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Natural Language Processing-Based Comprehensive Data Analysis for Interaction Between Chemicals and Drug Metabolism Network

基于自然语言处理的化学品与药物代谢网络相互作用的综合数据分析

基本信息

批准号：
21390008
负责人：
YAMASHITA Fumiyoshi
金额：
$ 11.81万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2011
项目状态：
已结题

项目摘要

Drug metabolism is closely related to efficacy and safety of drugs, of which inhibition or induction is involved in drug-drug interaction following administration of multiple drugs. In order to predict drug-drug interactions, it is required to comprehensively understand not only interaction of chemicals with individual drug-metabolizing enzymes but that with a network system regulating expression and activity of the enzymes. In the present study, we developed a natural language processing-based text-mining technique for systematically collecting information on interaction between chemicals and a drug metabolism-related network. In addition, based on the information collected, we systematically performed structure-activity relationship analyses. These results will present a clue to drug design and discovery intended for development of safer drugs.

药物代谢与药物的有效性和安全性密切相关，多种药物联合给药后的药物相互作用涉及药物代谢的抑制或诱导。为了预测药物相互作用，不仅需要全面了解化学品与单个药物代谢酶的相互作用，而且需要全面了解调节酶表达和活性的网络系统。在本研究中，我们开发了一种基于自然语言处理的文本挖掘技术，用于系统地收集化学品和药物代谢相关网络之间相互作用的信息。此外，根据收集到的信息，我们系统地进行了结构-活性关系分析。这些结果将为药物设计和发现提供线索，以开发更安全的药物。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

In silicoによるバイオアベイラビリティの予測,薬物の消化管吸収予測研究の最前線,(杉山雄一監修)

通过 in silico 预测生物利用度，这是预测药物胃肠道吸收研究的前沿（由 Yuichi Sugiyama 监督）

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Mohd Asmadi;河本晴雄;坂志朗;N.Itchoda;山下富義
通讯作者：
山下富義

構造活性相関法に基づくin slico薬物動態予測

基于构效关系法的切片药代动力学预测

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shimazaki H;Hironaka K;山口高弘;山下富義
通讯作者：
山下富義

Data mining and visualization techniques for ADME screening

ADME 筛选的数据挖掘和可视化技术

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
中島誠也;荒井秀;西田篤司;Fumiyoshi Yamashita
通讯作者：
Fumiyoshi Yamashita

コンピュータを利用した薬物動態評価・予測の方法論

基于计算机的药代动力学评估和预测方法

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
0
作者：
Nishikawa M;Otsuki T;Ota A;Guan X;Takemoto S;Takahashi Y;Takakura Y.;山下富義
通讯作者：
山下富義

A novel multi-dimensional visualization technique for understanding the design parameters of drug formulations

一种新颖的多维可视化技术，用于了解药物配方的设计参数

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
Computers & Chemical Engineering
影响因子：
4.3
作者：
Fumiyoshi Yamashita;Takayuki Itoh;Shuya Yoshida;Mohammad K. Haidar and Mitsuru Hashida
通讯作者：
Mohammad K. Haidar and Mitsuru Hashida