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ニホンタンポポとセイヨウタンポポの雑種の進化：戻し交配による局所適応仮説の検証

日本蒲公英和西方蒲公英杂交的进化：通过回交验证局部适应假说

基本信息

批准号：
12J04061
负责人：
満行知花
金额：
$ 1.15万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012 至 2013
项目状态：
已结题

项目摘要

私はこれまで、種子を無性的につける外来種セイヨウタンポポが、有性生殖を行うニホンタンポポと花粉を通して繰り返し交配し、ニホンタンポポの持つ耐病性遺伝子(R-gene)を受け取る事で日本の環境に適応進化している、という仮説を検証する事を目的に研究を行ってきた。平成25年度はまず、雑種が野外でニホンタンポポと繰り返しの交配を行っているという結果を論文にまとめ、Plant Systematcs and Evolution誌に投稿、受理された。耐病性遺伝子の実験では、ニホンタンポポ、雑種、セイヨウタンポポ、レタスについて縮重PCR, クローニングを行い、合計732個のR-geneを得た。その結果、タンポポはレタスの20のRGCサブファミリーのうち14個を共有していたが、各サブファミリー内では、レタスとタンポポは大きく異なり、タンポポ属特有の多様なR-geneが見られた。この結果は菌叢比較で用いられるUniFracによるID Clusteringによっても支持された。これらのR-geneは、タンポポ属に特異的な病原体との共進化の結果生じたと考えられる。また、セイヨウタンポポとニホンタンポポとが高いブートストラップ値で異なるクラスター4つのうち3つは、雑種はセイヨウタンポポと配列を共有しており、更に、雑種特有の配列が11個見られた。これらの結果は、当初の予測に反し、雑種がニホンタンポポの配列をあまり共有していない事を示している。これは、病原体側がニホンタンポポのcommon genotypeに適応している状態を考えると説明出来る。その場合、雑種は同所的な在来種の一般的な遺伝子型を共有しない方が有利だろう。雑種は、雑種化によって受け取った在来種の稀なアリルを保持する事で病原体の感染を逃れているかもしれない。

In order to study the evolution of Japan's environmental adaptation, the research was carried out for the purpose of identifying and identifying alien species, mating, sexual reproduction, pollen passage, mating, and resistance genes. Heisei 25 years, plant species and field, plant species and evolution, Plant species and evolution, plant species, plant species and Evolution, plant 732 R-genes in total were obtained for the disease resistance genes. The results of the study show that there are 20 RGC pairs, 14 RGC pairs, and a variety of R-gene pairs. This results in a flora comparison using UniFrac and ID Clustering. The R-gene of the virus is a general-specific pathogen and co-evolves as a result. There are 11 common, more specific and species-specific arrangements in the list of the most common, most common and species-specific arrangements. The results of this study are as follows: The pathogen side of the virus is the common genotype of the virus. In some cases, the seed is the same as the seed, and the seed type is common. The infection of the pathogen can be prevented by the isolation of the seed and the isolation of the seed.