Simulation study of biomolecular motors: Structural analysis of regulation mechanisms of chemical reaction by motor movements
Simulation study of biomolecular motors: Structural analysis of regulation mechanisms of chemical reaction by motor movements
批准号:
22370057
负责人:
TAKADA Shoji
金额:
$12.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2012
中文摘要
点击翻译按钮获取中文摘要
英文摘要
As a working principle of biomolecular motors, it is important to understand the regulation of chemical reactions by motor movements and conformational changes in enzymes. Here, we studied theoretically how a double-headed kinesin, one of the best characterized molecular motors, can regulate motions of two heads and addressed what is the structural basis for this cooperation. We found that the nucleotide-dependent tensions between the two heads are the fundamentals, and by that, unidirectional and chemically tight coupling between two heads are realized.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
癌抑制転写因子p53のDNA上の結合部位探索メカニズム: 粗視化分子動力学シミュレーションによる研究
肿瘤抑制转录因子p53 DNA结合位点的发现机制:利用粗粒度分子动力学模拟进行研究
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hosono Y, Usukura J, Yamaguchi T. Yanagisawa K, Suzuki M, Takahashi T, 畑田出穂, 寺川 剛]
通讯作者:
寺川 剛
Molecular Dynamics Simulation Study of p53 Intrinsically Disordered N Terminal Domain
p53本质无序N端结构域的分子动力学模拟研究
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[T. Terakawa, S. Takada]
通讯作者:
S. Takada
タンパク質の立体構造入門-基礎から構造バイオインフォマティクスへ-(2章タンパク質構造の物理化学,5章アミノ酸配列からの構造予測とデザイン,6章分子シミュレーション的な技法)(編集:藤博幸)
蛋白质三维结构导论-从基础到结构生物信息学-(第2章蛋白质结构的物理化学、第5章氨基酸序列的结构预测与设计、第6章分子模拟技术)(编者:藤弘之)
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[安藤友里子, 他, 高田彰二]
通讯作者:
高田彰二
Kinesin internal tension for the coordinated walk estimated by all-atom MD simulation(全原子MDによる双頭キネシン分子モーターの内部張力評価)、
通过全原子 MD 模拟估计协调行走的驱动蛋白内张力
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[金田亮, 牧野司, 富重道雄, 高田彰二]
通讯作者:
高田彰二
Modeling Rhodopsin active conformation (Meta II) by molecular dynamics simulations
通过分子动力学模拟模拟视紫红质活性构象 (Meta II)
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[F. Sakai, S. Takada]
通讯作者:
S. Takada
共 47 条
Theoretical study on transition path search algorithms in complex biomolecular systems
-
批准号:16KT0054
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
-
资助金额:$11.9万
-
财政年份:2016
-
负责人:TAKADA Shoji
-
依托单位:
Molecular simulation study of membrane morphology change induced by proteins
-
批准号:19370069
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
-
资助金额:$11.65万
-
财政年份:2007
-
负责人:TAKADA Shoji
-
依托单位:
海外基金