Computational Science Study of Similarities and Differences between bacterial Ice-Nucleating Protein and Insect Anti-Freeze Protein

细菌冰核蛋白与昆虫抗冻蛋白异同的计算科学研究

基本信息

项目摘要

In this project, similarities and differences between bacterial ice-nucleating protein(INP) and insect antifreeze protein(AFP) were studied using both computer simulation and ice crystal growth experiment. The results suggested that as a similarity, both INP and AFP are the proteins that significantly alter the anisotropy in ice crystal growth rate. The results also suggested that as a difference, INP binds selectively to ice basal planes, whereas AFP binds to both ice basal and prismatic planes. In conclusion, both INP and AFP are ice-binding proteins. However, the structure of INP is thought to be different from the structure of AFP.
本课题采用计算机模拟和冰晶生长实验相结合的方法,研究了细菌冰核蛋白(INP)和昆虫抗冻蛋白(AFP)的异同。结果表明,作为一个相似的,INP和AFP是显着改变冰晶生长速率的各向异性的蛋白质。结果还表明,作为一个差异,INP选择性地结合到冰基面,而AFP结合到冰基面和棱柱面。总之,INP和AFP都是冰结合蛋白。然而,INP的结构被认为与AFP的结构不同。

项目成果

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A challenge to observe ice growth shape in molecular dynamics simulation
分子动力学模拟中观察冰生长形状的挑战
Growth inhibition at the ice prismatic plane induced by a spruce budworm antifreeze protein : a molecular dynamics simulation study
云杉芽虫抗冻蛋白诱导的冰棱面生长抑制:分子动力学模拟研究
  • DOI:
    10.1039/c1cp21929d
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    F. Mikami;K. Matsuda;H. Kataura;Y. Maniwa;灘浩樹,古川義純
  • 通讯作者:
    灘浩樹,古川義純
Growth mechanism of tetrahydrofuran clathrate hydrate : a molecular dynamics study
四氢呋喃笼形水合物的生长机理:分子动力学研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    灘浩樹
  • 通讯作者:
    灘浩樹
バクテリア氷核タンパク質が氷の結晶成長に与える影響
细菌冰核蛋白对冰晶生长的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    灘浩樹;古川義純、S.Zepeda
  • 通讯作者:
    古川義純、S.Zepeda
Growth mechanism of tetrahydrofuran clathrate hydrate
四氢呋喃笼形水合物的生长机理
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    尾澤岬;黒岩健;池田昌司;宮崎州正;灘浩樹
  • 通讯作者:
    灘浩樹
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