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Molecular simulation study of membrane morphology change induced by proteins

Molecular simulation study of membrane morphology change induced by proteins
蛋白质诱导膜形态变化的分子模拟研究
批准号:
19370069
负责人:
TAKADA Shoji
金额:
$11.65万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2009

项目摘要

项目成果

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相关文献

中文摘要
翻译
膜形态的改变,如细胞融合和细胞分裂,是由相关蛋白诱导的。本文的研究目的是建立蛋白质-膜复合物的粗粒度模拟模型,并将其应用于膜形态动力学。我们扩展了蛋白质的多盆模型,使用Noguchi模型研究脂类,并提出了排除体积和疏水相互作用的蛋白-脂相互作用项。通过这个新模型,我们成功地模拟了囊泡的形成、囊泡融合、双组分囊泡的相分离以及出芽的机制。
英文摘要
Membrane morphology change, such as cell fusion and cell division, is induced by related proteins. The aim of the research here is to develop a coarse-grained simulation model for protein-membrane complex and to apply it to the membrane morphology dynamics. We extended the multiple-basin model for proteins, used Noguchi model for lipids, and proposed the excluded volume and hydrophobic interaction terms for the protein-lipid interaction. By this new model, we successfully simulated vesicle formation, vesicle fusion, phase separation of 2-components vesicle, and budding addressing their mechanisms.
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会议论文
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [Ryo Kanada, Takeshi Kuwata, Hiroo Kenzaki, Shoji Takada]
通讯作者: Shoji Takada
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [藤原慎司, 高田彰二]
通讯作者: 高田彰二
Folding simulations of chignolin by self-learning multiscale method
自学习多尺度方法模拟木犀草素的折叠
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [Wenfei Li, Shoji Takada]
通讯作者: Shoji Takada
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [Shoji Takada]
通讯作者: Shoji Takada
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    Theoretical study on transition path search algorithms in complex biomolecular systems
    • 批准号:
      16KT0054
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.9万
    • 财政年份:
      2016
    • 负责人:
      TAKADA Shoji
    • 依托单位:
    Simulation study of biomolecular motors: Structural analysis of regulation mechanisms of chemical reaction by motor movements
    • 批准号:
      22370057
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $12.15万
    • 财政年份:
      2010
    • 负责人:
      TAKADA Shoji
    • 依托单位: