Epistatic kinship: A new approach to estimate genetic similarity of individuals and populations
上位亲属关系:估计个体和群体遗传相似性的新方法
基本信息
- 批准号:5398402
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Grants
- 财政年份:2003
- 资助国家:德国
- 起止时间:2002-12-31 至 2005-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Der von Malécot vorgeschlagene Ansatz des Abstammungskoeffizienten (Kinship) als Wahrscheinlichkeit der Herkunftsgleichheit von Allelen soll von der Einzelgenbetrachtung auf die Betrachtung von Chromosomensegmenten ausgedehnt werden. Das resultierende Ähnlichkeitsmaß wird als "Epistatic Kinship" bezeichnet und ist von verschiedenen Faktoren wie z.B. der Crossing-Over-Aktivität und der genetischen Interferenz abhängig. Es soll ein Verfahren entwickelt werden, mit dem die "Epistatic Kinship" zwischen Individuen auf der Basis von Typisierungsergebnissen geschätzt werden kannn. Die mittlere "Epistatic Kinship" kann als Distanzmaß zwischen Populationen verwendet werden, wobei durch die Wahl der Segmentlänge eine deutlich bessere zeitliche Auflösung als mit den gängigen mutations- und driftbasierten Distanzmaßen erreicht werden kann. Dies kann insbesondere für phylogentische Studien zur Differenzierung von Rassen oder Subpopulationen innerhalb von Nutztierarten von Vorteil sein. Die entwickelten Methoden sollen zunächst anhand von simulierten Daten validiert werden. Parallel sollen für sechs porcine Chromosomenregionen unterschiedlicher Länge informative Sets von Single Nucleotide Polymorphism (SNP)-Markern entwickelt werden. Auf Grundlage der Typisierungsergebnisse für diese SNP-Sets soll die Methode exemplarisch für die individuelle und phylogenetische Analyse der drei Teilpopulationen des Göttinger Minischweins praktisch genutzt werden.
他说:“这是我的亲人关系,也是他们的亲属关系。Das Resultierende hnlichkeitsmaüwird Wird“上位亲属关系”是von verschiedenen Faktoren Wie z.B.der Crossing-over-Aktiität der der Genetischen Interferenz ABHängig.这是一种“上位亲属关系”,即“上位亲属关系”。上位性亲缘关系是指人口的上位性亲缘关系,是一种特殊的亲缘关系,也是一种特殊的亲缘关系,这种亲缘关系并不存在。在此基础上,我们将研究不同的植物,并将其分为两个亚种。这是一种有效的方法,它是一种模拟。猪染色体非配对标记L信息性集合von单核苷酸多态(SNP)-Markern entwickelt。用典型个体和系统发育分析的方法分析了Göttinger Minischweins Prktisch Genutzt。
项目成果
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