Entwicklung und Erprobung eines neuen Ansatzes zur Schätzung der effektiven Populationsgröße auf der Basis der Homozygotie von Chromosomensegmenten

开发和测试一种基于染色体片段纯合性估计有效群体大小的新方法

基本信息

批准号：
26068496
负责人：
Professor Dr. Henner Simianer
金额：
--
依托单位：
Institut für Nutztiergenetik
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2006
资助国家：
德国
起止时间：
2005-12-31 至 2009-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/26068496?language=en
关键词：
Entwicklung und Erprobung eines neuen

项目摘要

Die effektive Populationsgröße ist ein zentraler, aber schwierig zu schätzender Parameter der Populationsgenetik. In geschlossenen Populationen strebt die Homozygotierate von Chromosomensegmenten einem asymptotischen Gleichgewichtswert zu, der funktional von der Länge des Chromosomensegments und von der effektiven Populationsgröße abhängig ist. Dieser Zusammenhang soll genutzt werden, um aus der beobachteten Homozygotiefrequenz für Segmente bekannter Länge die effektive Populationsgröße zu schätzen. Nach der theoretischen Ausarbeitung des Schätzverfahrens und der analytischen Untersuchung der Eigenschaften des vorgeschlagenen Schätzers soll dieser sowohl an simulierten als auch an realen Daten erprobt werden. Hierzu stehen zwei experimentelle und zwei kommerzielle Hühnerlinien zur Verfügung. Für diese soll für jeweils eine historische (aus den Jahren 1998/99) und eine aktuelle Stichprobe ein Set von 8 Chromosomensegmenten ä 6 Mikrosatellitenmarker typisiert werden, An diesen Daten werden alle beschriebenen Verfahren zur Schätzung der effektiven Populationsgröße einschließlich des vorgeschlagenen neuen Verfahrens genutzt und die Ergebnisse gegenübergestellt. Die Studie soll dazu beitragen, robuste markergestützte Verfahren zur Schätzung der effektiven Populationsgröße aus Ein-Generationen-Stichproben zu entwickeln.

Die effektivesuplationsgrößeISTein Zentraler，Aber SchwierigZuSchätzender参数der popersentGenetik。在geschlossenen人群中，Strebt死亡纯合子von Chromosomensensensenemensemensenemensementen einem渐变性gleichgewichtswert Zu，der funktional vonderLängeDesChromosomensegments und von der effektiven von derefektiven vendiven derefektiven visiven ventenventermensemensegrößebmengigabhängigigist。 Dieser Zusammenhang Soll genutzt Werden，Um Aus der beobachtetenhomozygotiefrequenzfür节段bekannter bekannterlängedie effektive effektivesupluctiongrößeZussuschätzen。 nach der theoretischen ausarbeitung desschätzverfahrens和der Analytischen untersuchung eigenschaften desvorgeschlagenenschätzerssollagenensoll dieser sowohl sowohl sowohl a simulierten als als als als als auch an realen ane realen ane realen daten erprobt werdan erprobt werden。 Hierzu Stehen Zwei Experimentelle和ZweiKommerzielleHühnerlinienZurVerfügung。 Für是最新的，最近的时代是世界上最好的。人口界的最新人口，包括Verfahrens世界中的最新（Aus den Jahren 1998/99），人口省Größe吉祥对Ein-Generation-generation-Stich-Stich探测。