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Analysis of the biosynthetic pathway and the regulatory mechanism of secondary metabolites in Streptomyces

Analysis of the biosynthetic pathway and the regulatory mechanism of secondary metabolites in Streptomyces
链霉菌生物合成途径及次生代谢产物调控机制分析
批准号：
20780083
负责人：
ARAKAWA Kenji
金额：
$2.66万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2009
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20780083/
关键词：
生合成抗生物質ポリケチド制御遺伝子転写活性化因子糖転移酵素アミンオキシダーゼ大員環ポリケチド合成酵素P450ガンマブチロラクトン

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We analyzed the function of the secondary metabolites genes located on the linear plasmid pSLA2-L. In LC biosynthesis, the C-18 amine group in an acyclic compound is oxidized by LkcE to form the iminium intermediate, which then receives the nucleophilic attack from C-2 enolate to form the 17-membered macrocyclic LC. We also determined the order of post-PKS modification in LM biosynthesis. The extensive transcriptional analysis has revealed that the γ-butyrolactone signaling cascade goes from srrX through srrA to srrY, leading to LC and LM production.
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会议论文
The structure of ribosome-lankacidin complex reveals ribosomal sites for synergistic antibiotics
DOI： 10.1073/pnas.0914100107
发表时间： 2010-02-02
期刊： PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子： 11.1
作者： [Auerbach, Tamar, Mermershtain, Inbal, Yonath, Ada]
通讯作者： Yonath, Ada
Streptomyces rocheiのPQQ生合成遺伝子破壊株の代謝産物解析
罗氏链霉菌PQQ生物合成基因破坏菌株的代谢分析
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [S. Yamamoto, Y. He, K. Arakawa, H. Kinashi, 山本章治, 荒川賢治, 荒川賢治, Yosi NINDITA, 楊英悉, 高橋譲, 荒川賢治, 荒川賢治, 鈴木敏弘, 楊英悉, 曹志生, 荒川賢治, 鈴木敏弘, 荒川賢治, 荒川賢治, 楊英恋, 吉田竜平]
通讯作者： 吉田竜平
Streptomyces rocheiの線状プラスミドpSLA2-Mの全塩基配列決定
罗氏链霉菌线性质粒 pSLA2-M 的完整核苷酸测序
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [S. Yamamoto, Y. He, K. Arakawa, H. Kinashi, 山本章治, 荒川賢治, 荒川賢治, Yosi NINDITA, 楊英悉]
通讯作者： 楊英悉
放線菌Streptomyces rochei 7434AN4株の抗生物質生合成制御カスケードにおけるリプレッサーSrrB, SrrCの機能及び代謝産物解析
罗氏链霉菌7434AN4菌株抗生素生物合成控制级联中抑制子SrrB和SrrC的功能和代谢分析
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [S. Yamamoto, Y. He, K. Arakawa, H. Kinashi, 山本章治, 荒川賢治, 荒川賢治, Yosi NINDITA, 楊英悉, 高橋譲]
通讯作者： 高橋譲
共 31 条
    Exploring and extensive utilization of natural products in Sulawesi Island, Indonesia, creating the ecosystem diversity
    • 批准号：
      19KK0149
    • 项目类别：
      Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
    • 资助金额：
      $11.73万
    • 财政年份：
      2019
    • 负责人：
      ARAKAWA Kenji
    • 依托单位：
      Hiroshima University
    Collective activation of silent biosynthetic pathways for bioactive compounds by small diffusible signaling molecules
    • 批准号：
      16K14915
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.33万
    • 财政年份：
      2016
    • 负责人：
      ARAKAWA Kenji
    • 依托单位：
      Hiroshima University
    Integration of structural basis for secondary metabolite biosynthesis, regulation, and morphological development coded on the Streptomyces genome
    • 批准号：
      16H04917
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.07万
    • 财政年份：
      2016
    • 负责人：
      ARAKAWA Kenji
    • 依托单位：
      Hiroshima University
    Comprehensive analysis of the biosynthetic machinery and their regulatory system for secondary metabolites in Streptomyces
    • 批准号：
      22580121
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.91万
    • 财政年份：
      2010
    • 负责人：
      ARAKAWA Kenji
    • 依托单位：
      Hiroshima University
    海外基金