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外生菌根菌の宿生特異性の進化と宿主転換―フタバガキ科樹種との共生関係に着目して―

外生菌根真菌宿主特异性的进化和宿主转换 - 关注与龙脑香属物种的共生关系 -

基本信息

批准号：
09J07635
负责人：
佐藤博俊
金额：
$ 1.79万
依托单位：
Forestry and Forest Products Research Institute
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2011
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09J07635/
关键词：
菌根共進化多様性熱帯共生 DNA 菌類

项目摘要

本研究は、植物と相利共生する菌類である外生菌根菌と東南アジア熱帯地域で適応放散したとされるフタバガキ科樹種の共進化関係について調べることを最終的な目的としている。外生菌根菌の地理的な分布が宿主植物に対する特異性によってどの程度決められているかについて調べるため、ベイジアン解析によって菌類の分布パターンの推定を行った。本研究はボルネオ島のランビル国立公園(マレーシア・サラワク州)で採集したフタバガキ科樹種のルートチップサンプルを用いて解析を行う予定であったが、サンプルの日本国内への持ち出しに時間がかかったため、代用としてすでに大量のサンプルを保有していた屋久島の菌子実体サンプルについて解析を行った。屋久島の低地照葉樹林で菌子実体を採集した子実体に対し、核ITS2領域の塩基配列を解読し、その相同性に基づいて種の識別を行った。得られたすべての分類ユニット(OTU)についてBlast検索(GenBankデータベースとの照合)を行い、相同性の高い塩基配列をもつ菌類サンプルが採集された地域をリストアップした。さらに、「実際にはその地域に存在しているがGenBankに塩基配列が登録されていない種」を考慮するため、Zero inflated binomial modelを導入した。これらの解析により、屋久島に生育する外生菌根菌は、その宿主植物であるブナ科植物の分布に非常に強い制約を受けており、大半の種は東アジア地域など近隣の地域に分布している可能性が高いことが分かった。一方で、屋久島に生育する腐生菌は、分布を制約する要因は弱く、非常に広範囲に分布している可能性があることが分かった。本研究の結果から、外生菌根菌の地理的分布パターンは、歴史的背景、すなわち宿主植物との共進化関係の影響を強く受けているこどが分かった。この研究の内容については論文としてまとめ、現在、投稿中である。本研究で用いた解析手法は、今後ランビル国立公園において採集したサンプルについて適用していく予定である。

In this study, plant symbiosis, ectomycorrhizal fungi, ectomycorrhizal fungi Geographical distribution of ectomycorrhizal mycorrhizal fungi the host plant is not specific to the degree of ectomycorrhizal mycorrhizal fungi. The purpose of this study is to analyze the use of data analysis in order to determine the number of customers in Japan, and to determine the number of customers in Japan. Instead of using a lot of money, there are a lot of questions about how to keep the fungus for a long time, the mycelium, the fungus, the analysis line. The mycelia of the low-lying forest were collected, and the nuclear ITS2 field base was arranged to solve the problem, and the homology was analyzed. It is necessary to classify the data (OTU) into different categories, such as the Blast cable (in the light of the GenBank information system), and the same data base should be assigned to the collection of bacteria in different regions. In international trade and regional economic cooperation, there is a basic arrangement for the registration of GenBank and the entry of Zero inflated binomial model. The distribution of ectomycorrhizal fungi (ectomycorrhizal fungi), host plants (families) is very strong, most of them are affected by the distribution of ectomycorrhizal mycorrhizal fungi (ectomycorrhizal fungi), ectomycorrhizal mycorrhizal fungi (ectomycorrhizal fungi) and host plants. The distribution of saprophytic bacteria, saprophytic bacteria and saprophytic bacteria. The results of this study, the geographical distribution of ectomycorrhizal mycorrhizal fungi, the background of ectomycorrhizal mycorrhizal fungi, the background of ectomycorrhizal mycorrhizal mycorrhizal fungi, the background of ectomycorrhizal mycorrhizal mycorrhizal fungi, the background of ectomycorrhizal mycorrhizal fungi, the geographical distribution of ectomycorrhizal mycorrhizal fungi, the background of ectomycorrhizal mycorrhizal mycorrhizal fungi, the background of ectomycorrhizal mycorrhizal mycorrhizal fungi, the background of ectomycorrhizal mycorrhizal mycorrhizal fungi, the geographical distribution of ectomycorrhizal mycorrhizal fungi, the background of ectomycorrhizal mycorrhizal The contents of the study are in progress, and the contribution is in progress. The purpose of this study is to use the analytical method, and in the future, the collection of the national public information system will be used to predict the accuracy of the data.