Detecting selective sweeps along the Drosophila melanogaster X chromosome

Pirmäres Ziel dieses es Projektes ist es，MIT Hilfe von Single NNP Selektion(SNPs)ABDRücke der natürlichen Selektion(选择性扫描)auf DEM X-Chromosom von DroSingila Blackogaster zu lokalisieren.大足是一种遗传变异，遗传变异是遗传变异的结果。该基因全长40kb，是一种新型的基因重组技术。人口数量：非洲和欧洲人口分别为10000-15000人和10000-15000人。麻省理工学院的希尔夫看到可能性-比率测试在Einem Zweiten Schritt untersuht，焊接和分析的基因组在Verangenheit在DEM Eifuss der natürlicchen Selektion Gelekden haben。这是一项非常重要的工作，也是一项重要的工作。(I)死亡比率von deductionen abzuschätzen(Dieser参数ist für die Evolution sbiologie von nowmer bedeutung，war aber schwerzu Messen)，以及(Ii)die gene zu身份识别和zu分析，死亡和更适应von D.Blackogaster an Neue栖息地之间的环境。

Primäres Ziel dieses Projektes ist es, mit Hilfe von single nucleotide polymorphisms (SNPs) Abdrücke der natürlichen Selektion (selective sweeps) auf dem X-Chromosom von Drosophila melanogaster zu lokalisieren. Dazu wird zunächst die genetische Variabilität für eine grosse Anzahl von Genom-Abschnitten mittels Sequenzieren gemessen. Diese Messungen werden durchschnittlich alle 40 kb in jenem Bereich des X-Chromosoms vorgenommen, der eine mittlere bis hohe Rekombinationsrate aufweist. Zwei Populationen werden verglichen: Eine anzestrale Population von Afrika und eine Population von Europa; letztere ist durch die postglaziale Ausbreitung von D. melanogaster in den letzten 10 000 - 15 000 Jahren erst entstanden. Mit Hilfe eines likelihood-ratio-test wird dann in einem zweiten Schritt untersucht, welche der analysierten Genom-Abschnitte in der Vergangenheit unter dem Einfluss der natürlichen Selektion gestanden haben. Darüber hinaus wird mit diesem Verfahren der Selektionskoeffizient (Intensität des Selektionsereignisses) gemessen und die Target-Stelle der Selektion im Genom bestimmt. Die längerfristigen Ziele dieses Projektes sind, (i) die Rate von vorteilhaften Substitutionen abzuschätzen (dieser Parameter ist für die Evolutionsbiologie von enormer Bedeutung, war aber bisher schwer zu messen), und (ii) die Gene zu identifizieren und zu analysieren, die an der Adaptation von D. melanogaster an neue Habitate beteiligt sind.