エンハンサーによるlncRNAを介した新しい遺伝子発現制御機構の解析

增强子介导的lncRNA新基因表达调控机制分析

• 批准号: 25840005
• 负责人: 小野口 真広
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25840005/
• 关键词: long noncoding RNA; エンハンサー; ニューロン分化

本年度の実験計画に基づき、まず、utNgn1が標的遺伝子であるNeurog1のプロモーター領域のヒストン修飾に影響を与えるかを、クロマチン免疫沈降法（ChIP）により検討した。大脳新皮質由来の神経系前駆細胞を用いてutNgn1をノックダウンし、転写活性化状態に関連するヒストン修飾および転写抑制に関連するヒストン修飾抗体を用いてChIPを行った。その結果、Neurog1プロモーターにおいては、これらのヒストン修飾レベルに大きな変化は見られなかった。そこで次に、utNgn1がRNA ポリメラーゼIIのリクルートあるいは転写開始や転写伸長などに関与している可能性を RNAポリメラーゼII抗体を用いてChIPにより検討した。その結果興味深いことに、 utNgn1がNeurog1の転写の開始や伸長に関与している可能性を示唆する結果が得られた。さらにutNgn1のエンハンサーとしての機能を検討するために、エンハンサーとプロモーター領域の近接具合をChromosome Conformation Capture(3C)法により評価した。その結果、神経系前駆細胞がニューロン分化する過程で、Neurog1遺伝子座のエンハンサー−プロモーター間が近接する可能性が示唆された。さらにこの近接とutNgn1の関係を検討した。これらの結果から、utNgn1がどのようにNeurog1の転写促進に関与しているのかについて、非常に示唆的な結果が得られた。 本結果に基づきさらに詳細に解析を進めることで、lncRNAの新しい作用機序が明らかになることが期待される。

This year's implementation plan is based on the analysis of the effect of gene modification on Neurog1 and ChIP. The use of UtNg1 in neocortex-derived neurologic progenitor cells is associated with the modification of the activation state and the inhibition of the activation state. Results: Neurog1, Neurog1, Neurog1, For example, if you want to use the ChIP, you can use the ChIP to change the length of the RNA. The result is interesting, utNg1 and Neurog1 start to write and stretch, and the result is interesting. In addition, the function of UtNg1 can be evaluated by Chromosome Conformation Capture(3C) method. These results indicate the possibility of a close link between neurogenesis and neurogenesis. This article discusses the relationship between Ng1 and Ng2. The result of this is that, utNg1 is not the same as Neurog1, and the result of this is very different. The results of this study are summarized in detail below.

项目成果

Regulation of neuronal differentiation by Polycomb components Cbx2 and Cbx7

Polycomb 成分 Cbx2 和 Cbx7 对神经元分化的调节

• 发表时间: 2014
• 作者: Taruho Endoh;Masafumi Tsuboi;Masahiro Onoguchi;Yusuke Hirabayashi and Yukiko Gotoh
• 通讯作者: Yusuke Hirabayashi and Yukiko Gotoh

A long noncoding RNA derived from an enhancer region regulates Neurogenin1 gene expression

源自增强子区域的长非编码 RNA 调节 Neurogenin1 基因表达

• 发表时间: 2013
• 作者: Yamagami K;Yamamoto T;Sakai S;Mioka T;Sano T;Igarashi Y;Tanaka K.;Masahiro Onoguchi and Yukiko Gotoh
• 通讯作者: Masahiro Onoguchi and Yukiko Gotoh