Comprehensive and biological analysis of glycosphingolipid function expressed on cell using bioinformatics technique

利用生物信息学技术对细胞表达的鞘糖脂功能进行全面的生物学分析

• 批准号: 21500293
• 负责人: NAKAJIMA Hideki
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: National Research Institute for Child Health and Development
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21500293/
• 关键词: 糖鎖; 情報工学; マイクロアレイ; 生体分子; 細胞; 組織; 細胞・組織

The data processing software of liquid chromatography-mass spectrometer(LC-MS) was developed and the software was applied for the analysis of glycolipid expression in some different types of infantile leukemia cell. Each different type of leukemia cells was categorized using the software by the statistical analysis of glycosphingolipid expression. Especially, new glycosphingolipid marker, Ln3Cer could be discovered in some type of leukemia cell using the software analysis.

开发了液相色谱-质谱联用仪（LC-MS）数据处理软件，并应用该软件对不同类型的婴儿白血病细胞糖脂表达进行了分析。通过鞘糖脂表达的统计分析，使用软件对每种不同类型的白血病细胞进行分类。特别是利用软件分析，可以在某些类型的白血病细胞中发现新的鞘糖脂标记物Ln 3Cer。