Elucidation of reaction mechanism for post-transcriptional modification at tRNA anticodon region
阐明 tRNA 反密码子区域转录后修饰的反应机制
基本信息
- 批准号:20687007
- 负责人:
- 金额:$ 16.47万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 2010
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
The uridine at the first position of the tRNA anticodon (U34) in tRNA^<Glu>UUC, tRNA^<Lys>UUU, tRNA^<Gln>UUG is modified to 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine (cmnm^5s^2U), which is crucial for the precise decoding of the genetic code. In eubacteria, two conserved proteins, GidA and MnmE, are responsible for adding the cmnm5 group to the 5-position of U34. Here we report the crystal structures of GidA and MnmE. Together with the mutational study, we propose a novel mechanism for the cmnm^5U modification process.
在tRNA^<;Glu>;uuc,tRNA^<;Lys>;Uuu,tRNA^<;Gln>;UUG中,tRNA反密码子(U34)第一位的尿苷被修饰为5-羧甲基氨甲基-2-硫代尿苷(cmnm^5s^2U),这对基因密码的精确解码是至关重要的。在真细菌中,两个保守的蛋白质GIDA和MnmE负责将cmnm5基团添加到U34的5位。本文报道了GIDA和MnME的晶体结构。结合突变研究,我们提出了cmnm^5U修饰过程的一种新机制。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Mechanism for the alteration of the substrate specificities of template-independent RNA polymerases.
- DOI:10.1016/j.str.2010.12.006
- 发表时间:2011-02
- 期刊:
- 影响因子:5.7
- 作者:Y. Toh;D. Takeshita;Takashi Nagaike;T. Numata;K. Tomita
- 通讯作者:Y. Toh;D. Takeshita;Takashi Nagaike;T. Numata;K. Tomita
tRNAアンチコドンの修飾に関わる酵素GidAにおいて保存されているシステインは5-カルボキシメチルアミノメチルウリジン生合成に不可欠である
GidA 中的保守半胱氨酸是一种参与 tRNA 反密码子修饰的酶,对于 5-羧甲基氨基甲基尿苷生物合成至关重要
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:大澤拓生;伊藤耕一;稲永英子;沼田倫征
- 通讯作者:沼田倫征
tRNA揺らぎ塩基の修飾に関わる酵素の構造機能解析(1)
参与tRNA波动碱基修饰的酶的结构和功能分析(1)
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:大澤拓生;伊藤耕一;稲永英子;沼田倫征
- 通讯作者:沼田倫征
Agmatine-conjugated cytidine in a tRNA anticodon is essential for AUA decoding in archaea
- DOI:10.1038/nchembio.323
- 发表时间:2010-04-01
- 期刊:
- 影响因子:14.8
- 作者:Ikeuchi, Yoshiho;Kimura, Satoshi;Suzuki, Tsutomu
- 通讯作者:Suzuki, Tsutomu
tRNA揺らぎ塩基の5-カルボキシメチルアミノメチル化修飾に関わる酵素GidAおよびMnmEの構造機能解析
参与tRNA波动碱基5-羧甲基氨基甲基化修饰的酶GidA和MnmE的结构和功能分析
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:大澤拓生;稲永英子;沼田倫征
- 通讯作者:沼田倫征
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
NUMATA Tomoyuki其他文献
NUMATA Tomoyuki的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('NUMATA Tomoyuki', 18)}}的其他基金
Elucidation for the mitochondrial tRNA processing mechanism
阐明线粒体 tRNA 加工机制
- 批准号:
23687015 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 16.47万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
相似海外基金
RNAの転写後修飾の網羅的な定量法の開発
开发定量 RNA 转录后修饰的综合方法
- 批准号:
24K01517 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 16.47万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
ラン科植物における転写後修飾によるエピジェネティックなクロマチン動態の研究
通过兰科植物转录后修饰研究表观遗传染色质动态
- 批准号:
14F03399 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 16.47万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
人工細胞モデル構築のためのRNA転写後修飾複合体装置の試験管内再構成
用于构建人工细胞模型的RNA转录后修饰复杂装置的体外重建
- 批准号:
18048032 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 16.47万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
Ewing肉腫がん遺伝子・EWSの転写後修飾と悪性腫瘍発生の分子機構の解析
尤文肉瘤癌基因/EWS转录后修饰与恶性肿瘤发生发展的分子机制分析
- 批准号:
16021207 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 16.47万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
55ーKDa多機能蛋白による生理活性蛋白の転写後修飾機構…ホルモンによる機能発現調節と蛋白質工学への応用…
55-KDa多功能蛋白对生理活性蛋白的转录后修饰机制...激素功能表达的调控及其在蛋白质工程中的应用...
- 批准号:
02670988 - 财政年份:1990
- 资助金额:
$ 16.47万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
コドン AUA に特異的な tRNA の転写後修飾による機能発現の分子機構
密码子 AUA 特异性 tRNA 转录后修饰功能表达的分子机制
- 批准号:
60214009 - 财政年份:1985
- 资助金额:
$ 16.47万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Special Project Research
コドンAUAに特異的なtRNAの転写後修飾による機能発現の分子機構
密码子 AUA 特异性 tRNA 转录后修饰功能表达的分子机制
- 批准号:
59222005 - 财政年份:1984
- 资助金额:
$ 16.47万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Special Project Research