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効率的なモデル選択手法の開発とデータ構造発見への応用

高效模型选择方法的开发及其在数据结构发现中的应用

基本信息

批准号：
21700318
负责人：
植木優夫
金额：
$ 2.5万
依托单位：
Yamagata University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2011
项目状态：
已结题

项目摘要

SNP関連解析において現在主に用いられている検定ベースの手法を遺伝子間相互作用に用いることは、検定の多重性により過度に保守的になりうる。さらに30万から100万個のSNP全組み合わせを考慮することは計算量の爆発的増加を伴い、実行可能性も深刻な問題である。そのひとつの可能な解決策として超高次元変数選択のアプローチを採用した。具体的にはFan and Lv(2008, J. R. Statist. Soc. B)およびFan,Samworth and Wu(2009, J. Mach. Learn. Res.)により提案されたSure Independence Screening法を遺伝子間相互作用の検出用に応用し、申請者が開発した手法であるSmooth-threshold Estimating Eqation法(Ueki 2009, Biometrika)を組み合わせたアルゴリズムを設計した。実装を完了し、これによりWTCCCのSNP-GWAS疾患データを分析し、現在、結果の検討に入っている。今後はより多様なデータを分析するために機能を追加していく。例えば、欠損データへの対応、量的形質の分析、さらには環境との相互作用への拡張などを考えている。同時に、統計手法の理論的な考察を通じて、アルゴリズムの有効性の向上を目指す。特に、遺伝疫学モデルの詳細な検討を行い、GWASデータの分析に適した新たな統計手法の構築を狙う。

The SNP analysis method is now used by the client to determine the interaction between the users, and to determine the conservative levels of the multiplicity of each other. In 300000, a total of 1 million SNP users were asked to consider the number of people involved in the calculation of high-volume calculation. There are serious problems with the possibility of operation. It is possible to make a decision on the number of superelevation dimensions and select the number of dimensions. Specific examples of Fan and Lv (2008, J. R. Statist. Soc. B) registered Fan,Samworth and Wu (2009, J. Mach. Learn. Res.) It is proposed that the Sure Independence Screening method be used for the interaction between users, and the applicant should use the Smooth-threshold Estimating Eqation method (Ueki 2009, Biometrika) to organize the design of the device. After the equipment was completed, the patients with WTCCC diseases were analyzed. Now, the results showed that the patients were enrolled in the hospital. In the future, we will be able to add additional information on the basis of further analysis. Examples, lack of information, quantitative analysis, environmental interaction, environmental testing, environmental protection, environmental protection and environmental protection. At the same time, the statistical methods and theories are reviewed and reviewed, and the general purpose of the theory is to keep an upward eye on sex. Special attention should be paid to epidemiology and GWAS analysis. New statistical methods should be used.