Detection of adaptive divergence between the Japan Sea and Pacific Ocean lineages for a fish: ecological genomic analysis

检测日本海和太平洋鱼类谱系之间的适应性分歧：生态基因组分析

• 批准号: 20780139
• 负责人: KOKITA Tomoyuki
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Fukui Prefectural University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20780139/
• 关键词: 適応的分化; 局所適応; 自然選択; 魚類; 海洋生態系; エコゲノミクス; 適応進化; 自然淘汰; 遺伝資源

Population genomic analyses were conducted using the anadromous fish Leucopsarion petersii as a model system to detect adaptive divergence among populations within a single species in marine environments. Genome scan using many microsatellites and candidate gene markers revealed that there were genomic signatures of positive selection in the Japan Sea lineage of this species. Thus, it is strongly suggested that adaptive divergence have occurred between the Japan Sea and Pacific Ocean lineages of this species.

以彼得氏雅罗鱼（Leucopsarionpetersii）为模型系统，进行了种群基因组分析，以检测海洋环境中单个物种内种群间的适应性分化。利用多个微卫星和候选基因标记进行的基因组扫描显示，该物种在日本海谱系中存在正选择的基因组特征。因此，这是强烈建议，适应性分歧之间发生的日本海和太平洋血统的这个物种。

项目成果

自然集団の適応的分化の検出-モデル系としての日本在来魚-

自然种群适应性分化的检测-以日本本土鱼类为模型系统-

• 发表时间: 2010
• 期刊: 月刊海洋
• 作者: 小北智之;山平寿智
• 通讯作者: 山平寿智

「海洋環境変化と生物の小進化」ワークショップ「人為的環境下における進化のメカニズム、及び保全策への応用」

「海洋环境变化与生物微观进化」工作坊「人为环境的进化机制及其在保育措施中的应用」

• 发表时间: 2008
• 作者: 高橋明香;小北智之;高橋明香・小北智之;小北智之・森誠一;小北智之;小北智之
• 通讯作者: 小北智之

Heterochronic differences in fin development between latitudianl populations of the medaka Oryzais latipes (Actinopterygii : Adrianichthyidae)

青鳉（Actinopterygii：Adrianichthyidae）纬度种群之间鳍发育的异时性差异

• 发表时间: 2009
• 期刊: Biological Journal of the linnean Society 97
• 作者: M.Kawajiri;T.Kokita;K.Yamahira
• 通讯作者: K.Yamahira

歴史的変動海洋環境におけるシロウオ集団の適応的分化-エコゲノミクスからのアプローチ-

历史变化的海洋环境中白鲑种群的适应性分化 - 生态基因组学的方法 -

• 发表时间: 2010
• 期刊: 月刊海洋 42巻
• 作者: 小北智之;山平寿智;小北智之
• 通讯作者: 小北智之

Isolation and characterization of polymorphic trinucleotide and dinucleotide microsateRite loci for the ice goby, Leucopsarion petersii

冰虾虎鱼 Leucopsarion petersii 多态性三核苷酸和二核苷酸微卫星位点的分离和表征

• 发表时间: 2008
• 期刊: Molecular Ecology Resources 8
• 作者: T. Kokita;S. Takahashi
• 通讯作者: S. Takahashi