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トゲネズミ三種の比較解析によるY染色体消失過程の推定

トゲネズミ三種の比較解析によるY染色体消失過程の推定
通过对三种多刺大鼠的比较分析估计Y染色体丢失过程
批准号:
09J01887
负责人:
村田 知慧
金额:
$0.9万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2010

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项目成果

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トゲネズミ属3種のうち、アマミトゲネズミとトクノシマトゲネズミは、XO/XO型の性染色体構成をもち、Y染色体だけでなく性決定遺伝子SRYを消失した極めてめずらしい哺乳類である。一方、オキナワトゲネズミ(以下オキナワ)は、一般的なXX/XY型の性染色体をもつが、その性染色体は一対の常染色体の転座により大型化し、SRYは特異的なアミノ酸置換と重複により独自の進化を遂げている。トゲネズミ属のY染色体の進化過程を明らかにすることを目的とし、平成22年度はオキナワにおいて、性染色体のさらなる構造変化の有無の検出、祖先Y染色体領域の同定、SRYの機能性予測をおこなった。29のマウスのcDNAクローンを用いたFISH解析の結果、オキナワの祖先X染色体領域(Xq)および性染色体に転座した常染色体領域(Xp、Yp)は他のネズミ類の遺伝子オーダーと一致し、構造変化はみられなかった。ただし、アマミトゲネズミの性決定候補遺伝子であるCBX2が、オキナワにおいて常染色体の転座に伴い、性染色体に連鎖し、さらに他の染色体に重複していた。また、CGH解析の結果、オキナワのY染色体に性特異的な領域は検出されなかったが、単一のY連鎖遺伝子と同定されたDDX3YとUTYのcDNAクローンを用いたFISHの結果、両遺伝子はYpの動原体付近に存在し、祖先Y染色体領域がYp動原体付近に保持されていることをつきとめた。さらに、SOX9の精巣特異的エンハンサー領域にあるSRY結合配列の保存性を、マウス、ラット、ヒト、オキナワにおいて比較した結果、結合サイトの一つにオキナワ特異的な置換がみられ、保存性が失われていた。今回の結果から、トゲネズミ共通祖先はY染色体にいくつかのY連鎖遺伝子を保持していたことが明らかとなったが、SRYの機能はトゲネズミ共通祖先において、すでに低下もしくは消失していた可能性が考えられた。トゲネズミ属のY染色体進化を解明するために、オキナワは鍵となる重要な種であることが本研究によって強く示された。
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会议论文
Multiple copies of SRY genes on the large Y chromosome of the Okinawa spiny rat, Tokudaia muenninki.
冲绳刺鼠 Tokudaia muenninki 的大 Y 染色体上存在多个 SRY 基因拷贝。
DOI: --
发表时间: 2010
期刊: Chromosome Research
影响因子: 2.6
作者: [Chie Murata, Fumio Yamada, Norihiro Kawauchi, Yoichi Matsuda, Asato Kuroiwa]
通讯作者: Asato Kuroiwa
オキナワトゲネズミTokudaia muenninkiの性染色体とSRY遺伝子の進化
冲绳刺鼠Tokudaia muenninki性染色体和SRY基因的进化
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [村田知慧, 山田文雄, 河内紀浩, 松田洋一, 黒岩麻里, 村田知慧, 村田知慧, 村田知慧, 村田知慧]
通讯作者: 村田知慧
Rediscovery after thirty years since the last capture of the critically endangered Okinawa spiny rat Tokudaia muenninki in the northern part of Okinawa Island.
距离上次在冲绳岛北部捕获极度濒危的冲绳刺鼠 Tokudaia muenninki 三十年后再次发现。
DOI: --
发表时间: 2010
期刊: Mammal Study
影响因子: 1
作者: [Fumio Yamada, Norihiro Kawauchi, Katsushi Nakata, Shintaro Abe, Nobuhiko Kotaka, Atsushi Takashima, Chie Murata, Asato Kuroiwa]
通讯作者: Asato Kuroiwa
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [村田知慧, 山田文雄, 河内紀浩, 松田洋一, 黒岩麻里, 村田知慧, 村田知慧, 村田知慧, 村田知慧, 村田知慧]
通讯作者: 村田知慧
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    哺乳類のネオ性染色体における組換え抑制開始プロセスの解明
    • 批准号:
      16K21195
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $2.66万
    • 财政年份:
      2016
    • 负责人:
      村田 知慧
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    基于基因组分型组装的木油桐性染色体进化机制研究
    • 批准号:
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
    • 依托单位:
    海龙科鱼类性染色体演化及其对雄性繁殖系统多样化的调控机制研究
    鲇属鱼类性别决定基因鉴定及性染色体演化分析
    • 批准号:
      32302967
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      30万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      郑树清
    • 依托单位:
    基于全基因组测序的银鱼科鱼类性别决定和性染色体演化遗传机制研究
    • 批准号:
      32370563
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      50万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      李玉龙
    • 依托单位: