Proton transfer and conformational dynamics in the M2-to-O steps of the bacteriorhodopsin photocycle

细菌视紫红质光循环 M2-to-O 步骤中的质子转移和构象动力学

• 批准号: 5385543
• 负责人: Professor Dr. Jeremy Christopher Smith
• 金额: --
• 依托单位: Interdisziplinäres Zentrum für Wissenschaftliches Rechnen (IWR)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Units
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2001-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5385543?language=en
• 关键词: Proton; transfer; conformational; dynamics; M2

Es werden Computersimulationen des Photozyklus von Bacteriorhodopsin, ausgehend vom photoisomerisierten Zustand, durchgeführt. Als Anfangsgeometrien werden für diese Simulationen Strukturen des Proteins in verschiedenen Zwischenstufen verwendet, die erst kürzlich experimentell ermittelt wurden. Den Berechnungen liegt als Methode die "Molekulare Kinematik" zugrunde, die den Weg minimaler Energie zwischen zwei bekannten Endzuständen im Konformationsraum bestimmt, kombiniert mit einem quanten- und molekularmechanischen Ansatz zur Modellierung. Wege des Protonentransfers sowie der strukturellen Veränderungen im Protein werden so ermittelt und bieten Einsicht, in welcher Weise beide miteinander gekoppelt sind. Zusätzlich werden Simulationen am Halorhopodopsin zum Verständnis des Pumpmechanismus von Chloridionen durchgeführt.

[4] [j] .细菌视紫红质光合酶的计算机模拟研究，[j] .吉林大学学报（自然科学版）。【参考翻译】Anfangsgeometrien werden fr疾病模拟：蛋白质在verschiedenen Zwischenstufen verwendet， die erst k<s:1> rzlich experimentell ermittelt wurden。“分子运动学”方法，“分子动力学”方法，“最小能量”方法，“量子力学”方法，“量子力学”方法，“分子力学”方法，“分子力学”方法，“分子力学”方法，“模型力学”方法。质子转移过程中蛋白质的转移过程中蛋白质的转移过程中蛋白质的转移过程中蛋白质的转移过程中蛋白质的转移过程中蛋白质的转移过程中蛋白质的转移过程中蛋白质的转移过程中蛋白质的转移过程中蛋白质的转移过程中蛋白质的转移过程中。Zusätzlich werden Simulationen am halorhopopsin zum Verständnis des Pumpmechanismus von chlororidionen durchgef<s:2> hrt。