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Xタイリングアレイを用いたX連鎖性精神発達遅滞の原因遺伝子探索

使用 X 平铺阵列搜索导致 X 连锁智力低下的基因

基本信息

批准号：
08J00314
负责人：
本田尚三
金额：
$ 1.15万
依托单位：
Tokyo Medical and Dental University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2010
项目状态：
已结题

项目摘要

精神発達遅滞(MR)は全人口の約1-2%という決して少なくない頻度で発症する疾患で、多くの医学的、社会的問題を含んでいる。またMRの10-12%はX染色体に座位する遺伝子の異常で惹起されるとされ、その病態はX連鎖性精神発達遅滞(XLMR)として独立した概念で捉えられている。そこで国立精神・神経センターを中心に収集された本邦MR検体を用いて、1001個のBACクローンでX染色体をほぼ間断なくカバーした自作のMCG X-tiling arrayによって潜在的ゲノムコピー数異常を探索し、新規XLMR原因遺伝子の同定を試みた。2010年4月の時点で144家系中10家系(6.9%)においてMR病態形成との関与が示唆されるゲノムコピー数異常(pCNV)を検出し、その結果をまとめてJournal of Human Geneticsに報告した(Honda et al.2011)。現在では198家系において解析が終了し、さらに5家系においてpCNVが検出され、検出率は7.6%(15/198)となった。これらの結果から、新規のXLMR原因遺伝子の同定が期待でき、それらの成果は、MRの病態を解明しMRの適切な療育指針や社会的システムの整備などに役立つと考えられる。また本スクリーニングで、非血縁の2家系で検出された同一の複雑なゲノム再構成を塩基レベルで詳細に解析することにより、ゲノム組換え機構の一つである"FoSTeS"によって当該構造異常が惹起されている可能性を示した。ゲノム再構成切断点をPCRでスクリーニングするシステムを構築して、総計8121人を対象に各民族集団における頻度を調べた結果、白人、黒人では検出されず、日本人、韓国人、中国朝鮮族、モンゴル人で検出されたことから、当該ゲノム再構成がモンゴル圏で発生し日本に伝搬されてきた可能性が示唆され、人類学的にも興味深い知見となっている。

Spirit 発 da 遅 hysteresis (MR) はの population is about 1-2% という definitely して less なくない frequency です発 disease でる disease, multiple くの medical, social problems を containing んでいる. また MR の 10-12% は X chromosome に seat する posthumous son 伝の abnormal で provoked されるとされ, その pathological は x-linked mental 発 da 遅 hysteresis (XLMR) として independent した concept で catch えられている. そこで national spirit, god 経センターを center に収 set されたを state MR 検 body with いて, 1001 の BAC クローンで X chromosome をほぼ discontinuous なくカバーした made の MCG X-ray tiling arrayによって potential ゲノムコピゲノムコピ number anomalies を explore ゲノムコピ, new XLMR causes 伝 sub-<e:1> determine を try みた. In April 2010 の point で 10 family (6.9%) in the line of 144 において MR pathological form との masato and が in stopping されるゲノムコピー several abnormalities (pCNV) を検し, その results をまとめて Journal of Human Genetics に report した (Honda et (al.2011) Now では 198 family においてし, end of the parse がさらに 5 family において pCNV が検 out され, は検 rate 7.6% (15/198) となった. これらの results から, new rules の XLMR reason but 伝 child の with fixed が expect でき, それらの results は, MR の pathological を interpret し MR の appropriate な intervention pointer や social システムの servicing などに servants made つと exam えられる. また this スクリーニングで, non blood try の 2 family で検 out された same の complex 雑なゲノム reconstitution を salt base レベルで detailed analytical すにることにより, ゲノム set is in え institutions のつである "FoSTeS によって when the tectonic anomaly が provoked されていをる possibility in した. ゲノム to constitute the cutoff point を PCR でスクリーニングするシステムを build して, 総 meter 8121 を like に nationalities set seaborne 団における frequency を adjustable べた result, white and black people では検 out されず, Japanese, Korean, Chinese Korean, モンゴル people で検 out されたことから, when the ゲノム reconstitution がモンゴル sha-lu で The possibility of the emergence of the Japanese に伝 relocation されてたたたが indicates され, and the anthropological にされて is of great interest and has a profound understanding of となってるるる.