バイオインフォマティックスとプロテオミクスを駆使した新規薬物輸送担体の同定戦略

利用生物信息学和蛋白质组学识别新型药物转运载体的策略

• 批准号: 20659021
• 负责人: 大槻 純男
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20659021/
• 关键词: プロテオミクス; インフォマティックス; トランスポーター; 膜タンパク質; 薬学; 定量的プロテオミクス; 細胞膜

本課題は、バイオインフォマティックスによるタンパク質構造、局在情報および質量分析装置を用いたプロテオミクスによるタンパク質の特性情報を用いることによって、従来とは異なる方法論を用いて新規薬物輸送担体を同定することを目的とする。本年度は、昨年度絞り込んだ候補タンパク質について発現ベクターを構築し、ほ乳類細胞に導入することによって安定発現細胞を構築した。さらに、30化合物についてLC-MS/MSの定量系を構築した。樹立した安定発現培養細胞及び化合物ライブラリを用いて候補分子に輸送される化合物の探索をおこなった結果、取り込まれる化合物の同定に成功した。取り込み実験によって、細胞内に取り込まれる化合物及び細胞から排出される可能性のある化合物を同定した。一つの化合物についてL体及びD体を用いて輸送解析を行ったところ、立体選択的に輸送されることが明らかとなった。また、この化合物の輸送に関する阻害効果を複数の化合物について検討し、複数の阻害剤を同定した。今後は、in vivoにおける機能及び局在解析を行うことによって、薬物動態にかかわる新たなトランスポーターとその機能が明らかになることが期待される。

This subject is aimed at the application of qualitative structure, local information and quality analysis equipment to the determination of new drug delivery carriers. This year, we have been working on the construction of stable development cells for the introduction of breast cells. A quantitative LC-MS/MS system for 30 compounds was constructed. Establishment of stable culture cells and identification of compounds using candidate molecules for delivery The same is true for compounds extracted from cells and compounds excreted from cells. A chemical compound can be used to analyze the transport of L and D molecules, and the transport of stereo molecules can be used to analyze the transport of L and D molecules. For example, the transport of these compounds is related to the inhibition effect of a plurality of compounds, and a plurality of inhibitors are determined. In the future, the function of in vivo analysis and the function of in vivo analysis will be expected.

项目成果

VALIDATION OF HUMANIZED LIVER OF CHIMERIC MICE AS A MODEL OF HUMAN LIVER BASED ON TRANSPORTER AND P450 ENZYME PROTEIN EXPRESSIONS BY QUANTITATIVE TARGETED ABSOLUTE PROTEOMICS

通过定量靶向绝对蛋白质组学验证基于转运蛋白和 P450 酶蛋白表达的嵌合小鼠人源化肝脏作为人类肝脏模型

• 发表时间: 2009
• 作者: Yoshio Hayashi;Thomas. Regnier;Shigenobu Nishiguchi;他9人;Yukie Ando;Tera M;Yashiroda Y;Ohishi T;Migita T;Kobayashi Y;Mashima T;Mashima T;Seimiya H;Mashima T;Mashima T;McCabe N;Yeung BH;Migita T;Mashima T;右田敏郎;岡部幸子;清宮啓之;右田敏郎;右田敏郎;右田敏郎;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;清宮啓之;岡部幸子;岡部幸子;馬島哲夫;大槻純男;大槻純男;川上裕貴
• 通讯作者: 川上裕貴

バイオインフォマティクス及びプロテオミクスを利用した新規トランスポーターの候補分子の探索

利用生物信息学和蛋白质组学寻找新的转运蛋白候选分子

• 发表时间: 2008
• 作者: 田中晃一;Chang Hui Li;加々美綾乃;渡邊嘉典;相澤三四郎
• 通讯作者: 相澤三四郎

バイオインフォマティクスとプロテオミクスを利用した新規トランスポーターの候補分子の探索

利用生物信息学和蛋白质组学寻找新型转运蛋白候选分子

• 发表时间: 2008
• 作者: Yoshio Hayashi;Thomas. Regnier;Shigenobu Nishiguchi;他9人;Yukie Ando;Tera M;Yashiroda Y;Ohishi T;Migita T;Kobayashi Y;Mashima T;Mashima T;Seimiya H;Mashima T;Mashima T;McCabe N;Yeung BH;Migita T;Mashima T;右田敏郎;岡部幸子;清宮啓之;右田敏郎;右田敏郎;右田敏郎;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;清宮啓之;岡部幸子;岡部幸子;馬島哲夫;大槻純男;大槻純男;川上裕貴;相澤三四郎
• 通讯作者: 相澤三四郎

New approach to drug design by quantitative membrane proteomics

通过定量膜蛋白质组学进行药物设计的新方法

• 发表时间: 2009
• 作者: Sakuno T;Tada K;Watanabe Y.;S. Ohtsuki
• 通讯作者: S. Ohtsuki

Multiplexed-MRMによるヒトメンブレンプロテオミクス解析-トリプル四重極質量分析計を用いた新しいアプローチによる膜タンパク質群の高感度同時定量-

使用多重 MRM 进行人膜蛋白质组学分析 - 使用三重四极杆质谱仪的新方法对膜蛋白进行高灵敏度同步定量 -

• 发表时间: 2009
• 作者: Yoshio Hayashi;Thomas. Regnier;Shigenobu Nishiguchi;他9人;Yukie Ando;Tera M;Yashiroda Y;Ohishi T;Migita T;Kobayashi Y;Mashima T;Mashima T;Seimiya H;Mashima T;Mashima T;McCabe N;Yeung BH;Migita T;Mashima T;右田敏郎;岡部幸子;清宮啓之;右田敏郎;右田敏郎;右田敏郎;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;清宮啓之;岡部幸子;岡部幸子;馬島哲夫;大槻純男;大槻純男
• 通讯作者: 大槻純男