Analysis of protein interaction networks by photo-cross-linking

通过光交联分析蛋白质相互作用网络

• 批准号: 21770195
• 负责人: SATO Aya
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21770195/
• 关键词: 蛋白質; 光クロスリンク; 非天然型アミノ酸; 分子間相互作用

"The photo-cross-linking method" is the new technique that can stabilized protein complexes formed in living cells to isolate and analyze them. In this study, I identified the efficient positions to incorporate photo-cross-linkers in several protein-binding domains for the purpose of applying the photo-cross-linking method to the elucidation of the protein interaction networks.Furthermore, I succeeded in the crystallographic study of the cross-linked protein complex.

光交联法是一种可以稳定活细胞中形成的蛋白质复合体来分离和分析它们的新技术。在这项研究中，我确定了在几个蛋白质结合域中引入光交联剂的有效位置，以便将光交联法应用于阐明蛋白质相互作用网络，并成功地对交联蛋白质复合体进行了结晶学研究。

项目成果

Crystallographic study of a site-specifically cross-linked protein complex with a genetically incorporated photoreactive amino acid.

• DOI: 10.1021/bi1016183
• 发表时间: 2011-01
• 期刊: Biochemistry
• 影响因子: 2.9
• 作者: Shin Sato;S. Mimasu;A. Sato;Nobumasa Hino;K. Sakamoto;T. Umehara;S. Yokoyama

大腸菌におけるRF-1ノックアウトによるUAGコドンの再定義

通过敲除大肠杆菌中的 RF-1 重新定义 UAG 密码子

• 发表时间: 2010
• 作者: 佐藤文;向井崇人;林明子;伊良波史枝;大竹和正;横山茂之;坂本健作
• 通讯作者: 坂本健作

Codon reassignment in the Escherichia coli genetic code.

• DOI: 10.1093/nar/gkq707
• 发表时间: 2010-12
• 期刊: Nucleic acids research
• 影响因子: 14.9
• 作者: Mukai T;Hayashi A;Iraha F;Sato A;Ohtake K;Yokoyama S;Sakamoto K
• 通讯作者: Sakamoto K

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Genetic Incorporation of a Photo-Crosslinkable Amino Acid Reveals Novel Protein Complexes with GRB2 in Mammalian Cells

• DOI: 10.1016/j.jmb.2010.12.022
• 发表时间: 2011-02-18
• 期刊: JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
• 影响因子: 5.6
• 作者: Hino, Nobumasa;Oyama, Masaaki;Sakamoto, Kensaku
• 通讯作者: Sakamoto, Kensaku