臼蓋形成不全症におけるゲノムコピー数異常の解析とその臨床診断への応用

髋臼发育不良基因组拷贝数异常分析及其在临床诊断中的应用

• 批准号: 20659234
• 负责人: 関本 朝久
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: University of Miyazaki
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20659234/
• 关键词: 臼蓋形成不全症; ゲノムコピー数多型; CNV

ヒトゲノムには新たなゲノム構造異常としてCopy Number Variation (CNV)の存在が注目され、ゲノム上の様々な遺伝子全体および制御領域を含むユニット数の多様性を示すこのDNA多型が、ヒトゲノム上の多くの遺伝子の遺伝子配列または遺伝子の制御に影響を与えることが報告されてきている。しかし未だ臼蓋形成不全症の感受性遺伝子の解析について、このCNVの関与に着目した研究は行われていないので本研究を計画した。昨年度の1次スクリーニングのゲノムワイドCNVビーズチップ解析により、臼蓋形成不全症の病態に関与が示唆されるゲノム構造変化を19領域検出した。今年度は1次スクリーニングで高頻度にCNVが認められた疾患感受性候補領域について、候補領域に特化した高密度オリゴヌクレオチドマイクロアレイを作製し、患者32名、健常者16名についてCNVタイピングを行い、moving average法により検証解析を行った。結果は患者で高頻度に認められ再現性のあるゲノム構造変化を次の様に認めた。1つは第1番染色体のゲノムポジション10.2Mb周辺にゲノム欠失を認めた。このゲノム変化はKinesin family member 1B(KIF1B)遺伝子を含む領域であり、患者32名中11名で認め健常者では認められなかった。2つ目は第7番染色体のゲノムポジション132.35Mb周辺にゲノム欠失を認めた。このゲノムの変化はHomo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing3(CHCHD3)遺伝子を含む領域であり、患者32名中6名で認め健常者では認められなかった。これらの遺伝子は臼蓋形成不全症の発症に関与することが示唆され、今後は他の候補領域を検証するとともにさらに症例数を増やしてより詳細な解析を進める予定である。

There is a lot of attention in the system of Copy Number Variation (CNV). The number of data in the field of control indicates that there are multiple types of DNA in the field of control. The formation of hypothalamus, the receptivity of the disease, the analysis of the symptoms, the CNV and the objective of the study. Last year, there was an analysis of the symptoms of CNV syndrome, the symptoms of insufficiency, and the indication and abetment of the disease. This year, there were 32 patients, 16 normal subjects, 32 patients, and 16 normal subjects. There were 32 patients and 16 normal subjects. There was a high degree of CNV disease in the field of disease receptivity, high density in the field of disease, high density in the field of disease. Results the patients had a high degree of disease, and the patients had a serious sexual injury. 1. The number of chromosomes on the 1st chromosome was significantly higher than that on the 10.2Mb. The child of Kinesin family member 1B (KIF1B) contains domain knowledge, and 11 of the 32 patients are diagnosed as normal. 2. There is no recognition of chromosome 7 on chromosome 7 of 132.35Mb. The child of Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing3 (CHCHD3) contains 6 out of 32 patients who are healthy and healthy. In the future, we are waiting for the number of cases of incomplete disease in the field of health care in the future.

项目成果

臼蓋形成不全症のCNV解析

髋臼发育不全的CNV分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 赤荻博;三島初;酒井晋介;西野衆文;吉岡友和;石井朝夫;落合直之;宮川俊平;赤荻博 三島初 酒井晋介 西野衆文 吉岡友和 石井朝夫 落合直之 宮川俊平;赤荻博 三島初 酒井晋介 吉岡友和 万本健生 福田恵子 李梅花 石井朝夫 落合直之 宮川後平;関本朝久
• 通讯作者: 関本朝久