム系の構造生物学研究におおきく寄与した。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Nedd8化修飾によるCullin型E3の活性化機構
Nedd8修饰Cullin型E3的激活机制
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
実験医学 26
影响因子:
--
作者:
[坂田絵理, 加藤晃一]
通讯作者:
加藤晃一
DOI:
10.1016/j.str.2009.11.007
发表时间:
2010-01-13
期刊:
STRUCTURE
影响因子:
5.7
作者:
[Sakata, Eri, Satoh, Tadashi, Kato, Koichi]
通讯作者:
Kato, Koichi
DOI:
10.1038/nsmb.1386
发表时间:
2008-03-01
期刊:
NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
影响因子:
16.8
作者:
[Yashiroda, Hideki, Mizushima, Tsunehiro, Tanaka, Keiji]
通讯作者:
Tanaka, Keiji
E2~ユビキチン中間体の結晶構造からわかったユビキチン化のしくみ
从E2〜泛素中间体的晶体结构揭示泛素化机制
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[H. Sasakawa, E. Sakata, Y. Yamaguchi, M. Masuda, T. Mori, E. Kurimoto, T. Iguchi, S. Hisanaga, T. Iwatsubo, M. Hasegawa, K. Kato., 坂田絵理]
通讯作者:
坂田絵理
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Biochem.Biophys.Res.Commun 363
影响因子:
--
作者:
[Sasakama, H., Sakata, E., Yamaguchi, Y., Masuda, M., Mori, T, . Kurimoto, E., Iguchi, T, . Hisanaga, S., Iwatsubo, T., Hasegawa, M., & *Kato K]
通讯作者:
& *Kato K
共 11 条
構造生物学的手法によるユビキチン-プロテアソーム系の分子認識および作動機構の解析
-
批准号:04J06128
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.79万
-
财政年份:2004
-
负责人:坂田 絵理
-
依托单位:
海外基金