トゲネズミ三種の比較解析によるY染色体消失過程の推定

通过对三种多刺大鼠的比较分析估计Y染色体丢失过程

• 批准号: 09J01887
• 负责人: 村田 知慧
• 金额: $ 0.9万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09J01887/
• 关键词: Tokudaia; 性染色体; SRY; 進化; FISH; CGH; 分子系統解析; Zoo-FISH解析

トゲネズミ属3種のうち、アマミトゲネズミとトクノシマトゲネズミは、XO/XO型の性染色体構成をもち、Y染色体だけでなく性決定遺伝子SRYを消失した極めてめずらしい哺乳類である。一方、オキナワトゲネズミ(以下オキナワ)は、一般的なXX/XY型の性染色体をもつが、その性染色体は一対の常染色体の転座により大型化し、SRYは特異的なアミノ酸置換と重複により独自の進化を遂げている。トゲネズミ属のY染色体の進化過程を明らかにすることを目的とし、平成22年度はオキナワにおいて、性染色体のさらなる構造変化の有無の検出、祖先Y染色体領域の同定、SRYの機能性予測をおこなった。29のマウスのcDNAクローンを用いたFISH解析の結果、オキナワの祖先X染色体領域(Xq)および性染色体に転座した常染色体領域(Xp、Yp)は他のネズミ類の遺伝子オーダーと一致し、構造変化はみられなかった。ただし、アマミトゲネズミの性決定候補遺伝子であるCBX2が、オキナワにおいて常染色体の転座に伴い、性染色体に連鎖し、さらに他の染色体に重複していた。また、CGH解析の結果、オキナワのY染色体に性特異的な領域は検出されなかったが、単一のY連鎖遺伝子と同定されたDDX3YとUTYのcDNAクローンを用いたFISHの結果、両遺伝子はYpの動原体付近に存在し、祖先Y染色体領域がYp動原体付近に保持されていることをつきとめた。さらに、SOX9の精巣特異的エンハンサー領域にあるSRY結合配列の保存性を、マウス、ラット、ヒト、オキナワにおいて比較した結果、結合サイトの一つにオキナワ特異的な置換がみられ、保存性が失われていた。今回の結果から、トゲネズミ共通祖先はY染色体にいくつかのY連鎖遺伝子を保持していたことが明らかとなったが、SRYの機能はトゲネズミ共通祖先において、すでに低下もしくは消失していた可能性が考えられた。トゲネズミ属のY染色体進化を解明するために、オキナワは鍵となる重要な種であることが本研究によって強く示された。

The sex chromosome structure of XO/XO type is different, and the sex determining gene SRY is different. The sex chromosomes of XX/XY type are usually separated from each other, while the sex chromosomes of the autosome pair are enlarged and the SRY pair is specific to the evolution of acid substitution and duplication. The evolution process of Y chromosome in the genus of chromosome, the identification of ancestral Y chromosome domain, the functional prediction of SRY, and the identification of structural transformation of Y chromosome in Heisei 22. The results of FISH analysis of 29 cDNA fragments show that the ancestral X chromosome domain (Xq) and the sex chromosome domain (Xp, Yp) are identical to each other, and the structure is changed. The candidate genes for sex determination are CBX2, CBX3, CBX4, CBX6, CBX7, CBX8, CBX9, CBX9, CBX9 The results of CGH analysis and FISH analysis show that Y-linked genes are identified in the sex-specific domain of the Y chromosome, and Y-linked genes are identified in the cDNA library of DDX3Y and UTY. The Y-linked genes are closely related to Yp, and the ancestral Y chromosome domain is closely related to Yp. SOX9's fine and unique domain of SRY binding alignment preservation, preservation, substitution, preservation and loss of conservation. The common ancestry of the Y chromosome is preserved, and the function of the SRY is reduced. The evolution of the Y chromosome of the genus is explained in detail in this study.

项目成果

Multiple copies of SRY genes on the large Y chromosome of the Okinawa spiny rat, Tokudaia muenninki.

冲绳刺鼠 Tokudaia muenninki 的大 Y 染色体上存在多个 SRY 基因拷贝。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Chromosome Research
• 影响因子: 2.6
• 作者: Chie Murata;Fumio Yamada;Norihiro Kawauchi;Yoichi Matsuda;Asato Kuroiwa
• 通讯作者: Asato Kuroiwa

オキナワトゲネズミTokudaia muenninkiの性染色体とSRY遺伝子の進化

冲绳刺鼠Tokudaia muenninki性染色体和SRY基因的进化

• 发表时间: 2009
• 作者: 村田知慧;山田文雄;河内紀浩;松田洋一;黒岩麻里;村田知慧;村田知慧;村田知慧;村田知慧
• 通讯作者: 村田知慧

Rediscovery after thirty years since the last capture of the critically endangered Okinawa spiny rat Tokudaia muenninki in the northern part of Okinawa Island.

距离上次在冲绳岛北部捕获极度濒危的冲绳刺鼠 Tokudaia muenninki 三十年后再次发现。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Mammal Study
• 影响因子: 1
• 作者: Fumio Yamada;Norihiro Kawauchi;Katsushi Nakata;Shintaro Abe;Nobuhiko Kotaka;Atsushi Takashima;Chie Murata;Asato Kuroiwa
• 通讯作者: Asato Kuroiwa

オキナワトゲネズミのXおよびY染色体が大型したメカニズムの解明

阐明冲绳刺鼠X和Y染色体变大的机制

• 发表时间: 2009
• 作者: 村田知慧;山田文雄;河内紀浩;松田洋一;黒岩麻里;村田知慧;村田知慧;村田知慧;村田知慧;村田知慧
• 通讯作者: 村田知慧

A primer set to determine sex in the small Indian mongoose, Herpestes auropunctatus

• DOI: 10.1111/j.1755-0998.2010.02931.x
• 发表时间: 2011-03-01
• 期刊: MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES
• 影响因子: 7.7
• 作者: Murata, C.;Ogura, G.;Kuroiwa, A.
• 通讯作者: Kuroiwa, A.