鉄酸化独立栄養細菌が優先する微生物群集は深海底下に存在するか?
鉄酸化独立栄養細菌が優先する微生物群集は深海底下に存在するか?
批准号:
24770032
负责人:
加藤 真悟
金额:
$2.75万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012-04-01 至 2014-03-31
中文摘要
海洋性の鉄酸化菌を含む分類群Zetaproteobacteriaは、巨大海底下微生物生態系の成り立ちや、地球規模での物質循環を理解する上でのキープレーヤーと予想されている。しかしながら、その代謝機能や海底下における分布範囲などの具体的な情報は皆無に等しい。本研究では、(1)海底下におけるZetaproteobacteriaの分布範囲および存在量、(2)Zetaproteobacteriaに属する微生物種の生理学的特徴、の2点を明らかにすることを目的とした。南部マリアナトラフにて採取した硫化物コアを分析試料とし、平成24年度までに、1本のコアの異なる深度3点の試料について、微生物群集構造解析が完了している。平成25年度は、別の地点で採取したコア1本の異なる深度4点の試料からDNAを抽出した。計7つのサブ試料を対象に、パイロシークエンシング法等による微生物群集解析を行った。その結果、深度1 m程度の部位からは鉄/硫黄酸化菌群のZetaproteobacteriaやChromatialesが検出され、より深い部位からは鉄/硫酸還元菌群のNitrospiraeやDeltaprteobacteriaが検出された。これらの細菌に由来すると予想される硫黄酸化/硫酸還元や炭酸固定に関わる遺伝子も検出された。以上の結果から、海底下の硫化物構造体内部では、硫化鉄をエネルギー源とした微生物生態系が成り立っており、そこでは種々の細菌によって駆動される硫黄と鉄の循環系が存在することが示唆された。加えて、鉄酸化菌の効率的な分離培養方法を考案した。試験的に同培養法を用いて、陸上試料から螺旋状の構造体を産出する新規の淡水性鉄酸化菌の培養に成功した。しかしながらコア試料からのZetaproteobacteriaの培養には至っていない。本研究で得られた成果は学会にて発表し、国際誌に投稿中/公開済みである。
英文摘要
海洋性の鉄酸化菌を含む分類群Zetaproteobacteriaは、巨大海底下微生物生態系の成り立ちや、地球規模での物質循環を理解する上でのキープレーヤーと予想されている。しかしながら、その代謝機能や海底下における分布範囲などの具体的な情報は皆無に等しい。本研究では、(1)海底下におけるZetaproteobacteriaの分布範囲および存在量、(2)Zetaproteobacteriaに属する微生物種の生理学的特徴、の2点を明らかにすることを目的とした。南部マリアナトラフにて採取した硫化物コアを分析試料とし、平成24年度までに、1本のコアの異なる深度3点の試料について、微生物群集構造解析が完了している。平成25年度は、別の地点で採取したコア1本の異なる深度4点の試料からDNAを抽出した。計7つのサブ試料を対象に、パイロシークエンシング法等による微生物群集解析を行った。その結果、深度1 m程度の部位からは鉄/硫黄酸化菌群のZetaproteobacteriaやChromatialesが検出され、より深い部位からは鉄/硫酸還元菌群のNitrospiraeやDeltaprteobacteriaが検出された。これらの細菌に由来すると予想される硫黄酸化/硫酸還元や炭酸固定に関わる遺伝子も検出された。以上の結果から、海底下の硫化物構造体内部では、硫化鉄をエネルギー源とした微生物生態系が成り立っており、そこでは種々の細菌によって駆動される硫黄と鉄の循環系が存在することが示唆された。加えて、鉄酸化菌の効率的な分離培養方法を考案した。試験的に同培養法を用いて、陸上試料から螺旋状の構造体を産出する新規の淡水性鉄酸化菌の培養に成功した。しかしながらコア試料からのZetaproteobacteriaの培養には至っていない。本研究で得られた成果は学会にて発表し、国際誌に投稿中/公開済みである。
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微好気環境に生息する鉄酸化バクテリアの生理生態
微氧环境中铁氧化细菌的生理学和生态学
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Akihiko Yamagishi, Shingo Kato, Moriya Ohkuma, Tetsuro Urabe, 加藤真悟]
通讯作者:
加藤真悟
Sub-seafloor bacterial community structures within massive sulfide deposits at the Southern Mariana Trough
南马里亚纳海槽大量硫化物矿床内的海底细菌群落结构
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Akihiko Yamagishi, Shingo Kato, Moriya Ohkuma, Tetsuro Urabe]
通讯作者:
Tetsuro Urabe
海底下の熱水性硫化物中の微生物の分布、群集組成および代謝機能
海底热液硫化物中微生物的分布、群落组成和代谢功能
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[加藤真悟, 大熊盛也, 山岸明彦]
通讯作者:
山岸明彦
DOI:
10.1128/aem.03840-12
发表时间:
2013-09-01
期刊:
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
影响因子:
4.4
作者:
[Kato, Shingo, Chan, Clara, Ohkuma, Moriya]
通讯作者:
Ohkuma, Moriya
らせん状の細胞外構造体を産出する淡水性鉄酸化細菌 OYT1株の性状解析
OYT1 菌株的表征,一种产生螺旋细胞外结构的淡水铁氧化细菌
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[加藤真悟, 伊藤隆, 大熊盛也]
通讯作者:
大熊盛也
共 7 条
好酸性硫酸還元菌から紐解く始原的微生物の代謝と生息場
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批准号:24K00747
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:加藤 真悟
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依托单位:
Innovative strategy for cultivation of CPR bacteria and DPANN archaea
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批准号:22K19141
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$3.99万
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财政年份:2022
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负责人:加藤 真悟
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依托单位:
Nanogeomicrobiology
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批准号:19H03310
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.9万
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财政年份:2019
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负责人:加藤 真悟
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依托单位:
海外基金