Unraveling regulatory network in wood formation

解开木材形成的监管网络

• 批准号: 21770064
• 负责人: MITSUDA Nobutaka
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21770064/
• 关键词: 植物; ゲノム; 発現制御; 遺伝子; バイオマス; シロイヌナズナ; 木質; 転写因子; 転写制御; 酵母; ワンハイブリッド

New efficient improved yeast one-/two-hybrid screening system has been developed in which the artificial library containing only Arabidopsis genes for transcription factor(TF) is employed. This new system lets me identify TF binding to specific DNA or protein in very efficient manner. I screened TF binding to the regulatory region of genes involving to wood formation and identified many TFs as candidates. This result gradually makes me to draw entire picture of transcriptional regulatory network. Furthermore, I found some TFs rescuing phenotype of wood-less mutant in Arabidopsis and am analyzing their biological functions.

开发了新的高效改良酵母一/二杂种筛选系统，其中使用仅含有转录因子（TF）拟南芥基因的人工文库。这个新系统让我能够以非常有效的方式识别 TF 与特定 DNA 或蛋白质的结合。我筛选了与木材形成相关基因调控区域结合的 TF，并确定了许多 TF 作为候选者。这个结果逐渐让我勾勒出转录调控网络的全貌。此外，我在拟南芥中发现了一些拯救无木突变体表型的转录因子，并正在分析它们的生物学功能。

项目成果

VASCULAR-RELATED NAC-DOMAIN 7 directly regulates the expression of a broad range of genes for xylem vessel formation

• DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04514.x
• 发表时间: 2011-05-01
• 期刊: PLANT JOURNAL
• 影响因子: 7.2
• 作者: Yamaguchi, Masatoshi;Mitsuda, Nobutaka;Demura, Taku
• 通讯作者: Demura, Taku

改良酵母ワンハイブリッド法により転写制御ネットワークを明らかにしようとする試み

尝试使用改进的酵母单杂交方法阐明转录调控网络

• 发表时间: 2011
• 作者: 光田展隆;ほか
• 通讯作者: ほか

改良酵母ワンハイブリッド法を活用したシロイヌナズナとイネの転写制御ネットワーク解明の試み

尝试使用改进的酵母单杂交方法阐明拟南芥和水稻中的转录调控网络

• 发表时间: 2012
• 作者: 光田展龍;ほか
• 通讯作者: ほか

VND-INTERACTING2, a NAC Domain Transcription Factor, Negatively Regulates Xylem Vessel Formation in Arabidopsis

• DOI: 10.1105/tpc.108.064048
• 发表时间: 2010-04-01
• 期刊: PLANT CELL
• 影响因子: 11.6
• 作者: Yamaguchi, Masatoshi;Ohtani, Misato;Demura, Taku
• 通讯作者: Demura, Taku

Development of new methods to identify transcription factors that interact with promoter region

开发新方法来鉴定与启动子区域相互作用的转录因子

• 发表时间: 2010
• 作者: Nobutaka Mitsuda;et al
• 通讯作者: et al