Studies on archaeal antioxidation system involving thioredoxin proteins
涉及硫氧还蛋白的古菌抗氧化系统的研究
基本信息
- 批准号:21510237
- 负责人:
- 金额:$ 2.91万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2009
- 资助国家:日本
- 起止时间:2009 至 2011
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
In order to elucidate the evolution process of antioxidation system in life from the viewpoint of protein science, we structurally characterized archaeal peroxiredoxin(Prx) and related antioxidant proteins. Especially, structure determination of the complex of Prx and its substrate, hydrogen peroxide, enabled discussion on the very early stage and the transition state of the Prx reaction. Furthermore, we determined the 3D structure of an archaeal cambialistic superoxide dismutase, which revealed the relationship between metal selectivity and the local 3D structure of the enzyme. Elucidation of protein reaction mechanism involving hydrogen atoms needs collection of neutron diffraction data of the protein. We developed methods for obtaining large protein crystals for the purpose of the neutron diffraction study.
为了从蛋白质科学的角度阐明生命中抗氧化系统的进化过程,对古细菌过氧化物氧还蛋白(Prx)及其相关抗氧化蛋白进行了结构表征。特别是,结构测定的复杂的Prx和它的底物,过氧化氢,使讨论的非常早期阶段和过渡态的Prx反应。此外,我们确定了古生菌形成型超氧化物歧化酶的三维结构,这揭示了金属选择性和当地的三维结构的酶之间的关系。蛋白质氢原子反应机理的阐明需要收集蛋白质的中子衍射数据。我们开发了获得大的蛋白质晶体的中子衍射研究的目的的方法。
项目成果
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专利数量(0)
ペルオキシレドキシンの酸化反応における超原子価中間体の結晶解析
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- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:杉山康憲;広瀬健太郎;吉種光;亀下勇;深田吉孝;中村努
- 通讯作者:中村努
Aeropyrum pernix K1由来cambialistic SODの立体構造と金属選択性
Aeropyrum pernix K1 形成层 SOD 的三维结构和金属选择性
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:中村努;鳥養香澄;上垣浩一;森田潤司
- 通讯作者:森田潤司
Hypervalent intermediate in the oxidation of archaeal peroxiredoxin
古菌过氧化还原蛋白氧化过程中的高价中间体
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:丹羽一樹;加藤太一郎;中村努
- 通讯作者:中村努
Crystal structure of the cambialistic superoxide dismutase from Aeropyrum pernix K1 – insights into the enzyme mechanism and stability
- DOI:10.1111/j.1742-4658.2010.07977.x
- 发表时间:2011-02
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Tsutomu Nakamura;K. Torikai;K. Uegaki;J. Morita;Kodai Machida;Atsushi Suzuki;Y. Kawata
- 通讯作者:Tsutomu Nakamura;K. Torikai;K. Uegaki;J. Morita;Kodai Machida;Atsushi Suzuki;Y. Kawata
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