DNAメチル基転移酵素を制御するトランスポゾン由来のイネmicroRNAの解析
源自控制 DNA 甲基转移酶的转座子的水稻 microRNA 分析
基本信息
- 批准号:10J06354
- 负责人:
- 金额:$ 0.9万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2010
- 资助国家:日本
- 起止时间:2010 至 2011
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
イネのmicroRNAの一種であるmiRJはトランスポゾンから産生され、de novo DNAメチル基転移酵素遺伝子OsDRM2を標的とする。de novo DNAメチル基転移酵素はDNAのメチル化を通して遺伝子サイレンシングの確立や維持に関与することが示されていることからmiRJはトランスポゾンのサイレンシング抑制機構として働く可能性がある。本研究はこれまでにmiRJが配列依存的にOsDRM2の発現を量的に負に制御していることを明らかにした。本年度はOsDRM2の発現低下によりトランスポゾン領域内の遺伝子のDNAメチル化が低下するか明らかにするために、RNAi法により作出したOsDRM2発現低下カルスを用いてMcrBC-PCR解析を行った。その結果、OsDRM2発現低下カルスではトランスポゾン領域内の遺伝子のDNAメチル化程度が低下していることが明らかになった。よってmiRJがトランスポゾンの内部から生成されると、miRJによるOsDRM2遺伝子の発現抑制を介してトランスポゾンのDNAメチル化が阻害され、トランスポゾンが不活性化を回避する経路が明らかになった.miRJの転写経路を明らかにするために、miRJ前駆体の配列を調べた結果、miRJ前駆体は主に7番染色体のmiRJ前駆体遺伝子より転写されていた。ChIP-PCR解析とバイサルファイトシーケンス解析を行った結果、7番染色体のmiRJ前駆体遺伝子はイネゲノム上の残りの4つのmiRJ前駆体遺伝子とは異なるエピジェネティックな修飾を受けていることが明らかになった。以上より、トランスポゾン由来の小分子RNAであるmiRJは宿主サイレンシングの回避に働く一方で、自身の転写は宿主のエピジェネティックな制御の下にあることが明らかになった。トランスポゾンの活性は複数のエピジェネティックな制御を通して適切に調節されていると考えられる。
A type of microRNA is produced by the novel DNA enzyme OsDRM2. De novo DNA-based enzyme is responsible for the establishment and maintenance of DNA-based protein transfer mechanisms. In this study, the negative control of the occurrence of OsDRM2 was investigated. This year, the detection of OsDRM2 gene in the field of DNA sequencing was carried out. As a result, OsDRM2 was found to be low in DNA fragmentation in the domain of DNA fragmentation. The miRJ precursor is regulated by the miRJ precursor sequence, and the miRJ precursor sequence is regulated by the miRJ precursor sequence. ChIP-PCR analysis results show that the miRJ precursor gene of chromosome 7 is the residue of the miRJ precursor gene of chromosome 7, and the miRJ precursor gene of chromosome 7 is the residue of chromosome 7. The above is the origin of small molecule RNA. The activity of the enzyme is regulated by the enzyme.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
WAVY LEAF 1, an Ortholog of Arabidopsis HEN1, Regulates Shoot Development by Maintaining microRNA and trans-acting siRNA Accumulation in Rice
WAVY LEAF 1 是拟南芥 HEN1 的直系同源物,通过维持水稻中 microRNA 和反式作用 siRNA 的积累来调节芽发育
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Masashi Abe;Takanori Yoshikawa;Misuzu Nosaka;Hitoshi Sakakibara;Yutaka Sato;Yasuo Nagato;Jun-ichi Itoh
- 通讯作者:Jun-ichi Itoh
イネmiR820によるde novo DNAメチル基転移酵素遺伝子の発現制御
水稻 miR820 从头调控 DNA 甲基转移酶基因表达
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:T.E.Kijima;Hideki Innan;Masashi Abe;野坂実鈴;野坂実鈴
- 通讯作者:野坂実鈴
小分子RNAを介した植物ゲノムとゲノム寄生因子の攻防
小RNA介导的植物基因组与基因组寄生因子之间的斗争
- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:T.E.Kijima;Hideki Innan;Masashi Abe;野坂実鈴
- 通讯作者:野坂実鈴
Battles between plant genome and its parasite through the action of a small RNA
植物基因组与其寄生虫之间通过小 RNA 的作用进行战斗
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:T.E.Kijima;Hideki Innan;Masashi Abe;野坂実鈴;野坂実鈴;Misuzu Nosaka
- 通讯作者:Misuzu Nosaka
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