microRNAの多様性と脊椎動物の系統進化

microRNA多样性与脊椎动物系统发育进化

• 批准号: 21770257
• 负责人: 日下部 りえ
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21770257/
• 关键词: 機能性RNA; microRNA; ヤツメウナギ; メダカ; 形態進化; 脊椎動物; 脊索動物

脊椎動物の各系統での小分子機能性RNAの重複の度合いや機能の変遷を解明するため、複数の動物でmicroRNAの同定と機能解析を行った。平成22年度はまず、尾索動物ホヤで筋肉細胞特異的に発現するmiR-1, miR-133について、発現パターンと転写制御機構を解析した。ノザンブロット実験により各成熟型miRの発現を検出したところ、1)miR-133は変態前の胚発生過程において発現するが、miR-1は発現しないこと、2)成体では、miR-133は体壁筋のみに、miR-1は体壁筋と心筋の両方に発現することが明らかになった。さらに、miR-1/miR-133は単一の一次産物として、尾芽胚の筋肉細胞の核に局在し、その発現はmiR-1の上流領域に制御されることが見出された。現在・真骨魚類メダカについても前駆体型から成熟型へのプロセシングについて解析中である。またヤツメウナギに関し、一個のmiR-1と二個のmiR-133の相同遺伝子を同定し、前駆体の二次構造を予測した。成熟型miR-133についてノザンブロット解析を行ったところ、筋肉の発生過程で発現していた。以上の知見から、1)miR-1/miR-133は脊索動物の共通祖先においてすでに、遺伝子対としてゲノム上の近傍に位置するようになり、一続きの前駆体として筋肉特異的に産生されるようになったこと、2)脊索動物の共通祖先においてこの遺伝子対は一個しかなかったが、脊椎動物の多様化・複雑化と平行して、そのコピー数を増し、筋肉細胞種ごとに異なる制御を受けるようになったことが示唆された。これらはmicroRNAの多様性と形態進化との関わりに関する先駆的な知見である。

Clarification of the degree of repetition of <s:1> small molecule functional Rnas <e:1> in various systems of vertebrates を and the transformation of <s:1> や functional <e:1> を, as well as the analysis of the と function of multiple <s:1> animal で micrornas <e:1> を row った. Pp.47-53 22 year は ま ず, tail rope animal ホ ヤ で brawn cell specific に 発 now す る miR - 1, miR - 133 に つ い て, 発 パ タ ー ン と planning system of writing imperial institutions を parsing し た. ノ ザ ン ブ ロ ッ ト be 験 に よ り each mature miR の 発 now を 検 out し た と こ ろ miR - 133, 1) は - state の embryo 発 before birth process に お い て 発 now す る が, miR - 1 は 発 now し な い こ と, 2) adult で は, miR - 133 は body wall reinforcement の み に, miR - 1 は body wall reinforcement と heart muscle の struck party に 発 now す る こ と が Ming Youdaoplaceholder0 になった. さ ら に, 1 / miR - miR - 133 は 単 once a の product と し て, tail bud embryos の brawn cell nuclear に の bureau in し, そ の 発 now は miR - 1 の に upper field suppression さ れ る こ と が shows さ れ た. Now, bony fish really メ ダ カ に つ い て も 駆 size before か ら mature へ の プ ロ セ シ ン グ に つ い て in parsing で あ る. ま た ヤ ツ メ ウ ナ ギ に masato し, a の miR - 1 と two の miR - 133 の same heritage 伝 son を with fixed し, former 駆 の を secondary structure can be し た. Mature miR - 133 に つ い て ノ ザ ン ブ ロ ッ ト parsing line を っ た と こ ろ, brawn の 発 birth process で 発 now し て い た. Above の knowledge か ら miR - 1, 1)/miR - 133 は chordate の common ancestor に お い て す で に, but 伝 と seaborne し て ゲ ノ ム の nearly alongside に position す る よ う に な り, a 続 き の 駆 body before と し て brawn specific に produce さ れ る よ う に な っ た こ と, 2) chordate の common ancestor に お い て こ の 伝 son は seaborne one し か な か っ た が, の many others in vertebrates, the complex 雑 change と parallel し て, そ の コ ピ ー number を raised し, brawn cells ご と に different な る suppression を by け る よ う に な っ た こ と が in stopping さ れ た. こ れ ら は mirnas の multiple others と morphological evolution と の masato わ り に masato す る 駆 な knowledge first で あ る.

项目成果

カタユウレイボヤ脳胞におけるpiwiの新規機能の解析

piwi在玻璃海鞘脑泡中的新功能分析

• 发表时间: 2010
• 作者: Kusakabe;R.;島井光太郎
• 通讯作者: 島井光太郎

メダカの神経系発生過程におけるmiR-124の機能

miR-124在青鳉鱼神经系统发育过程中的作用

• 发表时间: 2010
• 作者: Kusakabe;R.;島井光太郎;加藤裕美子
• 通讯作者: 加藤裕美子

Embryonic expression and function of miR-430 in medakaメダカ初期胚におけるmiR-430の発現と機能

青鳉中 miR-430 的胚胎表达和功能

• 发表时间: 2009
• 作者: Kusakabe;R.;日下部りえ;日下部りえ;日下部りえ;谷沙織
• 通讯作者: 谷沙織

Genomic organization and embryonic expression of miR-430 in medaka (Oryzias latipes): insights into the post-transcriptional gene regulation in early development.

• DOI: 10.1016/j.gene.2009.09.005
• 发表时间: 2010
• 期刊: Gene
• 影响因子: 3.5
• 作者: Saori Tani;R. Kusakabe;K. Naruse;H. Sakamoto;Kunio Inoue

Genomic organization, expression and evolution of muscle specific microRNAs

肌肉特异性 microRNA 的基因组组织、表达和进化

• 发表时间: 2010
• 作者: Kusakabe;R.;日下部りえ
• 通讯作者: 日下部りえ