Analysis of geometric shapes of binding sites on protein-ligand complex for prediction of molecular interactions
Analysis of geometric shapes of binding sites on protein-ligand complex for prediction of molecular interactions
分析蛋白质-配体复合物上结合位点的几何形状以预测分子相互作用
批准号：
19500253
负责人：
KAWABATA Takeshi
金额：
$2.91万
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2007 至 2008
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英文摘要
単体の蛋白質の立体構造データから結合する分子の種類、結合する場所を予測することを最終目標として研究を進め、蛋白質表面の結合部位の候補を認識するプログラムGHECOMを開発した。このプログラムはモルフォロジーという画像処理技術を使用し、様々な深さのマルチスケールなポケットを同時に認識することができ、その深さから結合する分子の種類などの情報を推定できる。プログラムはフリーウエアとして一般公開している。
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会议论文
モルフォロジーを利用した蛋白質表面の様々な深さのポケットを同時に計算するアルゴリズムの開発
开发一种使用形态学同时计算蛋白质表面不同深度的口袋的算法
开发一种使用形态学同时计算蛋白质表面不同深度的口袋的算法
DOI：
--
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
--
作者：
[池野英利, 神崎亮平, 西川郁子, 加沢知毅, 高嶋聰, Shuichi S. Haupt, 川端猛]
通讯作者：
川端猛
回転可能な非球体プローブを用いた蛋白質ポケット発見アルゴリズムの開発
使用可旋转非球形探针开发蛋白质袋发现算法
使用可旋转非球形探针开发蛋白质袋发现算法
DOI：
--
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
--
作者：
[宮久保博幸, 川端猛]
通讯作者：
川端猛
GHECOMプログラムのWEBページのアドレス
GHECOM计划网页地址
GHECOM计划网页地址
DOI：
--
发表时间：
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
A searching method for interacting chemical compounds for target proteins using 3D structures of compound-protein complexes
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批准号：22500274
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项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额：$2.75万
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财政年份：2010
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负责人：KAWABATA Takeshi
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依托单位：
Basic Research for Development of New TiAl Base Alloys
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批准号：62550512
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项目类别：Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额：$1.22万
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财政年份：1987
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负责人：KAWABATA Takeshi
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依托单位：
海外基金