Elucidation of reaction mechanism for post-transcriptional modification at tRNA anticodon region

阐明 tRNA 反密码子区域转录后修饰的反应机制

基本信息

项目摘要

The uridine at the first position of the tRNA anticodon (U34) in tRNA^<Glu>UUC, tRNA^<Lys>UUU, tRNA^<Gln>UUG is modified to 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine (cmnm^5s^2U), which is crucial for the precise decoding of the genetic code. In eubacteria, two conserved proteins, GidA and MnmE, are responsible for adding the cmnm5 group to the 5-position of U34. Here we report the crystal structures of GidA and MnmE. Together with the mutational study, we propose a novel mechanism for the cmnm^5U modification process.
在tRNA^&lt;Glu&gt;uuc,tRNA^&lt;Lys&gt;Uuu,tRNA^&lt;Gln&gt;UUG中,tRNA反密码子(U34)第一位的尿苷被修饰为5-羧甲基氨甲基-2-硫代尿苷(cmnm^5s^2U),这对基因密码的精确解码是至关重要的。在真细菌中,两个保守的蛋白质GIDA和MnmE负责将cmnm5基团添加到U34的5位。本文报道了GIDA和MnME的晶体结构。结合突变研究,我们提出了cmnm^5U修饰过程的一种新机制。

项目成果

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Mechanism for the alteration of the substrate specificities of template-independent RNA polymerases.
  • DOI:
    10.1016/j.str.2010.12.006
  • 发表时间:
    2011-02
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Y. Toh;D. Takeshita;Takashi Nagaike;T. Numata;K. Tomita
  • 通讯作者:
    Y. Toh;D. Takeshita;Takashi Nagaike;T. Numata;K. Tomita
tRNAアンチコドンの修飾に関わる酵素GidAにおいて保存されているシステインは5-カルボキシメチルアミノメチルウリジン生合成に不可欠である
GidA 中的保守半胱氨酸是一种参与 tRNA 反密码子修饰的酶,对于 5-羧甲基氨基甲基尿苷生物合成至关重要
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大澤拓生;伊藤耕一;稲永英子;沼田倫征
  • 通讯作者:
    沼田倫征
tRNA揺らぎ塩基の修飾に関わる酵素の構造機能解析(1)
参与tRNA波动碱基修饰的酶的结构和功能分析(1)
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大澤拓生;伊藤耕一;稲永英子;沼田倫征
  • 通讯作者:
    沼田倫征
Agmatine-conjugated cytidine in a tRNA anticodon is essential for AUA decoding in archaea
  • DOI:
    10.1038/nchembio.323
  • 发表时间:
    2010-04-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    14.8
  • 作者:
    Ikeuchi, Yoshiho;Kimura, Satoshi;Suzuki, Tsutomu
  • 通讯作者:
    Suzuki, Tsutomu
tRNA揺らぎ塩基の5-カルボキシメチルアミノメチル化修飾に関わる酵素GidAおよびMnmEの構造機能解析
参与tRNA波动碱基5-羧甲基氨基甲基化修饰的酶GidA和MnmE的结构和功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大澤拓生;稲永英子;沼田倫征
  • 通讯作者:
    沼田倫征
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