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大環状ポリオキサゾール二量体化合物を用いたDNA四重鎖の可逆的認識とその検出

大環状ポリオキサゾール二量体化合物を用いたDNA四重鎖の可逆的認識とその検出
使用大环聚恶唑二聚体化合物可逆识别和检测 DNA 四链体
批准号:
10J07978
负责人:
飯田 圭介
金额:
$0.9万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2012

项目摘要

项目成果

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グアニンが豊富なDNA配列は、一価のカチオン(Na+,K+など)存在下でG-quadruplex(G4)と呼ばれる特殊な高次構造を形成する。G4は、グアニン同士がG-quartetと呼ばれる平面構造を形成し、さらにそれらがπ-π相互作用により積み重なることで安定化されている。代表的なG4形成配列にはヒトのテロメアに含まれるTTAGGGの繰り返し配列がある。テロメア配列におけるG4の形成はテロメア伸長酵素であるテロメラーゼの阻害、およびテロメア維持機構を担うテロメア結合タンパクの解離により、癌細胞をアポトーシスへと導くことが知られている。G4の生体内における形成の有無およびG4の生物学的機能を調査するためのツールとして、in vitroにおいてG4に強力かつ選択的に結合するG4リガンドが求められている。我々は昨年度までにG4認識部位を二点持つG4リガンドとして大環状ヘキサオキサゾール二量体を報告している。今年度は、生体内において形成されるG4を強力に安定化することを目的として長鎖テロメアDNAとの相互作用解析を行った。具体的には、G4を一つ形成する24残基、二つ形成する48残基、三つ形成する72残基、四つ形成する96残基のDNAについてそのG4結合能を評価することとした。合成した各種化合物とテロメアDNAとの相互作用をCDスペクトル解析、電気泳動実験によりそれぞれ解析を行った結果、この新規6OTD二量体は、長鎖テロメアG4と相互作用し、分子内で連続的にハイブリッド型のG4構造を形成していることが明らかとなった。さらにCD融解実験を行った結果、長鎖テロメアG4をに対して極めて強力に結合することを明らかとした。6OTD二量体を用いたテロメアG4に結合するタンパクの同定へと展開し、G4結合タンパク質の精製・同定法を確立する。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1002/cbic.201200013
发表时间: 2012-04-16
期刊: CHEMBIOCHEM
影响因子: 3.2
作者: [Nakamura, Takahiro, Iida, Keisuke, Nagasawa, Kazuo]
通讯作者: Nagasawa, Kazuo
Synthesis and Evaluation of Macrocyclic Hexaoxazole Dimers as G-quadruplex Ligands
G-四链体配体大环六恶唑二聚体的合成与评价
DOI: --
发表时间: 2011
期刊:
影响因子: --
作者: [K.Iida, M.Tera, K.Shin-ya, K.Nagasawa]
通讯作者: K.Nagasawa
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [K.Iida, M.Tera, K.Shin-ya, T.Hirokawa, K.Nagasawa]
通讯作者: K.Nagasawa
DOI: 10.3987/com-11-s
发表时间: 2012
期刊: Heterocycles
影响因子: 0.6
作者: [Naoki Saito, Miho Yoshino, Kornvika Charupant, Khanit Suwanborirux]
通讯作者: Khanit Suwanborirux
12
    細胞内のグアニン四重鎖を可視化するLight-up型蛍光リガンドの開発
    • 批准号:
      21K05267
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.75万
    • 财政年份:
      2021
    • 负责人:
      飯田 圭介
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    人类端粒G-quadruplex结构的植物源分子靶向聚类浓集及活性调控机理
    • 批准号:
      D25C050003
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
      邵勇
    • 依托单位:
    原癌基因c-myb启动子区G-quadruplex结构的调控及其在小儿低级别胶质瘤靶向治疗中的应用研究
    • 批准号:
      81772684
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      57.0万元
    • 批准年份:
      2017
    • 负责人:
      赵刚
    • 依托单位:
    离子调节G-Quadruplex形成过程与构型可控转化的机制研究
    • 批准号:
      21673022
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      65.0万元
    • 批准年份:
      2016
    • 负责人:
      李晓宏
    • 依托单位:
    DNA G-quadruplex折叠热力学和动力学的多尺度模拟研究
    • 批准号:
      11504043
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      20.0万元
    • 批准年份:
      2015
    • 负责人:
      边运强
    • 依托单位: