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てんかんの責任遺伝子・AED代謝関連遺伝子多型に基づく個別化治療

基于癫痫基因和AED代谢相关基因多态性的个体化治疗

基本信息

批准号：
09J00058
负责人：
吉田秀一
金额：
$ 0.45万
依托单位：
Hirosaki University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09J00058/
关键词：
てんかん遺伝子診断個別化治療表現型予測

项目摘要

近年の研究の進展により、てんかんにおいても遺伝情報を基にした個別化治療の可能性が見えてきている。しかしながら、同じ責任遺伝子であっても幅広い臨床スペクトラムを持ち、遺伝子型-表現型が明確ではないことなどから、遺伝子異常の同定が必ずしも診断や予後予測へ結びつかないなどの課題も多い。そこで、本研究では、てんかん個別化治療開発に向けた種々の課題を解決するため、以下について研究を実施した。1.SCN1A関連てんかんにおける遺伝子型-表現型関連解析これまでに報告されている155のSCN1Aミスセンス変異を、臨床症状における重症群の割合から3群(GEFS+群、中間群、SRIEE群)に分類し、遺伝子変異によるアミノ酸置換前後での物理化学的特性変化と表現型との関連を検討した。その結果、同じミスセンス変異であっても置換されるアミノ酸の物理化学的性質変化の大きさが表現型や臨床症状に大きく影響し、また、これら指標差を用いて、てんかんの重篤度をある程度予測できることを示した。将来的には、新規変異に対しても、その変異が表現型に及ぼす影響をある程度推測することにより、臨床的には予後予測につながっていくことが期待される。2.てんかん遺伝子診断用DNAチップ及び診断システムの開発CustomSeq Resquencing Arrayを基に、遺伝子型を決定したい14のてんかん責任遺伝子の配列プローブを設計・搭載した。また、てんかんの遺伝子診断用DNAチップによる遺伝子診断システムの一角を担うてんかん責任遺伝子変異データベースも構築した。高い精度でてんかん責任遺伝子の変異判定が可能なことを確認し、てんかん個別化治療開発の根幹となるてんかん遺伝子診断用DNAチップ解析システムを用いた遺伝子型判定のプロトコルを確立した。

Recent advances in research on the basis of genetic information and the possibility of individualized therapy are discussed. For example, if a patient is diagnosed as having an abnormal phenotype, he or she should be able to diagnose the disease and predict the outcome of the disease. This study aims to solve the problem of individualized therapy development and implement the following research. 1. SCN1A association analysis was carried out to investigate the relationship between SCN1A gene expression and phenotype before and after acid replacement. The results show that the phenotypes and clinical symptoms of the disease are affected by the changes in physicochemical properties of the acid, and the differences in indicators are used to predict the severity of the disease. Future changes in phenotype and impact are expected. 2. Development of CustomSeq Resequencing Array for DNA chip diagnosis and diagnosis. DNA for gene diagnosis is a part of gene diagnosis system. High accuracy in determining the difference between the responsible genes, confirmation, and identification of the root cause of individualized therapy development, DNA analysis for gene diagnosis, and establishment of the gene type determination.