权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

高次元ゲノム情報解析におけるベイズ流の統計手法の開発

高维基因组信息分析的贝叶斯统计方法的发展

基本信息

批准号：
10J02394
负责人：
野間久史
金额：
$ 0.9万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

项目摘要

近年のヒトゲノムの全塩基配列の解読や実験技術の著しい進歩を受け,生物医学の領域でも,ゲノム規模での膨大な情報を利用した研究が盛んに行われている.これらの研究における,科学性の担保と効率性の向上のために,新たな統計手法の開発と整備は不可欠である.本年度は,まず,マイクロアレイ等を用いたゲノムワイド研究において,予測・診断法開発を目的とした,関連遺伝子選択のための方法論の開発を行った.ベイズ流の枠組みから,選択された遺伝子による診断法の予測精度を評価する手法を提案し,従来法よりも良好な性能を示すことを確認できた.また,研究計画の立案や結果の解釈において,検出力・サンプルサイズの評価は重要な問題である.本研究では,ベイズ流の枠組みから,経験ベイズ法を用いた評価方法を開発した.特に,効果サイズが大きな遺伝子を対象とした部分検出力という概念を導入し,従来の検出力とは異なる枠組みでの方法論を構築した.また,多重検定における最強力検定に対応する方式について,経験ベイズ法に基づく検定方式を開発した.従来法の本質的な問題であった検定統計量の近似の問題を大きく改善することができ,数値実験や実データの解析を通して,良好な性能が示された.また,選択された遺伝子のランキングや信頼区間の構成,正確な点推定について,ベイズ流の方法論の研究を行った.これらの成果を医学統計学領域の一流国際誌に発表すると同時に,海外の研究者から依頼を受けた,2冊の書籍の分担執筆も行った.

In recent years, there has been a great progress in the field of biomedicine, and the use of information on the scale of biomedicine has been greatly promoted. The scientific guarantee of the research and the development of new statistical methods are indispensable. This year, the development of methodologies for the selection of related genes was carried out in the context of research, prediction and diagnosis. The diagnostic method is evaluated for its predictive accuracy by means of a set of selected diagnostic methods, and its good performance is confirmed. The research project and the results of the study are discussed in detail. This study aims to develop a new evaluation method for the development of a new research methodology. In particular, the concept of "big" and "small" is introduced, and the methodology of "small" and "small" is constructed. In addition, the most powerful mode of multi-mode detection is developed in the basic mode of detection. The problem of approximation of statistical quantities is greatly improved, and the analysis of numerical values and statistical quantities is well understood. Good performance is demonstrated. In this paper, the author studies the methodology of the selection and analysis of the information interval, the estimation of the correct point, and the analysis of the information flow. The results of this research are published in the first-class international journal in the field of medical statistics, and at the same time, overseas researchers have received support from the author of 2 books.