Integrative analyses of circadian rhythms based on environment

基于环境的昼夜节律综合分析

• 批准号: 21390066
• 负责人: TAKUMI Toru
• 金额: $ 11.81万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21390066/
• 关键词: 遺伝子; 細胞・組織; 環境; 行動学; 神経科学

We use multiple high-throughput approaches including chromatin immunoprecipitation(ChIP)-based systematic analyses and DNA microarrays combined with bioinformatics, to generate genome-wide profiles of BMAL1 target genes. We reveal that, in addition to E-boxes, BMAL1 recognizes a consensus sequence CCAATG to elicit robust circadian expression. BMAL1 occupancy is found in more than 150 sites, including all known clock genes. Importantly, a significant proportion of BMAL1 targets include genes that encode central regulators of metabolic processes. The database generated in this study constitutes a useful resource to decipher the network of circadian gene control and its intimate links with several fundamental physiological functions

我们使用多种高通量的方法，包括染色质免疫沉淀（ChIP）为基础的系统分析和DNA微阵列结合生物信息学，以产生全基因组的BMAL1靶基因的配置文件。我们发现，除了E盒，BMAL1识别的共识序列CCAATG引起强大的昼夜节律表达。BMAL1占据了150多个位点，包括所有已知的时钟基因。重要的是，BMAL1靶点中很大一部分包括编码代谢过程的中央调节因子的基因。本研究中产生的数据库构成了破译昼夜节律基因控制网络及其与几种基本生理功能的密切联系的有用资源

项目成果

体内時計のからくり(NPO法人脳の世紀推進会議編.)

生物钟的机制（NPO脑世纪推进协议会编）

• 发表时间: 2010
• 作者: Takahashi HK;Liu K;Wake H;Nishibori M;et al.;(8名、8番目);内匠透
• 通讯作者: 内匠透

The period of the somite segmentation clock is sensitive to Notch activity.

• DOI: 10.1091/mbc.e11-02-0139
• 发表时间: 2011-09
• 期刊: Molecular biology of the cell
• 影响因子: 3.3
• 作者: Kim W;Matsui T;Yamao M;Ishibashi M;Tamada K;Takumi T;Kohno K;Oba S;Ishii S;Sakumura Y;Bessho Y
• 通讯作者: Bessho Y

Rhythm and the blues Worldsleep 2011

节奏与蓝调 Worldsleep 2011

• 发表时间: 2011
• 作者: Mabuchi Y;Morikawa S;Suzuki S;Sunabori T;Okano H;and Matsuzaki Y;Toru Takumi
• 通讯作者: Toru Takumi

うつ病ラットモデルを用いたリチウムシグナルとサーカディアンリズム解析

使用抑郁大鼠模型进行锂信号和昼夜节律分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 高野敦子;内匠透
• 通讯作者: 内匠透

時間生物学

时间生物学

• 发表时间: 2012
• 作者: Nakagawa A.;et al.;寺田晃士;内匠透
• 通讯作者: 内匠透