Analysis of geometric shapes of binding sites on protein-ligand complex for prediction of molecular interactions

分析蛋白质-配体复合物上结合位点的几何形状以预测分子相互作用

• 批准号: 19500253
• 负责人: KAWABATA Takeshi
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19500253/
• 关键词: バイオインフォマティクス; 構造バイオインフォマティクス; タンパク質; 分子認識; 分子形状; モルフォロジー

単体の蛋白質の立体構造データから結合する分子の種類、結合する場所を予測することを最終目標として研究を進め、蛋白質表面の結合部位の候補を認識するプログラムGHECOMを開発した。このプログラムはモルフォロジーという画像処理技術を使用し、様々な深さのマルチスケールなポケットを同時に認識することができ、その深さから結合する分子の種類などの情報を推定できる。プログラムはフリーウエアとして一般公開している。

To predict the molecular types and binding sites of protein molecules, the final goal is to further study and identify candidate binding sites on protein surfaces. The use of this technology in the processing of images, the identification of molecular species, and the identification of molecular species. It's not like you're going to be able to do that.

项目成果

モルフォロジーを利用した蛋白質表面の様々な深さのポケットを同時に計算するアルゴリズムの開発

开发一种使用形态学同时计算蛋白质表面不同深度的口袋的算法

• 发表时间: 2008
• 作者: 池野英利;神崎亮平;西川郁子;加沢知毅;高嶋聰;Shuichi S. Haupt;川端猛
• 通讯作者: 川端猛

回転可能な非球体プローブを用いた蛋白質ポケット発見アルゴリズムの開発

使用可旋转非球形探针开发蛋白质袋发现算法

• 发表时间: 2008
• 作者: 宮久保博幸;川端猛
• 通讯作者: 川端猛

GHECOMプログラムのWEBページのアドレス

GHECOM计划网页地址