Identification of novel genes for congenital anomalies of Kidney and urinary tract (CAKUT) by CNV analyses and development of comprehensive gene testing for CAKUT

通过 CNV 分析鉴定肾脏和泌尿道先天性异常 (CAKUT) 的新基因并开发 CAKUT 综合基因检测

• 批准号: 20390240
• 负责人: IIJIMA Kazumoto
• 金额: $ 11.9万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20390240/
• 关键词: 先天性腎尿路奇形; CNV解析; 原因遺伝子; 先天性腎尿路奇形(CAKUT); copy number variation (CNV); microdeletion; microduplication; copy number variation(CNV); genome-wide CNV array; TCF2; 多嚢胞性異形成腎(MCDK)

Copy number variation (CNV) of human genome is associated with several diseases including congenital anomalies. To identify new genes responsible for congenital anomalies of kidney and urinary tract (CAKUT), we utilized Agilent genome-wide CNV 400k array. We identified 4 CNV regions, which were not detected in healthy controls and CNV databases. We found 8 genes within or around these CNV regions. Of these genes, we identified a gene in which a CAKUT-specific heterozygous deletion resulted in deletion of 3 exons. We will analyze whether these genes are responsible for CAKUT. We developed comprehensive gene testing systems for known CAKUT genes (HNF1B, PAX2, EYA1, SIX1, SALL1) using multiplex ligation-dependent probe amplification and mRNA level analysis as well as direct sequencing of genomic DNA.

人类基因组的拷贝数变异(CNV)与包括先天性畸形在内的多种疾病有关。为了确定与先天性肾和尿路异常(CAKUT)相关的新基因，我们利用了安捷伦全基因组CNV 400k阵列。我们确定了4个CNV区域，这些区域在健康对照和CNV数据库中没有检测到。我们在这些CNV区域或其周围发现了8个基因。在这些基因中，我们发现了一个基因，在该基因中，CAKUT特异性杂合性缺失导致了3个外显子的缺失。我们将分析这些基因是否与CAKUT有关。我们利用多重连接依赖的探针扩增和mRNA水平分析以及基因组DNA的直接测序，建立了针对已知CAKUT基因(HNF1B、PAX2、EYA1、SIX1、SALL1)的全面基因检测系统。

项目成果

ヒト常染色体劣性多発性嚢胞腎(ARPKD)相同遺伝子ラットモデル(PCKラット)の尿細管上皮細胞における上皮間葉移行(EMT)

人常染色体隐性多囊肾病（ARPKD）同源大鼠模型（PCK大鼠）肾小管上皮细胞的上皮间质转化（EMT）

• 发表时间: 2010
• 期刊: 発達腎研究会誌
• 作者: 戸川寛子;中西浩一;島友子;佐古まゆみ;宮嶋正康;野津寛大;飯島一誠;吉原大輔;長尾枝澄香;吉川徳茂
• 通讯作者: 吉川徳茂

【小児の治療指針】腎・尿路ステロイド抵抗性ネフローゼ症候群

[儿科治疗指南] 肾/尿路类固醇抵抗性肾病综合征

• 发表时间: 2010
• 期刊: 小児科診療
• 作者: Huang T;Wan Y;Zhu Y;Fang X;Hiramatsu N;Hayakawa K;Paton A;Paton J;Kitamura M;and Yao J;飯島一誠
• 通讯作者: 飯島一誠

Encrusted Cystitis Caused by MRSA in a Pediatric Renal Transplant Recipient

儿童肾移植受者 MRSA 引起的结痂性膀胱炎

• 发表时间: 2010
• 作者: Tanaka R;Teraoka Y;Shimooka T;Hisamatsu E;Takagi S;Sugita Y;Kamei K;Iijima K
• 通讯作者: Iijima K

多嚢胞性異形成腎(MCDK)の兄弟例におけるHNF-1β遺伝子変異

多囊肾发育不良 (MCDK) 兄弟姐妹中的 HNF-1β 基因突变

• 发表时间: 2010
• 作者: 蓮井正史;磯崎夕佳;田中幸代;金子一成;野津寛大;飯島一誠
• 通讯作者: 飯島一誠

The Relationship between Arginine Vasopressin Levels and Hyponatremia in Children Receiving Hypotonic or Isotonic Intravenous Fluids Following a Percutaneous Renal Biopsy

经皮肾活检后接受低渗或等渗静脉输液的儿童精氨酸加压素水平与低钠血症之间的关系

• 发表时间: 2010
• 作者: Michael L.Moritz,Nozu K;Iijima K
• 通讯作者: Iijima K