Non-standard peptide-probe discovery

非标准肽探针发现

• 批准号: 21000005
• 负责人: SUGA Hiroaki
• 金额: $ 201.01万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21000005/
• 关键词: 天然物有機化学; 生理活性物質; 生体高分子; 生化学; ケミカルバイオロジー; ペプチド; RNA; タンパク質合成; 特殊ペプチド; 創薬; 翻訳; 遺伝暗号; リボザイム; 天然物; 生合成

This research project aims at developing the genetic code reprogramming technology based on the flexizyme system and expressing natural product-like macrocyclic peptides from mRNA libraries. Moreover, an in vitro display system, referred to RaPID (Random nonstandard Peptide Integrated Discovery) system, has been established to apply for massive screenings of macrocyclic peptides generated by the above technology. This has enabled us to discover molecular probes against various drug targets, leading to a new era of chemical biology.

本项目旨在开发基于柔性酶系统的遗传密码重编程技术，并从mRNA文库中表达天然产物样大环肽。此外，我们还建立了一套体外展示系统RaPID （Random nonstandard Peptide Integrated Discovery，随机非标准肽集成发现）系统，用于对上述技术产生的大环肽进行大规模筛选。这使我们能够发现针对各种药物靶点的分子探针，从而开启了化学生物学的新时代。

项目成果

大環状ペプチド、その製造方法、及び大環状ペプチドライブラリを用いるスクリーニング方法

大环肽、其制备方法以及使用大环肽文库的筛选方法

• 发表时间: 2013

pH依存的に標的分子に結合するペプチドのスクリーニング方法

以pH依赖性方式与靶分子结合的肽的筛选方法

• 发表时间: 2012

擬天然物の新機能創出分子技術

分子技术创造拟天然产品新功能

• 发表时间: 2014
• 作者: 赤坂茉莉;澤田均;菅 裕明
• 通讯作者: 菅 裕明

特殊環状ペプチドの翻訳合成と医薬品探索への展開

特殊环肽的转化合成及其在药物发现中的应用

• 发表时间: 2010
• 期刊: 生化学
• 作者: Takashi Saruko;Kazuma Mawatari;Takehiko Kitamori;林剛介・大城幸紀・菅裕明
• 通讯作者: 林剛介・大城幸紀・菅裕明

Ribosomal Synthesis of Peptides with C‐Terminal Lactams, Thiolactones, and Alkylamides

• DOI: 10.1002/cbic.200900058
• 发表时间: 2009-05
• 期刊: ChemBioChem
• 影响因子: 3.2
• 作者: Eiji Nakajima;Yuki Goto;Yusuke Sako;H. Murakami;H. Suga