蛋白質活性に係わる分子間相互作用の固体NMRによる研究―βアミロイドを一例として

与蛋白质活性相关的分子间相互作用的固态核磁共振研究——以β淀粉样蛋白为例

基本信息

项目摘要

アルツハイマー病因ペプチドである42残基のβアミロイド(Aβ42)は、Met-35の硫黄原子のラジカル化を介して神経細胞毒性を示す。そこで、Aβ42凝集体のMet-35の硫黄原子を固体NMRにより解析することにより、ラジカル化ならびに毒性発現メカニズムが明らかになると考えた。しかしながら、NMR信号が観測可能な^<33>Sは天然存在比が0.76%、感度が^<13>Cの10分の1なので、明瞭な固体NMRスペクトルを得ることは極めて困難である。本研究では、^<33>S標識したAβ42を化学合成し、超高感度高分解能固体NMRが可能なクライオMASプローブを用いて解析することを目的とした。^<33>S標識L-メチオニンは市販されていないので、^<33>S単体を原料として合成した。まず、Boc-L-Asp-OtBuの側鎖カルボキシ基のボラン還元を行い、生じた水酸基をヨウ素化した。ヒドラジン存在下、硫黄単体と水酸化ナトリウムを反応させると安定な二硫化物イオンが得られるので、これと先のヨウ素化体のS_N2反応によりホモシスチンを得た。NaBH_4を用いてジスルフィド結合を開裂させた後、直ちにヨウ化メチルを加えてチオールのメチル化を行った。TFAによりBoc基とt-butyl ester基を脱保護することにより、^<33>S標識L-メチオニンを総収率22%で得ることに成功した。現在、本メチオニンを固相ペプチド合成に導入して、^<33>S標識Aβ42の合成を行っている。一方、CaS(^<33>Sは天然存在比)をモデル化合物として用いたクライオMAS固体NMR測定では、室温コイルに比べて約3倍のS/N比を得ることに成功した。現在、合成した^<33>S標識L-メチオニンを用いて、^<33>Sシグナルの検出ならびに測定条件の最適化を行っている。
β-amino acid residues (Aβ42) of Met-35 are implicated in neurotoxicity. The sulfur atom of Met-35 in Aβ42 condensate was analyzed by solid-state NMR. NMR signal detection <33>probability is 0.76%, sensitivity <13>is 10 min, and solid-state NMR signal detection is extremely difficult. In this study<33>, the chemical synthesis of Aβ42 and its ultra-high sensitivity and high decomposition energy were studied. <33>S logo L<33>- Boc-L-Asp-OtBu's side-lock mechanism is also known as the "acid" mechanism. In the presence of sulfur monomer, sulfur monomer and its hydrolysis reaction can be obtained. In the presence of sulfur monomer, sulfur monomer and its hydrolysis reaction can be obtained. NaBH_4 is used to make a connection between the two groups. TFA was successfully deprotected from Boc and t-butyl ester groups <33>by 22%. Now, <33>this paper introduces the synthesis of Aβ42 in solid phase. The ratio of <33>S/N was about 3 times higher than that at room temperature by MAS solid state NMR. Now, the synthesis of the <33>L-label <33>is carried out in the optimization of the determination conditions.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Pradimicin Aによるマンノース認識機構の固体NMR解析
普拉迪米星 A 甘露糖识别机制的固态核磁共振分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    中川優;ほか;中川優,増田裕一,山田啓太,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成
  • 通讯作者:
    中川優,増田裕一,山田啓太,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成
Sensitive ^<13>C-^<13>C correlation spectra of amyloid fibrils at very high spinning frequencies and magnetic fields
淀粉样原纤维在极高旋转频率和磁场下的敏感 ^<13>C-^<13>C 相关谱
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Yukihiro Hamasuna;Endo Yasunori;Sadaaki Miyamoto;Markus Weingarth
  • 通讯作者:
    Markus Weingarth
アミロイドβの毒性ターン構造特異的抗体
β淀粉样蛋白毒性转结构特异性抗体
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三隅健太;渡辺裕也;平井浩文;河岸洋和;亀井一郎;森智夫;近藤隆一郎;石川由希・三浦徹;Kaji K;内田浩二;村上一馬
  • 通讯作者:
    村上一馬
Solid-state NMR analysis of the molecular interaction of Pradimicin A with Ca^<2+>ion and mannose
Pradimicin A 与 Ca^2 离子和甘露糖分子相互作用的固态 NMR 分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yukihiro Hamasuna;Yasunori Endo;Sadaaki Miyamoto;Takashi Doi
  • 通讯作者:
    Takashi Doi
Analysis of Binding Sites of Curcumin in the Fibrils of 42-Residue Amyloid β-Protein (Aβ42) Using Solid-State NMR.
使用固态 NMR 分析 42 残基淀粉样蛋白 (Aβ42) 纤维中姜黄素的结合位点。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yukihiro Hamasuna;Yasunori Endo;Yuichi Masuda
  • 通讯作者:
    Yuichi Masuda
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

