Elucidation of reaction mechanism for post-transcriptional modification at tRNA anticodon region
Elucidation of reaction mechanism for post-transcriptional modification at tRNA anticodon region
批准号:
20687007
负责人:
NUMATA Tomoyuki
金额:
$16.47万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2010
中文摘要
tRNA^ UUC、tRNA^ UUU、tRNA^UUG中tRNA反密码子(U34)第一位的尿苷<Glu><Lys><Gln>被修饰为5-羧甲基氨基甲基-2-硫代尿苷(cmnm^5s^2U),这对遗传密码的精确解码至关重要。在真细菌中,两种保守蛋白GidA和MnmE负责将cmnm 5基团添加到U34的5位。在这里,我们报告的晶体结构的GidA和MnmE。结合突变研究,我们提出了cmnm^5U修饰过程的新机制。
英文摘要
The uridine at the first position of the tRNA anticodon (U34) in tRNA^<Glu>UUC, tRNA^<Lys>UUU, tRNA^<Gln>UUG is modified to 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine (cmnm^5s^2U), which is crucial for the precise decoding of the genetic code. In eubacteria, two conserved proteins, GidA and MnmE, are responsible for adding the cmnm5 group to the 5-position of U34. Here we report the crystal structures of GidA and MnmE. Together with the mutational study, we propose a novel mechanism for the cmnm^5U modification process.
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Mechanism for the alteration of the substrate specificities of template-independent RNA polymerases.
DOI:
10.1016/j.str.2010.12.006
发表时间:
2011-02
期刊:
Structure
影响因子:
5.7
作者:
[Y. Toh;D. Takeshita;Takashi Nagaike;T. Numata;K. Tomita]
通讯作者:
Y. Toh;D. Takeshita;Takashi Nagaike;T. Numata;K. Tomita
tRNAアンチコドンの修飾に関わる酵素GidAにおいて保存されているシステインは5-カルボキシメチルアミノメチルウリジン生合成に不可欠である
GidA 中的保守半胱氨酸是一种参与 tRNA 反密码子修饰的酶,对于 5-羧甲基氨基甲基尿苷生物合成至关重要
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[大澤拓生, 伊藤耕一, 稲永英子, 沼田倫征]
通讯作者:
沼田倫征
tRNA揺らぎ塩基の修飾に関わる酵素の構造機能解析(1)
参与tRNA波动碱基修饰的酶的结构和功能分析(1)
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[大澤拓生, 伊藤耕一, 稲永英子, 沼田倫征]
通讯作者:
沼田倫征
DOI:
10.1038/nchembio.323
发表时间:
2010-04-01
期刊:
NATURE CHEMICAL BIOLOGY
影响因子:
14.8
作者:
[Ikeuchi, Yoshiho, Kimura, Satoshi, Suzuki, Tsutomu]
通讯作者:
Suzuki, Tsutomu
DOI:
10.1016/j.str.2009.03.013
发表时间:
2009-05-13
期刊:
STRUCTURE
影响因子:
5.7
作者:
[Osawa, Takuo, Ito, Koichi, Numata, Tomoyuki]
通讯作者:
Numata, Tomoyuki
共 17 条
Elucidation for the mitochondrial tRNA processing mechanism
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批准号:23687015
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$17.47万
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财政年份:2011
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负责人:NUMATA Tomoyuki
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依托单位:
海外基金