SETD2 の大腸癌発生における遺伝子発現制御機構の解析

SETD2在结直肠癌发生发展中的基因表达调控机制分析

• 批准号: 08J10956
• 负责人: 谷上 賢瑞
• 金额: $ 0.77万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08J10956/
• 关键词: 転写プログラム; SETD2; 大腸癌; 転写制御モチーフ; 遺伝子発現制御; 転写因子

我々は、大腸癌発生時における転写プログラムの異常を解明することに焦点を当て、まず様々なデータベース及び、マイクロアレイデータを統合したin silicoスクリーニングを行い、大腸癌発生に関与する新規転写制御モチーフAを推定し、さらに酵母ワンハイブリッド法により、同モチーフに結合するSETD2を同定した。SETD2は、現在までヒストンH3 Lys36メチルトランスフェラーゼ活性を持つこと、及びRNAポリメラーゼIIと相互作用して転写開始に関与することが確認されている.そこで本研究では、大腸癌発生における遺伝子発現制御機構の破綻へのSETD2の関与を明らかにすることを目的とした。我々は、SETD2を強制発現させることによって、in silicoスクリーニングによって得られたターゲット遺伝子候補Bの発現が上昇すること、及びSETD2の発現を抑制することによって、遺伝子Bの発現が抑制されることを明らかにした。また、SETD2がモチーフAを介して遺伝子Bの発現を制御していることをルシフェラーゼアッセイを用いて確認した。さらに、SETD2がモチーフAに直接結合していることを明らかにするため、ゲルシフトアッセイを行ったところ、SETD2はin vitroでモチーフAに直接結合することが明らかとなった。本研究では、自身が開発した新規転写因子スクリーニングアルゴリズムを用いて様々な既存データを統合することにより、転写制御因子の一つであるSETD2を同定した。さらにin vitro、in vivoの実験を行うことによって、SETD2がターゲット遺伝子を直接制御していることが示され、本研究で開発した新規転写因子スクリーニングアルゴリズムの有効性が示された。今後は、SETD2の癌発生機構への関与を中心に研究を進める。

When colorectal cancer develops, we will focus on the analysis of abnormal patterns in the writing process and focus on the analysis of abnormal patterns in the writing process. We will integrate the analysis of abnormal patterns in the writing process of colorectal cancer. We will estimate the new pattern of abnormal patterns in the writing process of colorectal cancer. We will combine the analysis of abnormal patterns in the writing process of colorectal cancer with SETD2. SETD2 is now active in the H3 Lys36 region and RNA is active in the II region. The purpose of this study is to clarify the relationship between SETD2 and the development of colorectal cancer. The occurrence of SETD2 is suppressed, and the occurrence of SETD2 is suppressed. SETD2 is used to control the occurrence of gene A and gene B SETD2 is in direct contact with A. In this study, SETD2 was determined by a new set of control factors, such as the control factor and the control factor. In this study, we developed a new method to control the activity of SETD2 in vitro and in vivo. In the future, SETD2 cancer development mechanism and center research will be carried out.

项目成果

Sunspot, a link between Wingless signaling and endoreplication in Drosophila

太阳黑子，果蝇无翼信号传导与内复制之间的联系

• 发表时间: 2010
• 期刊: Development 137
• 作者: Taniue K.;Nishida A.;Hamada F.;Sugie A.;Oda T.;Ui-Tei K.;Tabata T.;Akiyama T.;Kawasaki Y;K.Taniue
• 通讯作者: K.Taniue