増田 裕一其他文献

アミロイドβの凝集を阻害するβ-ストランド配座固定ペプチドの設計と合成
抑制β淀粉样蛋白聚集的β链构象固定肽的设计与合成
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    田中 郁也;柴田 果奈;増田 裕一
  • 通讯作者:
    増田 裕一
固体NMRならびにESRによるβアミロイド(Aβ42)の毒性コンボメーションの解析
通过固态 NMR 和 ESR 分析 β-淀粉样蛋白 (Aβ42) 的毒性卷积
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    増田裕一;上村諭子;中西梓;大橋竜太郎;竹腰清乃理;入江一浩;増田 裕一;Yuichi Masuda;Kazuhiro Irie;増田 裕一
  • 通讯作者:
    増田 裕一
環状ペプチドPF1171ペンタペプチドとavellanin類の全合成と生物活性評価
环肽PF1171五肽和avellanin的全合成及生物活性评价
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    本田 将也;増田 裕一
  • 通讯作者:
    増田 裕一
環状ペプチドPF1171Fの生体内環境における立体配座のNMRによる解析
体内环境中环肽PF1171F构象的NMR分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    増田 裕一;佐野 萌佳;本田 将也;赤木 謙一
  • 通讯作者:
    赤木 謙一
Analysis of the turn structure in the 42-mer β-amyloid aggregates using solid-state NMR
使用固态 NMR 分析 42 聚体 β-淀粉样蛋白聚集体中的转角结构
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    増田裕一;上村諭子;中西梓;大橋竜太郎;竹腰清乃理;入江一浩;増田 裕一;Yuichi Masuda
  • 通讯作者:
    Yuichi Masuda

増田 裕一的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('増田 裕一', 18)}}的其他基金

アルツハイマー病因ペプチド凝集体の固体NMRによる立体構造解析
通过固态核磁共振对阿尔茨海默病致病肽聚集体进行三维结构分析
  • 批准号:
    06J03327
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似国自然基金

适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
  • 批准号:
    JCZRYB202500181
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
锌基复合金属氧化物催化CO2加氢反应的固体NMR谱学研究
  • 批准号:
    22372160
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
超极化增强的固体NMR方法及在分子筛催化不饱和醛选择性加氢反应中的应用研究
  • 批准号:
    22372179
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
分子筛上生物质加氢脱氧反应协同催化作用的固体NMR研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    54 万元
  • 项目类别:
    面上项目
光功能MOFs材料的构效关系及荧光检测水体污染物机理的高场固体NMR研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
    56 万元
  • 项目类别:
    面上项目
表面增强的二维固体NMR方法及在γ-Al2O3活性位研究中的应用
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
    60 万元
  • 项目类别:
单链高分子纳米粒子及其纳米复合材料微观结构和动力学的固体NMR研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
    60 万元
  • 项目类别:
    面上项目
高压LiCoO2的固体NMR与EPR研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
    60 万元
  • 项目类别:
    面上项目
高分子玻璃化转变机理的固体NMR研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    63 万元
  • 项目类别:
    面上项目
超高速魔角旋转下测量全质子化膜蛋白中1H-1H长程距离的固体NMR新方法
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    62 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

GPCRと共役蛋白質の構造アンサンブル相関-擬細胞内環境DNP固体NMRの確立
GPCR与偶联蛋白之间的结构系综相关性-伪细胞内环境的建立DNP固态NMR
  • 批准号:
    23K27115
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Pushing the Limits of High-Field Solid-State NMR Technology: Enhancing Applications to Advanced Materials, the Life Sciences and Pharmaceuticals
突破高场固态核磁共振技术的极限:增强先进材料、生命科学和制药的应用
  • 批准号:
    EP/Z532836/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
    Research Grant
Mechanism and Structure of Functional Materials by Solid-state NMR
通过固态核磁共振研究功能材料的机理和结构
  • 批准号:
    EP/X041751/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
    Fellowship
The UK High-Field Solid-State NMR National Research Facility: EPSRC Core Equipment Award 2022
英国高场固态核磁共振国家研究设施:2022 年 EPSRC 核心设备奖
  • 批准号:
    EP/X03481X/1
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
    Research Grant
GPCRと共役蛋白質の構造アンサンブル相関-擬細胞内環境DNP固体NMRの確立
GPCR与偶联蛋白之间的结构系综相关性-伪细胞内环境的建立DNP固态NMR
  • 批准号:
    23H02422
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Structural Studies of Proteins by Paramagnetic Solid-State NMR Spectroscopy
通过顺磁固态核磁共振波谱法研究蛋白质的结构
  • 批准号:
    2303862
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
    Standard Grant
500 MHz Solid State NMR Spectrometer
500 MHz 固态核磁共振波谱仪
  • 批准号:
    524658450
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
    Major Research Instrumentation
Replacement procurement: 200 MHz Solid-State NMR Spectrometer
更换采购:200 MHz 固态核磁共振波谱仪
  • 批准号:
    530325402
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
    Major Research Instrumentation
Console solid-state NMR 400 MHz
控制台固态 NMR 400 MHz
  • 批准号:
    527030253
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
    Major Research Instrumentation
Revealing the Cell Wall Organization of Fungal Pathogens and Structural Responses to Antifungal Drugs Using Cellular Solid-State NMR
使用细胞固态核磁共振揭示真菌病原体的细胞壁组织和抗真菌药物的结构反应
  • 批准号:
    10566511
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.79万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了