Genome wide SNP collection for reclassification of high risk pathogens

全基因组 SNP 收集，用于高风险病原体的重新分类

• 批准号: 20390124
• 负责人: EZAKI Takayuki
• 金额: $ 11.65万
• 依托单位: Gifu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20390124/
• 关键词: 細菌; 系統分類; ゲノム情報; SNP; 多型; 種の定義; 菌種の定義; 遺伝子多型; リボソームタンパク; 全ゲノム; 高度病原体; 属の定義; 腸内細菌科; 大腸菌; 赤痢菌; 種の多型; ボツリヌス菌; 細菌の命名; 分類; 系統; 裁定委員会; 全ゲノム配列; 炭疽菌; セレウス菌; 病原因子; dnaJ; 防御因子; 浮腫因子; 致死因; 病原性大腸菌; Shigella; E. coli; S. flexneri; S. d

From genome wide screening of house keeping gene (HKG) of high risk pathogens and the relatives, top 15 HKG were selected to differentiate BSL3 pathogens from the closely related nonpathogens. Diversity of concatenated these 15 HKG of BSL3 and the closely related nonpathogenic species was significantly bigger than the diversity of 16S rRNA.

通过对BSL 3高风险病原体及其近缘种的管家基因（HKG）进行全基因组筛查，筛选出前15个HKG，用于区分BSL 3病原体与近缘种非病原体。BSL 3的这15个HKG和密切相关的非致病物种的多样性显着大于16 S rRNA的多样性。

项目成果

原核生物の系統分類:細菌とアーキア(1)

原核生物的系统发育分类：细菌和古细菌（1）

• 发表时间: 2012
• 期刊: 生物の科学遺伝
• 作者: 今村美智子;筒井ひろ子;藤元治朗;中西憲司;田中正視;江崎孝行
• 通讯作者: 江崎孝行

Atypical Osteomyelitis of the Skull Base and Craniovertebral Junction Caused by ActinomycesInfection.

放线菌感染引起的颅底和颅椎交界处非典型骨髓炎。

• 发表时间: 2011
• 期刊: Neurol Med Chirl.
• 作者: Nomura M;Shin M;Ohta M;Nukui Y;Ohkusu K;Saito N.
• 通讯作者: Saito N.

Evaluation of Functional genes for classification of Pathogenic Bacteria

病原菌分类功能基因评价

• 发表时间: 2010
• 作者: Murata T Nakayama S;Kato-Murayama;M;Akasaka R;Ohbayashi N Kamewari-Hayami Y;Terada T;Shirouzu M;Tsurumi T;Yokoyama S.;櫻木淳一;黒石歩;俣野哲朗;Takayuki Ezaki
• 通讯作者: Takayuki Ezaki

バイオセーフテイ指針(病原微生物のバイオセーフテイ分類)

生物安全指南（病原微生物生物安全分类）

• 发表时间: 2010
• 作者: 村田貴之;鶴見達也;江崎孝行
• 通讯作者: 江崎孝行

微生物の事典, レジオネラ感染症, Q熱

微生物百科全书，军团菌感染，Q热

• 发表时间: 2008
• 作者: 大楠清文;福永肇;江崎孝行
• 通讯作者: 江崎孝行