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新規non-coding RNAによるNeurogenin1の転写制御機構の解析

利用新型非编码RNA分析Neurogenin1的转录控制机制

基本信息

批准号：
10J06128
负责人：
小野口真広
金额：
$ 0.9万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10J06128/
关键词：
Long noncoding RNA Polycomb enhancer Neurogenin neuronal differentiation neocortical development Long non coding RNA Neurogeninl ニューロン分化 Enhancer

项目摘要

Polycomb(PcG)タンパク質は、遺伝子プロモーター領域のエピジェネティックな抑制に重要な因子である。しかしながら遺伝子のエンハンサー領域に対してPcGがどのように作用しているのかはわかっていなかった。本研究ではこれまでに、Ngn1のエンハンサー領域にコードされているLong noncoding RNA,utNgn1の転写がNgn1の発現を正に制御することで、utNgn1がNgn1エンハンサーの活性を少なくとも一部担っているということを示唆する結果を得た。そこで次に、PcGとエンハンサー領域およびプロモーター領域の転写活性の関係を調べるために、クロマチン免疫沈降法により、PcGによるヒストン修飾であるH3リジン27番目のトリメチル化(H3K27me3)の修飾量を調べた。その結果、H3K27me3はNgn1遺伝子のプロモーター領域のみではなく、エンハンサー領域にもブロードに修飾されていることが分かった。さらにこの修飾は発生の時期とともに全ての領域で上昇することも分かった。この時のNgn1およびutNgn1の発現量をRT PCR法により定量すると、いずれも発生の時期が進むに従って発現量は減少することがわかった。一方で転写活性化のヒストン修飾であるH3リジン4番目のトリメチル化(H3K4me3)は、プロモーターと同様にエンハンサーにも修飾されていることがわかったが、この修飾レベルに関しては、発生時期を通してあまり変化しないことが示唆された。これらの結果より、大脳新皮質の発生では、時期が進むにつれてPcGがNgn1遺伝子座のプロモーターおよびエンハンサー領域をブロードに抑制することで遺伝子の発現スイッチをオフにしている可能性が考えられた。この可能性を検証するために、PcGの必須コンポーネントであるRing1Bを神経系前駆細胞特異的にノックアウトすると、Ngn1のみではなく、utNgn1の発現も脱抑制され、発現レベルが上昇することが明らかとなった。この結果より、発生後期におけるNgn1の発現抑制時には、Ngn1遺伝子座のプロモーターのみではなくエンハンサー領域もPcGにより抑制されることが示唆された。本研究から、PcGはエンハンサーにコードされた機能性noncoding RNAの発現制御を介して遺伝子の転写調節を行うという新たなモデルが考えられる。

Polycomb(PcG) is an important factor in the field of quality control and genetic control. PcG is the only one who can be used in the field. In this study, Ngn1 was found to be a Long noncoding RNA in the domain of Ngn1, and the expression of utNgn1 was positively controlled by the expression of utNgn1 in the domain of Ngn1. PcG, PcG, PcG. H3K27me3 The time of the birth of the child The amount of Ngn1 and utNgn1 detected by RT PCR was quantified, and the amount of Ngn1 detected by RT PCR was decreased. One side is to write activation and modification of H3, K4, K5, K4, K5, K5, K6, K6, K7, K8, K9, K10, K11, K10, K10, K11, K10, K1 As a result, the development of neocortex in large areas is likely to be inhibited by the development of neocortex in large areas. The possibility of this is demonstrated by the presence of PcG, the presence of Ring1B, the presence of Ngn1, the presence of UtNgn1, and the presence of UtNgn1. The result is that the expression of Ngn1 is inhibited in the late stage of development, and the expression of Ngn1 is inhibited in the late stage of development. In this study, PcG was used to investigate the expression and regulation of functional noncoding RNA.

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Regulation of the neurogenin 1 locus during the mouse neocortical development

小鼠新皮质发育过程中神经原素 1 位点的调节

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
小野口真広
通讯作者：
小野口真広

A noncoding RNA regulates the neurogenin1 gene locus during mouse neocortical development

DOI：
10.1073/pnas.1202956109
发表时间：
2012-10-16
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子：
11.1
作者：
Onoguchi, Masahiro;Hirabayashi, Yusuke;Gotoh, Yukiko
通讯作者：
Gotoh, Yukiko

Non coding RATA Regulation of Neurogenin 1 During Neocortical Development

新皮质发育过程中神经原素 1 的非编码 RATA 调节