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イオン輸送タンパク質における動的構造変化の解析

イオン輸送タンパク質における動的構造変化の解析
离子转运蛋白动态结构变化分析
批准号:
08J01572
负责人:
柴田 幹大
金额:
$5.76万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2010

项目摘要

项目成果

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本研究は高速原子間力顕微鏡(高速AFM)を光駆動プロトンポンプタンパク質、バクテリオロドプシン(bR)に適用し、bRが光を受容し機能する際に起こる構造変化を直接観察し、どのような構造変化を起こすのかを明らかにすることが目的である。1.bRは暗状態で570nm程度に極大吸収をもち、光で開始される反応サイクル中に、410nm程度に極大吸収をもつ中間体(M中間体)を生成する。本年度は、緑色の光(532nm)と、青色の光(408nm)を照射することで、高速AFMで観察されたbRの構造変化がどの中間体に由来するのかを明らかにした。最初に,緑色の光照射(532nm)によってbRの構造変化が開始される。この構造変化したbRに冑色の光(408nm)を照射すると、構造が元の状態へ戻る様子が観察された。この結果は観察されたbRの構造変化は光反応サイクル中に生成されるM中間体であるという直接的証拠であると共に、タンパク質表面で起こる大きな構造変化は、タンパク質内部に位置する小さな発色団の異性化状態で決められていると結論できる。2.bRのAsp85をThrやSerに置換したbR変異体D85T,D85SはC^-ポンプになることが知られている。そこで、C^-をポンプするbR変異体D85Sに対して高速AFMを適用し、プロトンとは逆向きに.C^-をポンプする際に起こる構造変化を直接可視化することを試みた。その結果、低C^-濃度下での高速AFM観察により細胞外表面で構造が変化する様子が観察された。C^-結合型の細胞外表面は固い構造をとるように見えるが、非結合型の場合は緩い構造をとるように見える。プロトンポンプタンパク質の場合、プロトンは細胞質から取り込まれ、構造変化は細胞質表面に限られる。一方、C^-ポンプタンパク質の場合、C^-は細胞外から取り込まれ、構造変化は細胞外表面で起こる。イオンを取り込む側と、構造変化する部位には相関があり、これらの結果はイオンポンプタンパク質において、大きな構造変化はイオンを取り込む部位に必要であると結論できる。
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专著(0)
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会议论文
50周年記念シンポジウム
50周年纪念研讨会
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [S.Kawaguchi, et al., 柴田幹大, 柴田幹大]
通讯作者: 柴田幹大
Role of Proline Residue in pharaonis Halorhodopsin : An FTIR Study
脯氨酸残基在法老蜥盐视紫红质中的作用:一项 FTIR 研究
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [S.Kawaguchi, et al., 柴田幹大, 柴田幹大, Mikihiro Shibata]
通讯作者: Mikihiro Shibata
DOI: 10.1155/2010/536453
发表时间: 2010-01-01
期刊: SPECTROSCOPY-AN INTERNATIONAL JOURNAL
影响因子: --
作者: [Kawaguchi, Shintaro, Kambara, Ohki, Tominaga, Keisuke]
通讯作者: Tominaga, Keisuke
クロライドイオンをボンプするバクテリオロドプシン変異体の高速AFM観察
泵送氯离子的细菌视紫红质突变体的高速 AFM 观察
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [S.Kawaguchi, et al., 柴田幹大]
通讯作者: 柴田幹大
Investigation of molecular insight into genome editing tools by single-molecule imaging
  • 批准号:
    21H01771
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $11.23万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    柴田 幹大
  • 依托单位:
イオン輸送タンパク質における内部結合水のはたらき
  • 批准号:
    05J02525
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.73万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    柴田 幹大
  • 依托单位:
海外基金