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Entwicklung und Erprobung eines neuen Ansatzes zur Schätzung der effektiven Populationsgröße auf der Basis der Homozygotie von Chromosomensegmenten

开发和测试一种基于染色体片段纯合性估计有效群体大小的新方法

基本信息

批准号：
26068496
负责人：
Professor Dr. Henner Simianer
金额：
--
依托单位：
Institut für Nutztiergenetik
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2006
资助国家：
德国
起止时间：
2005-12-31 至 2009-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/26068496?language=en
关键词：
Entwicklung und Erprobung eines neuen

项目摘要

Die effektive Populationsgröße ist ein zentraler, aber schwierig zu schätzender Parameter der Populationsgenetik. In geschlossenen Populationen strebt die Homozygotierate von Chromosomensegmenten einem asymptotischen Gleichgewichtswert zu, der funktional von der Länge des Chromosomensegments und von der effektiven Populationsgröße abhängig ist. Dieser Zusammenhang soll genutzt werden, um aus der beobachteten Homozygotiefrequenz für Segmente bekannter Länge die effektive Populationsgröße zu schätzen. Nach der theoretischen Ausarbeitung des Schätzverfahrens und der analytischen Untersuchung der Eigenschaften des vorgeschlagenen Schätzers soll dieser sowohl an simulierten als auch an realen Daten erprobt werden. Hierzu stehen zwei experimentelle und zwei kommerzielle Hühnerlinien zur Verfügung. Für diese soll für jeweils eine historische (aus den Jahren 1998/99) und eine aktuelle Stichprobe ein Set von 8 Chromosomensegmenten ä 6 Mikrosatellitenmarker typisiert werden, An diesen Daten werden alle beschriebenen Verfahren zur Schätzung der effektiven Populationsgröße einschließlich des vorgeschlagenen neuen Verfahrens genutzt und die Ergebnisse gegenübergestellt. Die Studie soll dazu beitragen, robuste markergestützte Verfahren zur Schätzung der effektiven Populationsgröße aus Ein-Generationen-Stichproben zu entwickeln.

有效的人口增长是一个中心，但人口遗传学的参数很小。在geschlossenenPopulationen strebt die Homozymeerate von Chromosomensegmenten einem asymptotischen Gleichgewichtswert zu，der functional von der Länge des Chromosomensegments und von der effektiven Populationsgröße abhängig ist.这是一个韦尔登的方法，它通过对人口的有效增长进行细分来获得人口的均匀性。在对Schätzverfahrens的理论分析和对Schätzers的特征分析之后，我们可以看到这种模拟也是一种真实的数据错误韦尔登。Hierzu stehen zwei experimentelle und zwei kommerzielle Hühnerlinien zur Verfügung. Für diese soll für jeweils eine historische（aus den Jahren 1998/99）and eine aktuelle Stichprobe ein Set von 8 Chromosomensegmenten ä 6 Mikrosatellitenmarker typisiert韦尔登，An diesen Daten韦尔登alle beschriebenen Verfahren zur Schätzung der effektiven Populationsgröße einschließlich des vorgeschagenen neuen Verfahrens genutzt and die Ergebnisse gegenübergestellt.该研究将使人口增长的有效性从一代人标准中得到保证。