加齢に伴う遺伝子発現ノイズ増大と寿命の確率論的性質との定量的関係解明

阐明与年龄相关的基因表达噪声增加与寿命的随机性之间的定量关系

• 批准号: 21657039
• 负责人: 須田 斎
• 金额: $ 1.92万
• 依托单位: Tokai University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21657039/
• 关键词: 老化・寿命; ゆらぎ; 確率論; 遺伝子発現量; 確率論的

申請者は、生物の寿命はどのような機構に基づき発生するのか、その起源を知るために生物物理学的なアプローチを試みている。寿命という巨視的な現象は遺伝子の微視的なレベルと密接に関連していることから、「遺伝子発現量の変動」と「寿命の確率論的性質」には強い相関があることが示唆されている。そこで当該研究では、両者に関連性があるのかどうか。あるとするとどのように定量的に関連しているのか生物物理学的アプローチに基づき解明することを目的として2年間で目標を達成するように計画を立案し、以下のようにして達成したことを報告します。計画初年度(平成21年度)においては、「線虫1匹の系で遺伝子発現量の定量を可能とするプロトコルを確立すること」と「目的遺伝子の探索」にあった。そこで、まず申請時に申請した本計画を遂行する上で欠くことのできないリアルタイムPCR用のサーマルサイクラーが申請予算より減額されたため購入することができなかったため、当該申請者が所属する同機関に帰属する研究支援センターに計測を委託することによりこの困難を解決した。そして、熟練した経験を持つ研究員による強いサポートを受けることにより、比較的に迅速に線虫1匹からの遺伝子発現量の定量的方法を確立することができた。ただし、この際、参照遺伝子としてβアクチンを使用した。多くの難問は、初段における線虫1匹からのRNA抽出の効率にあった。支援センターと当研究室とは遠く離れているために、実験の分担を行い、支援センターはリアルタイムPCRの計測のみを分担し、当研究室ではRNAからcDNA化を行なうところの役割を分担して仕事に当たることにした。それに伴って、新たにサンプル作りを行なうに際して、当初予定していなかった設備を整える必要が生じた。この設備の充実に多くの時間が費やされ、その稼動のチェック再現性のために実験を繰り返し安定した実験が可能となった。その結果「遺伝子発現量の変動」の検出ならびに再現性実験を行うことができ、当初の計画通り計画2年目に目的を果たすことができたことを報告します。

Applicants should try to understand the origin and development of biological life span and mechanism. The phenomenon of macrovision of life span is closely related to the transmission of Weishi app, and the variation of transmission quantity is strongly related to the nature of life accuracy theory. When the study is conducted, the relationship between the two is discussed. The purpose of the project is to achieve the following goals: In the first year of the plan (2007 - 2008), the following topics were included: "Quantification of the amount of gene discovery in a single line of worms" and "Exploration of target genes." When applying for this project, the amount of the application is reduced. When the applicant belongs to the same organization, the calculation is entrusted. A method for the quantification of the amount of DNA detected by a rapid and comparative method was established. When you're in the middle of something, you're in the middle of something. The RNA extraction rate of the first segment of the virus is higher than that of the second segment. Support for the development of RNA in the laboratory For example, if you want to make a decision, you can make a decision. The time spent on the equipment is sufficient, and the time spent on the equipment is sufficient. The results of the survey are as follows: "The amount of transmission is changing,""the reproducibility is changing," and "the original plan is changing."

项目成果

線虫C. elegansにおける紫外線感受性株rad-8のエネルギー代謝異常

线虫紫外线敏感菌株 rad-8 的能量代谢异常 线虫

• 发表时间: 2012
• 作者: Matsuda Y;Hagio M;Naito Z;Ishiwata T.;安田佳代
• 通讯作者: 安田佳代

寿命方程式による生存曲線・死亡率曲線の線虫C. elegansでの定量的分析評価

使用寿命方程定量分析和评估线虫的生存和死亡率曲线

• 发表时间: 2009
• 作者: 須田斎;正山哲嗣;清水由佳;佐藤利哉;加藤薫;加藤薫;須田斎
• 通讯作者: 須田斎

Analyzing observed or hidden heterogeneity on survival and mortality in an isogenic C. elegans cohort.

分析等基因线虫队列中观察到的或隐藏的生存和死亡率的异质性。

• 发表时间: 2009
• 期刊: BIOPHYSICS 5
• 作者: 須田斎;正山哲嗣;清水由佳
• 通讯作者: 清水由佳

新老年学第3版、第1章4「集団レベルの老化」(pp.91-112)を執筆分担

合着《新老年学》第3版，第1章、第4章“人口层面的老龄化”（第91-112页）

• 发表时间: 2010
• 作者: 須田斎;正山哲嗣;清水由佳;佐藤利哉;加藤薫;加藤薫;須田斎;須田斎
• 通讯作者: 須田斎

Interrelationships between mitochondrial fusion, energy metabolism and oxidative stress during development in Caenorhabditis elegans.

• DOI: 10.1016/j.bbrc.2010.12.017
• 发表时间: 2011-01
• 期刊: Biochemical and biophysical research communications
• 影响因子: 3.1
• 作者: K. Yasuda;P. Hartman;Takamasa Ishii;H. Suda;A. Akatsuka;T. Shoyama;Masaki Miyazawa;N. Ishii