Development of a new strategy for protein design based on a systematic mutant database

基于系统突变体数据库开发蛋白质设计新策略

• 批准号: 22760616
• 负责人: YOKOTA Akiko
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22760616/
• 关键词: 蛋白質; 酵素; 機能改変; 変異解析

We have aimed to establish a useful and reliable new method for protein engineering through acquirement of empirical rules towards rational design and development of a scheme based on directed evolution, by using a comprehensive mutant database of dihydrofolate reductase(DHFR) as a model protein. Piecing out and improving the database, we obtained the more precise data about relationship between the amino acid sequence and protein characteristic parameters, which would supply newly desirable information for protein design.

我们以二氢叶酸还原酶(DHFR)的突变数据库为模型蛋白，通过获取合理设计经验规则，开发基于定向进化的方案，建立了一种实用可靠的蛋白质工程新方法。对数据库进行拼接和完善，得到了更准确的氨基酸序列与蛋白质特征参数之间的关系数据，为蛋白质设计提供了新的可取信息。

项目成果

配列摂動解析によるジヒドロ葉酸還元酵素における保存部位の役割の解明

通过序列扰动分析阐明二氢叶酸还原酶保守位点的作用

• 发表时间: 2012
• 作者: 山崎智彦;西田有紀;谷口彰良;生駒俊之;横田亜紀子
• 通讯作者: 横田亜紀子

配列摂動解析:ジヒドロ葉酸還元酵素の保存部位に関する考察

序列扰动分析：考虑二氢叶酸还原酶的保守位点

• 发表时间: 2012
• 作者: 山崎智彦;西田有紀;谷口彰良;生駒俊之;横田亜紀子;横田亜紀子
• 通讯作者: 横田亜紀子