海洋に広がる薬剤耐性遺伝子-海洋細菌の遺伝子伝達機構と耐性遺伝子新機能の解明

耐药基因在海洋中传播——阐明海洋细菌中耐药基因的基因转移机制和新功能

• 批准号: 20780141
• 负责人: 野中 里佐
• 金额: $ 3.08万
• 依托单位: Dokkyo Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20780141/
• 关键词: 薬剤耐性遺伝子; 薬剤耐性菌; テトラサイクリン; 遺伝子伝達; 養殖場

昨年度は養殖場海水より分離したビブリオ科細菌Photobacterium damselae subsp. damselae04Ya311が保有する多剤耐性伝達性プラスミドの全塩基配列を高速シークエンサーを用いて決定後、coding sequence (CDS)の抽出およびアノテーションを行った。当該年度はアノテーションの結果から、配列情報が不確かと思われた約20箇所についてサンガー法を用いて配列を確認し、CDSを確定した後、DDBJ (DNA data bank of Japan)への登録を行った(2003年12月公開予定)。本プラスミドは235のCDSを含む204,052bpの環状プラスミドであった。このうち約3割に該当する78のCDSから予想されるアミノ酸配列は既知配列との比較により機能予測が可能であった。本プラスミドは合計7つの薬剤耐性遺伝子をコードする多剤耐性プラスミドであり、接合伝達実験により本プラスミドを受容した大腸菌では、テトラサイクリン系、ベータラクタム系、マクロライド系、フロルフェニコールおよびクロラムフェニコールに対する感受性が低下しており、伝達された耐性遺伝子が接合体においても機能していることが確認された。さらに本プラスミド上にはグラム陰性菌のtype IV secretion systemに必要とされる20の遺伝子セットがコードされており、プラスミドの伝達は本システムを介して行われていることが強く示唆された。また、プラスミド上にコードされているリラクゼース遺伝子を用いた解析により本プラスミドがMOB_Hというプラスミドグループに属する新しいタイプのプラスミドであることが明らかになった。この新しいタイプのプラスミドは他の養殖場由来菌からも検出され、海洋細菌固有のプラスミドタイプとして養殖環境内でのプラスミド伝播に寄与していることが示唆された。

Yesterday, we separated the bacteria from the seawater of the farm. Photobacterium damselae subsp. damselae04Ya311 provides multi-component resistance, full base alignment, high speed, service selection, coding sequence (CDS) extraction, and application. When the results of this year's registration are not accurate, the registration information is not accurate, and about 20 entries are confirmed. After the CDS is confirmed, the registration of DDBJ (DNA data bank of Japan) is scheduled (announced in December 2003). The CDS of this file contains 204,052bp of ring file. This cut is approximately 3 times that of the current 78 CDS, but it is possible to make functional predictions based on the comparison of known acid configurations with known configurations. The present invention provides a total of 7 kinds of resistance genes, including resistance genes, and resistance genes. The gene expression of the mutant is confirmed by the function of the mutant. The type IV secration system for negative bacteria requires 20 minutes to complete, and the type IV secration system requires 20 minutes to complete. In addition to the above, there are also some other ways to solve the problem. This new species is found in the culture environment where it is derived from other farm-derived bacteria, and where it is found in marine bacteria.

项目成果

Novel lineage of transferable multi-drug resistance plasmids derived Vibrionaceae isolated from coastal aquaculture site

从沿海水产养殖场分离的弧菌科可转移多重耐药质粒的新谱系

• 发表时间: 2010
• 作者: Segawa T;Itou T;Echigoya Y;Suzuki M;Koie H;Sakai T.;野中里佐
• 通讯作者: 野中里佐

養殖場由来Photobacterium damselae subsp. damselaeの多剤耐性プラスミド全塩基配列解析とその伝達機構

农场来源的少女发光杆菌亚种多重耐药质粒的完整核苷酸序列分析及其传播机制

• 发表时间: 2010
• 作者: Itou T;Koie H;Segawa T;Kato M;Yanagisawa M;Ueda K;Kuwano R;Suzuki M;Moritomo T;Sakai T.;宮口英夫・土屋健司・森健一・田口哲菊池知彦・戸田龍樹;野中里佐
• 通讯作者: 野中里佐

海洋由来Vibrio sp. から大腸菌へ伝達されたテトラサイクリン耐性遺伝子挿入部位の解析

从海洋来源的弧菌转移到大肠杆菌的四环素抗性基因的插入位点分析。

• 发表时间: 2008
• 作者: Kato M;Itou T;Nagatsuka N;Sakai T.;野中里佐
• 通讯作者: 野中里佐

養殖場で使用される抗菌薬と耐性菌汚染

养鱼场使用的抗生素和耐药细菌污染

• 发表时间: 2010
• 期刊: 臨床と微生物
• 作者: 山下香菜;勝木俊雄;藤原健;外崎真理雄;明石浩司;池田英樹;Yamashita K;山下香菜;山下香菜;山下香菜;野中里佐
• 通讯作者: 野中里佐

水産領域における耐性菌-海洋における薬剤耐性遺伝子の分布とその伝達メカニズム-養殖場からペンギンまで

渔业中的耐药细菌 - 海洋中耐药基因的分布及其传播机制 - 从养鱼场到企鹅

• 发表时间: 2010
• 作者: Segawa T;et al.;野中里佐
• 通讯作者: 野中里佐